More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1169 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1169  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
355 aa  719    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000113623  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  71.83 
 
 
355 aa  524  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1412  histidinol phosphate aminotransferase  71.83 
 
 
360 aa  524  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000103384  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  68.73 
 
 
357 aa  514  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1206  histidinol-phosphate aminotransferase  71.02 
 
 
357 aa  504  9.999999999999999e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000283101  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1096  histidinol-phosphate aminotransferase  68.84 
 
 
365 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0578719  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  65.24 
 
 
363 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0667  histidinol-phosphate aminotransferase  38.9 
 
 
369 aa  249  5e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.90309  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1122  histidinol-phosphate aminotransferase  34.24 
 
 
350 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287962  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 
363 aa  206  5e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  32.11 
 
 
358 aa  203  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 
351 aa  202  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2883  histidinol phosphate aminotransferase  32.68 
 
 
358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.017474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  32.58 
 
 
357 aa  192  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  32.03 
 
 
360 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  33.05 
 
 
355 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  32.77 
 
 
365 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0329  histidinol-phosphate aminotransferase  34.38 
 
 
364 aa  186  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.870649  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  31.71 
 
 
371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  31.67 
 
 
366 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  32.32 
 
 
356 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3524  histidinol-phosphate aminotransferase  34.06 
 
 
357 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.292821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  32.21 
 
 
355 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  32.53 
 
 
351 aa  180  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15270  histidinol-phosphate aminotransferase  33.84 
 
 
357 aa  178  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.186384 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0353  histidinol-phosphate aminotransferase  33.12 
 
 
357 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1771  histidinol-phosphate aminotransferase  31.09 
 
 
356 aa  177  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0818  histidinol-phosphate aminotransferase  33.73 
 
 
368 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0746  histidinol-phosphate aminotransferase  30.62 
 
 
363 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.275971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  31.4 
 
 
356 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  31.1 
 
 
356 aa  176  5e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  32.5 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0118  aminotransferase, class I and II  32.39 
 
 
363 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385241  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  32.96 
 
 
371 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
356 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  28.13 
 
 
360 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  33.11 
 
 
348 aa  172  5.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
356 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2619  histidinol-phosphate aminotransferase  32.93 
 
 
352 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
356 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
356 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
356 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  32.19 
 
 
356 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  31.87 
 
 
356 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0405  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 
357 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.290947 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
356 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
356 aa  170  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
356 aa  169  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
356 aa  169  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  29.72 
 
 
366 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2681  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 
357 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0426  histidinol-phosphate aminotransferase  33.44 
 
 
357 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
356 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
356 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  32.31 
 
 
356 aa  169  8e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0832  histidinol-phosphate aminotransferase  31.03 
 
 
371 aa  169  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.855628  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
356 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
356 aa  169  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2951  histidinol-phosphate aminotransferase  32.29 
 
 
374 aa  167  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.637842  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1136  histidinol-phosphate aminotransferase  32.01 
 
 
349 aa  168  2e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0344  histidinol-phosphate aminotransferase  33.12 
 
 
357 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.750302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  31.01 
 
 
359 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2881  histidinol-phosphate aminotransferase  31.32 
 
 
374 aa  166  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0576807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
359 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
359 aa  165  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  30.73 
 
 
359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3228  histidinol-phosphate aminotransferase  31.32 
 
 
374 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  32.88 
 
 
364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3162  histidinol-phosphate aminotransferase  33.83 
 
 
366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00538361  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5729  histidinol-phosphate aminotransferase  31.74 
 
 
369 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  31.75 
 
 
353 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2651  histidinol-phosphate aminotransferase  30.31 
 
 
359 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3042  histidinol-phosphate aminotransferase  30.31 
 
 
359 aa  161  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  31.68 
 
 
362 aa  160  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  30.83 
 
 
382 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  29.2 
 
 
368 aa  159  6e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 
382 aa  159  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2214  histidinol-phosphate aminotransferase  29.21 
 
 
365 aa  159  8e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.904868  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  30.56 
 
 
382 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  31.36 
 
 
357 aa  158  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.4 
 
 
370 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  32.35 
 
 
346 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
359 aa  158  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  30.33 
 
 
349 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4690  histidinol-phosphate aminotransferase  29.07 
 
 
376 aa  157  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.343336  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  31.07 
 
 
357 aa  156  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  28.65 
 
 
358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0805  histidinol-phosphate aminotransferase  30.91 
 
 
358 aa  156  5.0000000000000005e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  30.25 
 
 
357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1167  histidinol-phosphate aminotransferase  31.44 
 
 
363 aa  155  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2959  histidinol-phosphate aminotransferase  32.34 
 
 
374 aa  155  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.190767  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4103  histidinol phosphate aminotransferase  31.5 
 
 
347 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  28.1 
 
 
358 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  31 
 
 
350 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  32.54 
 
 
346 aa  154  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1167  aminotransferase class I and II  30.33 
 
 
352 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.342737  normal  0.371786 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1588  histidinol-phosphate aminotransferase  29.97 
 
 
375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00615435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0697  histidinol-phosphate aminotransferase  28.93 
 
 
365 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.355072 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1435  histidinol-phosphate aminotransferase  31.58 
 
 
362 aa  153  5e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.629545 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>