48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1361 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  100 
 
 		 172 aa  349  8.999999999999999e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  77.78 
 
 		 165 aa  261  3e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  61.35 
 
 		 167 aa  200  9e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  49.39 
 
 		 146 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  37.09 
 
 		 153 aa  101  4e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  38.32 
 
 		 157 aa  99  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  35.85 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  35.36 
 
 		 178 aa  94.7  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  34.42 
 
 		 158 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  36.24 
 
 		 155 aa  87.8  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  32.16 
 
 		 175 aa  84.3  8e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  32.16 
 
 		 180 aa  84.3  8e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  34.23 
 
 		 155 aa  82  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  28.17 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  28.17 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1171  membrane-flanked domain-containing protein  28.38 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  26.81 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  26.35 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  26.01 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  25.16 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  25.16 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  28.92 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  25.16 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  26.14 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  27.07 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  24.12 
 
 		 227 aa  52.4  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  24.2 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  31.06 
 
 		 252 aa  52  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 		 126 aa  51.6  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  23.7 
 
 		 170 aa  50.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  24.06 
 
 		 479 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  25.48 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  25.76 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  27.68 
 
 		 198 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  25.77 
 
 		 245 aa  48.5  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  25.95 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  25.32 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  25.74 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  22.14 
 
 		 186 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0446  membrane-flanked domain  32.26 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000176229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  23.64 
 
 		 170 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  25.19 
 
 		 189 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  25.93 
 
 		 247 aa  41.6  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  28.17 
 
 		 173 aa  41.6  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  27.86 
 
 		 243 aa  41.2  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  24.03 
 
 		 174 aa  41.2  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  29.87 
 
 		 127 aa  40.8  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>