250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1216 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2756  arsenite-activated ATPase ArsA  87.75 
 
 
407 aa  726    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0263  anion-transporting ATPase  89.14 
 
 
406 aa  726    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.069597  normal  0.76733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0117  anion-transporting ATPase  88.55 
 
 
401 aa  720    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0221  anion-transporting ATPase  82.6 
 
 
408 aa  691    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1216  arsenite-activated ATPase ArsA  100 
 
 
400 aa  820    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1248  arsenite-activated ATPase ArsA  93.18 
 
 
407 aa  761    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.245815  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2301  arsenite-activated ATPase ArsA  89 
 
 
405 aa  731    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0024147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2147  arsenite-activated ATPase ArsA  88 
 
 
405 aa  725    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.686862  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2198  arsenite-activated ATPase ArsA  85.25 
 
 
405 aa  707    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2574  arsenite-activated ATPase ArsA  88.38 
 
 
408 aa  729    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295294  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1962  arsenite-activated ATPase ArsA  85.5 
 
 
405 aa  713    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000471213  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1223  arsenite-activated ATPase ArsA  48.85 
 
 
399 aa  401  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.293801  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0078  arsenite-activated ATPase ArsA  48.59 
 
 
396 aa  380  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.121619  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0966  arsenite-activated ATPase ArsA  47.19 
 
 
397 aa  364  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1353  arsenite-activated ATPase ArsA  47.19 
 
 
397 aa  361  1e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284232  hitchhiker  0.00308524 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1088  arsenite-activated ATPase ArsA  47.45 
 
 
395 aa  360  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.782242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1173  anion-transporting ATPase  46.68 
 
 
396 aa  359  4e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.167129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1521  arsenite-activated ATPase ArsA  45.41 
 
 
395 aa  358  6e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00129827  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1378  anion-transporting ATPase  45.71 
 
 
396 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1125  arsenite-activated ATPase ArsA  46.43 
 
 
398 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.485276  normal  0.386119 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0070  anion-transporting ATPase  44.5 
 
 
406 aa  356  2.9999999999999997e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0091  arsenite-activated ATPase ArsA  46.55 
 
 
402 aa  355  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.304953  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0115  arsenite-activated ATPase ArsA  45.27 
 
 
404 aa  351  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2514  arsenite-activated ATPase ArsA  42.78 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.138109  normal  0.232029 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3600  arsenite-activated ATPase ArsA  42.53 
 
 
397 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0013  arsenite-activated ATPase ArsA  42.97 
 
 
395 aa  335  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4268  anion-transporting ATPase  42.17 
 
 
395 aa  332  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1259  arsenite-activated ATPase (arsA)  41.27 
 
 
392 aa  331  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.833931  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2084  arsenite-activated ATPase ArsA  41.92 
 
 
395 aa  330  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0397137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3278  arsenite-activated ATPase ArsA  41.69 
 
 
394 aa  330  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2956  arsenite-activated ATPase ArsA  41.01 
 
 
394 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00895235  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0222  arsenite-activated ATPase ArsA  42.53 
 
 
395 aa  325  8.000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.267897  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2364  arsenite-activated ATPase ArsA  43.88 
 
 
395 aa  323  2e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3240  arsenite-activated ATPase ArsA  42.27 
 
 
390 aa  318  7.999999999999999e-86  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.600829  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0312  arsenite-activated ATPase ArsA  42.28 
 
 
397 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0213  arsenite-activated ATPase ArsA  41.01 
 
 
392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.410604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0297  arsenite-activated ATPase ArsA  40.31 
 
 
393 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0253  arsenite-activated ATPase ArsA  39.11 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0363  anion-transporting ATPase family protein  40.31 
 
 
393 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4957  anion-transporting ATPase family protein  40.31 
 
 
392 aa  305  7e-82  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0288  arsenite-transporting ATPase  39.54 
 
 
393 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0349  anion-transporting ATPase family protein  39.8 
 
 
393 aa  302  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0346  arsenite-activated ATPase (arsA)  40.05 
 
 
392 aa  301  1e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0285  anion-transporting ATPase  39.8 
 
 
393 aa  301  1e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0390  anion-transporting ATPase family protein  40.05 
 
 
393 aa  301  1e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1570  arsenite-activated ATPase ArsA  39.29 
 
 
396 aa  290  4e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.807387  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0928  arsenite-activated ATPase ArsA  39.03 
 
 
396 aa  289  7e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.825229 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0908  arsenite-activated ATPase ArsA  39.54 
 
 
404 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.26902  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1511  arsenite-activated ATPase ArsA  36.25 
 
