More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1407 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1407  phosphomethylpyrimidine kinase  100 
 
 		 267 aa  543  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1501  phosphomethylpyrimidine kinase  61.57 
 
 		 271 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1533  phosphomethylpyrimidine kinase  55.6 
 
 		 271 aa  278  9e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.847174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0817  phosphomethylpyrimidine kinase  57.3 
 
 		 275 aa  272  3e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.237614  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0957  phosphomethylpyrimidine kinase  56.11 
 
 		 269 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.297451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1281  phosphomethylpyrimidine kinase  53.76 
 
 		 273 aa  257  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0223947  normal  0.790704 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1004  phosphomethylpyrimidine kinase  54.65 
 
 		 275 aa  243  3e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2331  phosphomethylpyrimidine kinase  52.08 
 
 		 288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1176  phosphomethylpyrimidine kinase  48.68 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.82174  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4934  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 268 aa  231  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.566917  normal  0.666851 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6681  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 		 269 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.432529 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0853  phosphomethylpyrimidine kinase  48.51 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.114242  normal  0.0282488 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0997  phosphomethylpyrimidine kinase  48.51 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00609101  normal  0.106083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4470  phosphomethylpyrimidine kinase  48.11 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.668119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3496  phosphomethylpyrimidine kinase  50.93 
 
 		 268 aa  228  9e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.828772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4984  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 		 268 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.702252  normal  0.243702 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1082  phosphomethylpyrimidine kinase  47.74 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.457786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2522  phosphomethylpyrimidine kinase  49.04 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2470  phosphomethylpyrimidine kinase  51.7 
 
 		 280 aa  223  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.176006  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0125  phosphomethylpyrimidine kinase  47.73 
 
 		 285 aa  222  6e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0918  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 		 269 aa  221  8e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1935  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 283 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03000  hydroxymethylpyrimidine kinase/phosphomethylpyrimidine kinase  44.57 
 
 		 265 aa  219  5e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1443  phosphomethylpyrimidine kinase  49.44 
 
 		 269 aa  218  6e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.600581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2435  phosphomethylpyrimidine kinase  50.57 
 
 		 285 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1554  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1787  phosphomethylpyrimidine kinase  50.38 
 
 		 308 aa  217  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1135  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.878652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1544  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0961  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2391  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2239  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  217  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3082  phosphomethylpyrimidine kinase  42.32 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.190737 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02031  phosphomethylpyrimidine kinase  41.95 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0928  phosphomethylpyrimidine kinase  51.67 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0346056  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01995  hypothetical protein  41.95 
 
 		 266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3018  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 		 270 aa  215  5e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5777  phosphomethylpyrimidine kinase  44.32 
 
 		 277 aa  215  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.269735  normal  0.0629461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1992  phosphomethylpyrimidine kinase  46.04 
 
 		 270 aa  214  8e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0372  phosphomethylpyrimidine kinase  45.35 
 
 		 285 aa  214  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.591258  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2250  phosphomethylpyrimidine kinase  45.45 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.660572  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0071  phosphomethylpyrimidine kinase  45.86 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2333  phosphomethylpyrimidine kinase  44.19 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1338  phosphomethylpyrimidine kinase  47.15 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00019728  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2710  phosphomethylpyrimidine kinase  41.95 
 
 		 266 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.227545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5600  hydroxy-methylpyrimidine kinase /hydroxy-phosphomethylpyrimidine kinase  45.69 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.429432  normal  0.105983 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3167  phosphomethylpyrimidine kinase  48.51 
 
 		 263 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.17923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4453  phosphomethylpyrimidine kinase  47.51 
 
 		 270 aa  212  5.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.800707  normal  0.352817 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2979  phosphomethylpyrimidine kinase  43.28 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1301  phosphomethylpyrimidine kinase  43.49 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.185406  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2378  phosphomethylpyrimidine kinase  43.45 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.305846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1545  phosphomethylpyrimidine kinase  46.77 
 
 		 264 aa  208  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.104036  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2382  phosphomethylpyrimidine kinase  43.82 
 
 		 266 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.779831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2490  phosphomethylpyrimidine kinase  43.45 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4315  phosphomethylpyrimidine kinase  48.48 
 
 		 297 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2289  phosphomethylpyrimidine kinase  43.45 
 
 		 266 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.426705  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0828  phosphomethylpyrimidine kinase  43.98 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.192548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0368  phosphomethylpyrimidine kinase  46.24 
 
 		 282 aa  205  7e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2711  phosphomethylpyrimidine kinase  43.91 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1102  phosphomethylpyrimidine kinase  44.07 
 
 		 271 aa  204  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0215379  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1153  phosphomethylpyrimidine kinase  43.77 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0935315  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3091  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 		 266 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0488797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0285  phosphomethylpyrimidine kinase  46.59 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2517  phosphomethylpyrimidine kinase  46.72 
 
 		 260 aa  202  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1310  phosphomethylpyrimidine kinase  46.97 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1203  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.564031  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1321  phosphomethylpyrimidine kinase  41.57 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0706  phosphomethylpyrimidine kinase  46.01 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0649  phosphomethylpyrimidine kinase  41.44 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0890915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0209  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 		 304 aa  199  3e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.606568  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3463  phosphomethylpyrimidine kinase  44.16 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2399  phosphomethylpyrimidine kinase  49.81 
 
 		 287 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.943735  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1236  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 		 269 aa  198  6e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.252768 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  47.92 
 
 		 264 aa  198  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3577  phosphomethylpyrimidine kinase  41.2 
 
 		 266 aa  198  6e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.385467 
 
 
-
 
NC_004310  BR0218  phosphomethylpyrimidine kinase  45.8 
 
 		 291 aa  198  7e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.940459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1628  phosphomethylpyrimidine kinase  43.61 
 
 		 266 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.522982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0134  phosphomethylpyrimidine kinase  46.56 
 
 		 271 aa  198  7e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3067  phosphomethylpyrimidine kinase  49.06 
 
 		 299 aa  198  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.119732  normal  0.199028 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1265  phosphomethylpyrimidine kinase  45.1 
 
 		 267 aa  198  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3133  phosphomethylpyrimidine kinase  40.96 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0585  phosphomethylpyrimidine kinase  44.79 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.339166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1397  phosphomethylpyrimidine kinase  45.04 
 
 		 265 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000385147  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1670  phosphomethylpyrimidine kinase  48.88 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1709  phosphomethylpyrimidine kinase  46.75 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2061  phosphomethylpyrimidine kinase  44.7 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0150754  normal  0.0985623 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3294  phosphomethylpyrimidine kinase  49.05 
 
 		 293 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3649  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  46.36 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5350  phosphomethylpyrimidine kinase  48.3 
 
 		 269 aa  195  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.120967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4962  phosphomethylpyrimidine kinase  44.06 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.996636  normal  0.0189851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2060  phosphomethylpyrimidine kinase  47.55 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.373143 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0361  phosphomethylpyrimidine kinase  42.8 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000143367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0366  phosphomethylpyrimidine kinase  43.68 
 
 		 266 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.437548 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  47.49 
 
 		 490 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09330  phosphomethylpyrimidine kinase  44.49 
 
 		 264 aa  193  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.387333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0605  phosphomethylpyrimidine kinase  40.96 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0042  phosphomethylpyrimidine kinase  44.44 
 
 		 284 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0834315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0647  phosphomethylpyrimidine kinase  45.77 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.988766  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6036  phosphomethylpyrimidine kinase type-2  47.17 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190496  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2041  phosphomethylpyrimidine kinase  47.17 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>