More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1292 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
495 aa  1010  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.6 
 
 
500 aa  516  1e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463081  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  51.05 
 
 
500 aa  475  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1213  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.21 
 
 
472 aa  425  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.55 
 
 
478 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  9.46283e-07  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2879  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.09 
 
 
466 aa  322  9e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.295143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
470 aa  236  8e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  31.35 
 
 
469 aa  218  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
469 aa  214  3e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.08474e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  37.86 
 
 
477 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  30.39 
 
 
466 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  27.1 
 
 
461 aa  190  6e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
452 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
459 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  7.62888e-06  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  34.85 
 
 
469 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  28.78 
 
 
471 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
484 aa  182  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.3178 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0316  histidine kinase  34.77 
 
 
469 aa  182  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
477 aa  181  3e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
469 aa  179  8e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  30.95 
 
 
497 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  34.03 
 
 
475 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
489 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.13 
 
 
466 aa  177  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  32.6 
 
 
448 aa  176  9e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5223  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
486 aa  175  2e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1390  heavy metal sensor signal transduction histidine kinases (STHK)  34.51 
 
 
486 aa  175  2e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171617  normal  0.0652921 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  32.34 
 
 
448 aa  174  3e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
438 aa  171  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0709  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
481 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56898  normal  0.745793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 
504 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 
509 aa  169  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1498  heavy metal sensor kinase  35.87 
 
 
459 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  32.41 
 
 
490 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  2.98579e-06  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
447 aa  168  3e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
477 aa  167  3e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  32.97 
 
 
464 aa  167  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4752  histidine kinase  35.61 
 
 
454 aa  167  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3000  sensor histidine kinase  27.31 
 
 
457 aa  166  1e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0616683  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
406 aa  166  1e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0760  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
474 aa  166  1e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113675  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
474 aa  165  1e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3230  sensor histidine kinase  27.31 
 
 
457 aa  166  1e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
524 aa  164  2e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
350 aa  165  2e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  27.74 
 
 
468 aa  165  2e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
468 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0030  sensor histidine kinase  32.89 
 
 
472 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  5.76677e-06 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 
466 aa  164  4e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.1534e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
472 aa  164  5e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293183  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
474 aa  164  5e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0044  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
472 aa  164  5e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000181227 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.23 
 
 
474 aa  164  5e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0047  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 
472 aa  164  5e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0750608  normal  0.18051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
455 aa  163  6e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
469 aa  163  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.845609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2945  histidine kinase  26.53 
 
 
457 aa  163  6e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0517153  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  30 
 
 
486 aa  163  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  30 
 
 
468 aa  163  7e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
471 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 
462 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
463 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  8.87504e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
469 aa  162  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
474 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3348  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
471 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4799  heavy metal sensor kinase  32.99 
 
 
463 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0702  histidine kinase  37.84 
 
 
523 aa  161  3e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
484 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3222  sensor histidine kinase  30.91 
 
 
436 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  32.24 
 
 
592 aa  160  6e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3236  sensor histidine kinase  33.56 
 
 
436 aa  159  7e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  38.67 
 
 
587 aa  159  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.10325e-07 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  38.67 
 
 
587 aa  159  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2491  histidine kinase  25.95 
 
 
472 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.147009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3427  sensor kinase CusS  29.68 
 
 
491 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0257  sensor kinase CusS  29.68 
 
 
491 aa  159  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4295  sensor kinase CusS  29.68 
 
 
491 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00378559  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  38.22 
 
 
587 aa  158  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
471 aa  158  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2235  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
458 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00733846  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.22 
 
 
587 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3963  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 
487 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0379  heavy metal sensor histidine kinase  32.73 
 
 
463 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0736  histidine kinase  30.98 
 
 
508 aa  157  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  37.78 
 
 
587 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.79 
 
 
465 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2032  sensor histidine kinase  30.3 
 
 
436 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0866754  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  36.03 
 
 
438 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  36.03 
 
 
438 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  36.03 
 
 
438 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  36.03 
 
 
438 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  36.03 
 
 
438 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  36.03 
 
 
438 aa  157  5e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  36.03 
 
 
438 aa  157  5e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.02 
 
 
458 aa  157  5e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.02 
 
 
458 aa  157  5e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  27.87 
 
 
478 aa  157  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  37.78 
 
 
587 aa  156  7e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2676  two-component sensor histidine kinase  25.97 
 
 
471 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0470919  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  37.78 
 
 
587 aa  156  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>