16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1366 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  978    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  51.23 
 
 
492 aa  477  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000354045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  46.06 
 
 
484 aa  464  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  46.14 
 
 
495 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  40.88 
 
 
488 aa  398  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  23.13 
 
 
464 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  21.98 
 
 
455 aa  97.4  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  21.99 
 
 
487 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  20.68 
 
 
454 aa  89  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  20 
 
 
483 aa  83.2  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  22.56 
 
 
446 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  21.24 
 
 
468 aa  58.5  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  18.48 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  21.27 
 
 
444 aa  57.4  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  20.79 
 
 
489 aa  57.4  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  18.54 
 
 
428 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>