More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1119 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1119  3-dehydroquinate dehydratase  100 
 
 		 153 aa  310  5.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1436  3-dehydroquinate dehydratase  78.91 
 
 		 151 aa  243  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.767902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  80.28 
 
 		 151 aa  235  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1544  3-dehydroquinate dehydratase  73.65 
 
 		 166 aa  229  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  73.97 
 
 		 173 aa  223  7e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  73.47 
 
 		 151 aa  221  3e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1172  3-dehydroquinate dehydratase  70.42 
 
 		 162 aa  205  1e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00149838  normal  0.362195 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 		 147 aa  157  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.41 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  57.14 
 
 		 141 aa  154  3e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.03 
 
 		 152 aa  153  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  51.82 
 
 		 145 aa  152  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  55.1 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.35 
 
 		 145 aa  149  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.79 
 
 		 144 aa  147  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.94 
 
 		 150 aa  147  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  52.38 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  55.32 
 
 		 149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1733  3-dehydroquinate dehydratase  56.74 
 
 		 161 aa  145  2.0000000000000003e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0846239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.02 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  54.86 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 		 144 aa  143  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  50.67 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  55.71 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  49.33 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  50.98 
 
 		 156 aa  140  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 137 aa  140  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.45 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2207  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 144 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.121431  normal  0.285231 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  44.59 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0417  3-dehydroquinate dehydratase  50.34 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04491  3-dehydroquinate dehydratase  45.58 
 
 		 146 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.609687  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1306  3-dehydroquinate dehydratase  55.97 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.203754  normal  0.0551942 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  48.61 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.64 
 
 		 137 aa  137  7.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04381  3-dehydroquinate dehydratase  45.27 
 
 		 147 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  52.17 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.83 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15470  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.363675  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  44.67 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  45.27 
 
 		 147 aa  135  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  44.67 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 		 165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3996  3-dehydroquinate dehydratase  45.64 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.588334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.45 
 
 		 145 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  44.37 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  44 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1559  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 148 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0672163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  44.9 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1588  3-dehydroquinate dehydratase  48.63 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1789  3-dehydroquinate dehydratase  53.24 
 
 		 145 aa  134  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4497  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81741  normal  0.381959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1300  3-dehydroquinate dehydratase  47.3 
 
 		 150 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0501246  normal  0.27707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  49.66 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1028  3-dehydroquinate dehydratase  48.34 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  44.59 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  49.32 
 
 		 148 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0123  3-dehydroquinate dehydratase  56.92 
 
 		 141 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.573144  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 144 aa  132  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1952  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000216086  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  46.62 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2283  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 145 aa  132  9.999999999999999e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 		 145 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  48.87 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2077  3-dehydroquinate dehydratase  48.92 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.556948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2360  3-dehydroquinate dehydratase  49.62 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.896861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2178  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0211  3-dehydroquinate dehydratase  45.14 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.324309  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2754  3-dehydroquinate dehydratase  48.57 
 
 		 151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0373  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131464 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2097  3-dehydroquinate dehydratase  48.55 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1094  3-dehydroquinate dehydratase  47.71 
 
 		 191 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.280773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1223  3-dehydroquinate dehydratase  47.68 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  46.27 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3520  3-dehydroquinate dehydratase  47.95 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000267198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  46.21 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  44.59 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  42.18 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  45.52 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2690  3-dehydroquinate dehydratase  48.25 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  45.11 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1422  3-dehydroquinate dehydratase  45.27 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.216842  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>