More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1330 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  100 
 
 
853 aa  1782  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  85.11 
 
 
853 aa  1506  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  86.42 
 
 
848 aa  1543  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  34.88 
 
 
851 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  35.79 
 
 
858 aa  475  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  35.93 
 
 
862 aa  473  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  34.7 
 
 
853 aa  472  1e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00664e-06 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  34.49 
 
 
849 aa  466  1e-130  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  33.73 
 
 
848 aa  468  1e-130  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  34.26 
 
 
855 aa  468  1e-130  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  33.72 
 
 
855 aa  466  1e-130  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2129  aminopeptidase G  34.46 
 
 
876 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133552  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  33.68 
 
 
849 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  33.22 
 
 
862 aa  459  1e-127  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  34.38 
 
 
861 aa  457  1e-127  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  33.76 
 
 
867 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  33.76 
 
 
867 aa  458  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  33.76 
 
 
867 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  34.88 
 
 
853 aa  456  1e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  33.06 
 
 
852 aa  456  1e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  32.56 
 
 
889 aa  447  1e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  33.83 
 
 
869 aa  447  1e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  33.72 
 
 
862 aa  447  1e-124  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  33.1 
 
 
846 aa  447  1e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  34.18 
 
 
854 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  32.32 
 
 
850 aa  443  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1880  aminopeptidase N  34.62 
 
 
874 aa  446  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0164178 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  31.87 
 
 
887 aa  441  1e-122  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  33.33 
 
 
850 aa  442  1e-122  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  33.37 
 
 
860 aa  433  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1381  aminopeptidase N  31.68 
 
 
863 aa  433  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  33.6 
 
 
856 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  33.45 
 
 
868 aa  431  1e-119  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  34.34 
 
 
853 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  32.64 
 
 
858 aa  432  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  1.85174e-05 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  32.92 
 
 
853 aa  426  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  31.97 
 
 
889 aa  426  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  32.91 
 
 
861 aa  429  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  34.39 
 
 
887 aa  429  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  34.43 
 
 
882 aa  425  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  30.62 
 
 
906 aa  423  1e-117  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  31.48 
 
 
877 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  31.48 
 
 
918 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  31.48 
 
 
877 aa  422  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  32.33 
 
 
848 aa  418  1e-115  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  31.24 
 
 
877 aa  418  1e-115  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1149  membrane alanyl aminopeptidase  31.82 
 
 
871 aa  413  1e-114  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  33.56 
 
 
865 aa  415  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  31.73 
 
 
851 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  31.13 
 
 
877 aa  415  1e-114  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1371  aminopeptidase N  33.56 
 
 
868 aa  414  1e-114  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.875513  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  32.69 
 
 
875 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0949  aminopeptidase N  31.16 
 
 
869 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  32.01 
 
 
879 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  31.04 
 
 
877 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  29.93 
 
 
848 aa  409  1e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  32.17 
 
 
882 aa  404  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  30.08 
 
 
877 aa  400  1e-110  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  30.2 
 
 
877 aa  402  1e-110  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  30.31 
 
 
877 aa  401  1e-110  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3475  aminopeptidase N  31.75 
 
 
837 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.60984  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.18 
 
 
878 aa  388  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24070  aminopeptidase N  30.69 
 
 
892 aa  388  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  31.87 
 
 
838 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  31.96 
 
 
857 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0968  aminopeptidase N  31.89 
 
 
878 aa  370  1e-101  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  31.61 
 
 
842 aa  367  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  4.02596e-05 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2138  aminopeptidase N  30.63 
 
 
834 aa  350  6e-95  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  29.59 
 
 
823 aa  330  5e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  29.68 
 
 
807 aa  280  8e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.06 
 
 
869 aa  245  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0835  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25.95 
 
 
882 aa  241  4e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.91 
 
 
854 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.07 
 
 
853 aa  225  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.3 
 
 
835 aa  222  2e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.46 
 
 
857 aa  220  8e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.94 
 
 
859 aa  220  9e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.85 
 
 
859 aa  217  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.8 
 
 
778 aa  216  2e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.99 
 
 
859 aa  209  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.19 
 
 
830 aa  203  1e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.37 
 
 
784 aa  199  2e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31 
 
 
785 aa  198  4e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  32.81 
 
 
863 aa  197  7e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30.6 
 
 
858 aa  193  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.77 
 
 
852 aa  192  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01638  hypothetical protein similar to aminopeptidase (Broad)  27.65 
 
 
883 aa  191  6e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  31.94 
 
 
881 aa  190  1e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2167  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.82 
 
 
882 aa  189  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.89 
 
 
886 aa  186  1e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  26.98 
 
 
905 aa  186  1e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  30.07 
 
 
844 aa  186  2e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5674  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.11 
 
 
913 aa  185  4e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0620443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6491  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.97 
 
 
929 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.61 
 
 
877 aa  183  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  30.2 
 
 
932 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  29.44 
 
 
844 aa  181  4e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0962  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  24.4 
 
 
871 aa  181  5e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  32.58 
 
 
895 aa  180  8e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3198  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.03 
 
 
932 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.747524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>