153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1324 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6176  putative phosphoketolase  64.45 
 
 		 832 aa  1075    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1822  putative phosphoketolase  68.45 
 
 		 796 aa  1140    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1587  putative phosphoketolase  60.56 
 
 		 811 aa  1022    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1799  putative phosphoketolase  48.15 
 
 		 792 aa  771    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0441648  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0385  putative phosphoketolase  68.07 
 
 		 789 aa  1144    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.990323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3542  putative phosphoketolase  40.75 
 
 		 788 aa  639    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1670  xylulose-5-phosphate/fructose-6-phosphate phosphoketolase  56.3 
 
 		 835 aa  942    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.924354  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00070  phosphoketolase, putative  55.75 
 
 		 834 aa  953    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03100  phosphoketolase, putative  40.9 
 
 		 851 aa  637    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51187  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2063  putative phosphoketolase  72.75 
 
 		 788 aa  1194    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2970  putative phosphoketolase  65.49 
 
 		 792 aa  1081    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.319467  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2826  putative phosphoketolase  70.47 
 
 		 783 aa  1151    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0035882  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0831  putative phosphoketolase  69.94 
 
 		 812 aa  1154    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.124547  normal  0.616937 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1283  putative phosphoketolase  71.08 
 
 		 811 aa  1173    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.260899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1947  putative phosphoketolase  66.37 
 
 		 795 aa  1107    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0496  putative phosphoketolase  74.68 
 
 		 793 aa  1260    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.227875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3782  putative phosphoketolase  62.06 
 
 		 802 aa  1063    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.478109 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2717  putative phosphoketolase  74.74 
 
 		 804 aa  1252    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1522  putative phosphoketolase  78.27 
 
 		 809 aa  1305    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2080  putative phosphoketolase  62.9 
 
 		 796 aa  1053    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0993  putative phosphoketolase  73.01 
 
 		 807 aa  1225    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  60.05 
 
 		 1228 aa  997    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3546  putative phosphoketolase  70.96 
 
 		 802 aa  1154    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.252555  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3858  putative phosphoketolase  69.18 
 
 		 784 aa  1107    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3807  putative phosphoketolase  67.43 
 
 		 784 aa  1106    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0893  putative phosphoketolase  64.45 
 
 		 791 aa  1070    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.45622 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1037  putative phosphoketolase  64.45 
 
 		 791 aa  1070    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1345  putative phosphoketolase  59.87 
 
 		 797 aa  1006    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29823  normal  0.0175244 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2731  putative phosphoketolase  41.53 
 
 		 788 aa  644    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.127201  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1492  putative phosphoketolase  68.54 
 
 		 784 aa  1112    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4367  putative phosphoketolase  69.42 
 
 		 793 aa  1176    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1896  putative phosphoketolase  69.03 
 
 		 802 aa  1158    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2793  putative phosphoketolase  68.97 
 
 		 806 aa  1144    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.99336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2236  putative phosphoketolase  68.93 
 
 		 800 aa  1134    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8717  putative phosphoketolase  64.19 
 
 		 833 aa  1075    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0362  putative phosphoketolase  56.6 
 
 		 792 aa  915    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2965  putative phosphoketolase  40.88 
 
 		 788 aa  639    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.79462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3047  putative phosphoketolase  40.88 
 
 		 788 aa  639    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.138192  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2898  putative phosphoketolase  41.32 
 
 		 788 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3180  putative phosphoketolase  68.49 
 
 		 794 aa  1148    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.822424  normal  0.179179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2009  putative phosphoketolase  64.99 
 
 		 821 aa  1096    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.476426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1183  putative phosphoketolase  48.74 
 
 		 794 aa  768    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.837402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1812  putative phosphoketolase  45.79 
 
 		 817 aa  715    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0562  putative phosphoketolase  48.43 
 
 		 818 aa  786    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000340609 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1456  putative phosphoketolase  48.34 
 
 		 788 aa  768    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1961  putative phosphoketolase  45.31 
 
 		 813 aa  699    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0143  putative phosphoketolase  63.29 
 
 		 811 aa  1055    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3145  putative phosphoketolase  40.5 
 
 		 788 aa  637    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.511831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0521  putative phosphoketolase  67.26 
 
