More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1279 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  56.44 
 
 		 233 aa  270  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  55.8 
 
 		 244 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  55.8 
 
 		 240 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  55.02 
 
 		 245 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  55.8 
 
 		 228 aa  255  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  58.22 
 
 		 234 aa  252  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  55.07 
 
 		 243 aa  246  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  51.54 
 
 		 236 aa  240  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  52.53 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  52.31 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  52.31 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  52.31 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  52.31 
 
 		 236 aa  231  8.000000000000001e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  49.12 
 
 		 237 aa  231  9e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  52.31 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  52.05 
 
 		 243 aa  229  2e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  52.25 
 
 		 234 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  51.14 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  52.78 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  51.14 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  52.78 
 
 		 236 aa  227  2e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  50 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  52.75 
 
 		 235 aa  222  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  50.68 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  50.93 
 
 		 236 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  52.75 
 
 		 244 aa  221  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  52.78 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  48.62 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  48.42 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.81 
 
 		 228 aa  198  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  45.95 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  47.77 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  43.67 
 
 		 255 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  42.36 
 
 		 227 aa  185  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  44.39 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  43.81 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1629  ABC transporter related  44.34 
 
 		 315 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 224 aa  178  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  41.13 
 
 		 227 aa  178  8e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  38.72 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  43.05 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  38.72 
 
 		 237 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  40.87 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1809  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.596439  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  43.72 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5154  ABC transporter related  43.12 
 
 		 245 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  42.13 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.09 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  39.46 
 
 		 240 aa  172  5.999999999999999e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2703  ABC transporter related  38.7 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  38.5 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  40.18 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.91 
 
 		 226 aa  169  3e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2827  ABC transporter related  43.23 
 
 		 243 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3084  ABC transporter related  41.89 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.319445  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2328  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705701  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  38.91 
 
 		 286 aa  169  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  41.78 
 
 		 229 aa  168  5e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.91 
 
 		 242 aa  168  5e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1666  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 235 aa  169  5e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.029475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0686  peptide ABC transporter ATPase  46.4 
 
 		 223 aa  169  5e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  38.91 
 
 		 234 aa  168  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  40.81 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3220  ABC transporter related  40.99 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000135458  normal  0.0828287 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  40.81 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  42.15 
 
 		 244 aa  167  9e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  41.23 
 
 		 229 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  42.79 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0826  ATPase  41.33 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07029  ABC-type transporter ATPase component  39.38 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  40.97 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  42.79 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  40.27 
 
 		 237 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.33 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  39.82 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  43.64 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0481  ABC transporter related  40.53 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  39.64 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  38.77 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2531  ABC transporter related  41.2 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.799962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  40.81 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  40.71 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 		 237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1219  ATPase  42.86 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0615432  normal  0.958487 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  39.65 
 
 		 249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1841  ABC transporter related  40.09 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.656554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02358  ABC transporter ATP-binding subunit  37.84 
 
 		 242 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000106167  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  40.72 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000979  ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 		 232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  40.36 
 
 		 223 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  38.63 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  40.6 
 
 		 239 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  40.27 
 
 		 269 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>