60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1280 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 397 aa  793    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  42.04 
 
 		 400 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  40.3 
 
 		 400 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  40.45 
 
 		 399 aa  291  2e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  41.15 
 
 		 400 aa  288  2e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  34.34 
 
 		 381 aa  262  6e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  38.9 
 
 		 400 aa  258  9e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  37 
 
 		 399 aa  256  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  36.75 
 
 		 399 aa  255  8e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  36.27 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  35.73 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  35.73 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  35.73 
 
 		 401 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  35.71 
 
 		 401 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  35.98 
 
 		 401 aa  249  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  33.83 
 
 		 397 aa  245  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  36.59 
 
 		 401 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  34.89 
 
 		 401 aa  242  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  35.89 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  34.99 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  36.43 
 
 		 401 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  36.78 
 
 		 380 aa  230  3e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  35.31 
 
 		 399 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  34.6 
 
 		 377 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  35.14 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  34.07 
 
 		 401 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  34.66 
 
 		 400 aa  219  6e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  35.25 
 
 		 397 aa  218  1e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  35.09 
 
 		 397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  33.61 
 
 		 381 aa  209  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  34.91 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  34.64 
 
 		 400 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.26 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.43 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  22.92 
 
 		 349 aa  70.1  0.00000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 		 392 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  25.19 
 
 		 374 aa  63.2  0.000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  24.63 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  22.73 
 
 		 349 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0827  ABC transporter, permease protein, putative  23.44 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  24.37 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0010  protein of unknown function DUF214  23.3 
 
 		 380 aa  51.2  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000261565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  25.3 
 
 		 380 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  31.03 
 
 		 377 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0734  peptide ABC transporter permease  22.74 
 
 		 353 aa  49.7  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 		 382 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  22.13 
 
 		 366 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 372 aa  47.4  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1758  peptide ABC transporter permease  26.79 
 
 		 350 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000026517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0104  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.33773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  21.13 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0102  ABC transporter, permease protein, putative  23.13 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  25.36 
 
 		 384 aa  44.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  25.12 
 
 		 385 aa  44.7  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  20.96 
 
 		 350 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  22.73 
 
 		 397 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  22.25 
 
 		 356 aa  43.1  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>