 		 797 aa  1118    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.544074 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3620  putative phosphoketolase  69.14 
 
 		 798 aa  1144    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3047  putative phosphoketolase  66.5 
 
 		 824 aa  1128    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2837  putative phosphoketolase  68.97 
 
 		 806 aa  1144    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.902964 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3069  putative phosphoketolase  65.95 
 
 		 832 aa  1103    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.665044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1849  putative phosphoketolase  59.67 
 
 		 813 aa  1031    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4497  putative phosphoketolase  66.29 
 
 		 790 aa  1107    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2053  putative phosphoketolase  58.53 
 
 		 815 aa  980    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1677  putative phosphoketolase  62.47 
 
 		 802 aa  1076    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6198  putative phosphoketolase  69.32 
 
 		 800 aa  1164    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.692341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2820  putative phosphoketolase  68.84 
 
 		 806 aa  1144    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1091  putative phosphoketolase  41.03 
 
 		 788 aa  646    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00166256  normal  0.0504216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3341  putative phosphoketolase  66.17 
 
 		 823 aa  1121    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0136973 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1582  putative phosphoketolase  68.69 
 
 		 800 aa  1144    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.240934  normal  0.774313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3471  putative phosphoketolase  68.36 
 
 		 794 aa  1148    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.992442 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  60.05 
 
 		 1230 aa  999    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3376  putative phosphoketolase  56.8 
 
 		 820 aa  944    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2340  putative phosphoketolase  68.06 
 
 		 805 aa  1152    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.329763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0333  putative phosphoketolase  67.94 
 
 		 792 aa  1142    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2459  putative phosphoketolase  62.07 
 
 		 791 aa  1026    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.203497  normal  0.834465 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1686  putative phosphoketolase  47.24 
 
 		 803 aa  781    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2995  putative phosphoketolase  70.93 
 
 		 790 aa  1183    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1950  putative phosphoketolase  67.13 
 
 		 797 aa  1128    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0303  putative phosphoketolase  61.85 
 
 		 820 aa  1035    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1918  putative phosphoketolase  66.97 
 
 		 789 aa  1128    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943189  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4654  putative phosphoketolase  66.88 
 
 		 795 aa  1127    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251699  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  62.04 
 
 		 1305 aa  1020    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0502  putative phosphoketolase  67.34 
 
 		 811 aa  1117    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1186  putative phosphoketolase  41.15 
 
 		 788 aa  643    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1076  putative phosphoketolase  41.15 
 
 		 788 aa  638    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1196  putative phosphoketolase  70.67 
 
 		 802 aa  1154    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6931  putative phosphoketolase  55.91 
 
 		 811 aa  888    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1533  putative phosphoketolase  69.07 
 
 		 800 aa  1144    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3368  putative phosphoketolase  49.43 
 
 		 782 aa  764    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0040  putative phosphoketolase  71.08 
 
 		 811 aa  1174    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0567  putative phosphoketolase  67.22 
 
 		 811 aa  1116    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0423  putative phosphoketolase  65.53 
 
 		 851 aa  1088    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2611  putative phosphoketolase  66.11 
 
 		 860 aa  1102    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3572  putative phosphoketolase  64.96 
 
 		 832 aa  1066    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.928145  normal  0.201424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2204  putative phosphoketolase  69.44 
 
 		 795 aa  1144    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.221992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5497  putative phosphoketolase  60.23 
 
 		 794 aa  1013    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5273  putative phosphoketolase  60.1 
 
 		 797 aa  1021    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.425435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0538  putative phosphoketolase  67.22 
 
 		 811 aa  1115    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1324  putative phosphoketolase  100 
 
 		 791 aa  1643    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.971397  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0701  putative phosphoketolase  51.32 
 
 		 825 aa  840    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1869  putative phosphoketolase  69.34 
 
 		 783 aa  1150    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf448  putative phosphoketolase  49.43 
 
 		 793 aa  817    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1620  putative phosphoketolase  80.72 
 
 		 798 aa  1358    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1914  putative phosphoketolase  79.18 
 
 		 795 aa  1334    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.457834  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  60.18 
 
 		 1230 aa  1001    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36257  phosphoketolase  56.77 
 
 		 835 aa  928    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1712  putative phosphoketolase  58.53 
 
 		 815 aa  980    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.531952  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>