19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1410 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1410  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  488  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414925  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1536  hypothetical protein  76.07 
 
 		 234 aa  397  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0780813  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1504  hypothetical protein  75.86 
 
 		 234 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000129155  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0955  hypothetical protein  68.8 
 
 		 251 aa  340  9e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.486617 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1277  hypothetical protein  66.24 
 
 		 234 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00102442  normal  0.493523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1000  hypothetical protein  61.54 
 
 		 239 aa  317  1e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.621877  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  29.31 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.028666 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2742  hypothetical protein  28.76 
 
 		 231 aa  97.1  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.681774  normal  0.420065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1213  putative lipase  28.07 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.137275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2900  putative lipase  26.91 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0286742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1214  putative lipase  28.07 
 
 		 227 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.132802 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15641  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.16 
 
 		 236 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.74385 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43573  predicted protein  26.91 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.021277  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04171  hypothetical protein  23.74 
 
 		 197 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0117581  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_28582  predicted protein  24.71 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.614483  hitchhiker  0.000000143013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0954  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.11 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45579  predicted protein  28.22 
 
 		 366 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34949  predicted protein  25.15 
 
 		 318 aa  45.4  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1512  poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class III, PhaC subunit  26.62 
 
 		 356 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.117815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>