40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1180 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 		 347 aa  724    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.87 
 
 		 342 aa  397  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  54.84 
 
 		 342 aa  391  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  51.13 
 
 		 331 aa  342  5e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  54.23 
 
 		 348 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.84 
 
 		 341 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.69 
 
 		 325 aa  279  5e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  27.68 
 
 		 342 aa  152  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.82 
 
 		 348 aa  149  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  31.78 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  29.91 
 
 		 363 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  30.06 
 
 		 413 aa  141  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  28.69 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.06 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.88 
 
 		 326 aa  115  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.14 
 
 		 334 aa  87  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1169  endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.13 
 
 		 343 aa  83.2  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.38 
 
 		 499 aa  76.6  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.35 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  25.55 
 
 		 339 aa  69.7  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.75 
 
 		 460 aa  67  0.0000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 		 480 aa  59.7  0.00000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.85 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3448  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.62 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0526  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  25.58 
 
 		 431 aa  47  0.0005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.22 
 
 		 790 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  20.17 
 
 		 788 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15630  predicted extracellular nuclease  27.94 
 
 		 802 aa  45.1  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.35443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  20.17 
 
 		 788 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  20.17 
 
 		 788 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.17 
 
 		 788 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1075  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  20.17 
 
 		 583 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  19.74 
 
 		 788 aa  43.9  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  20.17 
 
 		 788 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  20.17 
 
 		 788 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3284  extracellular nuclease-like protein  21.4 
 
 		 795 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.512865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0972  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.07 
 
 		 1266 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.705534  normal  0.368107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.47 
 
 		 592 aa  42.7  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.17 
 
 		 788 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>