 
397 aa  273  3e-72  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155011  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3879  arsenite-activated ATPase ArsA  38.05 
 
 
391 aa  272  9e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1314  arsenite-activated ATPase (arsA)  39.53 
 
 
394 aa  268  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.735372  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0217  anion-transporting ATPase  36.48 
 
 
385 aa  262  8.999999999999999e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173989  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2570  Arsenite-transporting ATPase  35.73 
 
 
384 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00281236  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2143  arsenite-activated ATPase ArsA  35.99 
 
 
384 aa  258  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237468  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1958  arsenite-activated ATPase ArsA  35.73 
 
 
384 aa  256  6e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.367574  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0267  anion-transporting ATPase  36.25 
 
 
384 aa  256  7e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.138882  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2297  arsenite-activated ATPase ArsA  34.96 
 
 
384 aa  253  6e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.680488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2699  Arsenite-transporting ATPase  36.95 
 
 
389 aa  252  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.768822  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  34.45 
 
 
384 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3111  arsenite-transporting ATPase  35.29 
 
 
410 aa  250  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1679  arsenite-activated ATPase ArsA  36.39 
 
 
434 aa  241  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1219  Arsenite-transporting ATPase  34.8 
 
 
407 aa  238  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0551  arsenite-activated ATPase ArsA  36.13 
 
 
433 aa  236  4e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2215  arsenite-activated ATPase ArsA  36.43 
 
 
433 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0457  anion-transporting ATPase  36.91 
 
 
433 aa  236  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.328164  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0797  arsenite-activated ATPase ArsA  35.6 
 
 
433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.541359  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1698  arsenite-transporting ATPase  33.84 
 
 
385 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0678  arsenite-activated ATPase ArsA  34.26 
 
 
433 aa  232  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.689675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3232  arsenite-activated ATPase ArsA  34.36 
 
 
409 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00988964  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1412  anion-transporting ATPase  33.08 
 
 
434 aa  224  3e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1697  arsenite-activated ATPase ArsA  33.15 
 
 
393 aa  223  7e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1387  Arsenite-transporting ATPase  35 
 
 
406 aa  196  9e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.517206  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24880  oxyanion-translocating ATPase  33.07 
 
 
377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66061  normal  0.410485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3094  arsenite-transporting ATPase  29 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.968228 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0303  anion-transporting ATPase, N-terminus  48.17 
 
 
169 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1823  arsenite-transporting ATPase  26.9 
 
 
401 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.702579  normal  0.326449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0787  arsenite-activated ATPase ArsA  32.8 
 
 
344 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1512  arsenite-activated ATPase ArsA  32.35 
 
 
345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.662645  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1168  arsenite-activated ATPase ArsA  32.69 
 
 
345 aa  146  5e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1163  arsenite-activated ATPase ArsA  31.35 
 
 
345 aa  140  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.841393  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3445  arsenite-activated ATPase ArsA  33.12 
 
 
640 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0302  anion-transporting ATPase, C-terminus  34.45 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3342  arsenite-activated ATPase ArsA  31.66 
 
 
643 aa  130  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3644  arsenite-activated ATPase ArsA  29.56 
 
 
332 aa  127  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1004  arsenite-activated ATPase ArsA  30.13 
 
 
341 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1224  Anion-transporting ATPase  31.76 
 
 
456 aa  123  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.916142  decreased coverage  0.000000394119 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2193  arsenite-activated ATPase ArsA  30.18 
 
 
311 aa  120  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.293828  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0862  arsenite-activated ATPase ArsA  29.11 
 
 
334 aa  121  3e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02640  conserved hypothetical protein  30.3 
 
 
325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.14448  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2781  Anion-transporting ATPase  26.68 
 
 
367 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.251695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0696  anion-transporting ATPase  29.3 
 
 
314 aa  117  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0450  arsenite-transporting ATPase  27.16 
 
 
334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0025028  hitchhiker  0.000316077 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0892  arsenite-transporting ATPase  27.44 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.449464  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3279  arsenite-transporting ATPase  26.59 
 
 
421 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3341  arsenite-transporting ATPase  26.59 
 
 
421 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0464361  normal  0.354276 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3290  arsenite-transporting ATPase  26.59 
 
 
421 aa  114  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1218  Anion-transporting ATPase  24.32 
 
 
367 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1865  anion ABC transporter ATPase  25.26 
 
 
365 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0875  anion-transporting ATPase  27.68 
 
 
364 aa  106  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0691273 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1891  hypothetical protein  25.26 
 
 
365 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.222202  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>