More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1096 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1226  hypothetical protein  74.49 
 
 		 393 aa  638    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1541  hypothetical protein  77.04 
 
 		 393 aa  641    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1096  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  806    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000465883  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0981  SAM-dependent methyltransferase  73.98 
 
 		 393 aa  619  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0160399  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1464  hypothetical protein  68.11 
 
 		 394 aa  578  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.926164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0756  hypothetical protein  69.13 
 
 		 393 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1197  hypothetical protein  65.31 
 
 		 394 aa  547  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0533478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  42.93 
 
 		 392 aa  319  5e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1811  protein of unknown function Met10  41.09 
 
 		 415 aa  316  4e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000878098  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0341  protein of unknown function Met10  41.09 
 
 		 395 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1090  protein of unknown function Met10  44.02 
 
 		 391 aa  312  6.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.339583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1662  putative oxidoreductase  42.17 
 
 		 392 aa  312  6.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000338862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2060  PUA domain-containing protein  40.71 
 
 		 418 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0032112  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6903  putative RNA methylase  42.2 
 
 		 390 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0358341  normal  0.255977 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2626  hypothetical protein  42.27 
 
 		 396 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.316622  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0604  protein of unknown function Met10  40.91 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000482493  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1342  protein of unknown function Met10  40.36 
 
 		 390 aa  296  6e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.425757  hitchhiker  0.0000000474621 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1409  protein of unknown function Met10  40.71 
 
 		 394 aa  295  8e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0845  SAM-dependent methyltransferase  42.78 
 
 		 397 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1493  hypothetical protein  43.41 
 
 		 400 aa  293  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.93187  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1343  putative RNA methylase  40.91 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.417493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1218  protein of unknown function Met10  38.72 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0747272  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1849  methyltransferase small  39.29 
 
 		 398 aa  280  3e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1014  methyltransferase small  40.41 
 
 		 407 aa  279  6e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.955984  hitchhiker  0.00000000107776 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0892  hypothetical protein  40.16 
 
 		 407 aa  277  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0846  SAM-dependent methyltransferase  40.74 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0366  SAM-dependent methyltransferase  41.07 
 
 		 403 aa  276  5e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0859295  normal  0.454449 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1865  hypothetical protein  41.33 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0592  PUA domain-containing protein  39.02 
 
 		 394 aa  275  8e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1821  putative SAM-dependent methyltransferase  37.04 
 
 		 394 aa  275  9e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00015725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2872  putative methyltransferase  36.41 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2555  putative methyltransferase  36.5 
 
 		 391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1451  hypothetical protein  38.99 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1137  hypothetical protein  37.91 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.484053  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1519  SAM-dependent methyltransferase  39.05 
 
 		 409 aa  270  2e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.197853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2702  putative SAM-dependent methyltransferase  38.3 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0993  SAM-dependent methyltransferase-like protein  38.38 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0222076  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3750  hypothetical protein  38.1 
 
 		 398 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0864598 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22980  SAM-dependent methyltransferase  37.78 
 
 		 416 aa  265  7e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0614  SAM-dependent methyltransferase  36.62 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1049  hypothetical protein  38.32 
 
 		 399 aa  262  6e-69  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157301  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2376  SAM-dependent methyltransferase  38.22 
 
 		 400 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1583  PUA domain containing protein  38.22 
 
 		 400 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.303299  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1488  PUA domain containing protein  38.22 
 
 		 400 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0051  hypothetical protein  38.93 
 
 		 397 aa  259  7e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4225  PUA domain containing protein  37.63 
 
 		 394 aa  259  8e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.731484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2965  putative SAM-dependent methyltransferase  38.7 
 
 		 396 aa  258  9e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1889  hypothetical protein  35.25 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0812  hypothetical protein  37.15 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.199944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3698  PUA domain containing protein  38.13 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3333  SAM-dependent methyltransferase  39.49 
 
 		 416 aa  258  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0223  SAM-dependent methyltransferase  37.4 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3375  PUA domain containing protein  37.91 
 
 		 397 aa  256  5e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1714  protein of unknown function Met10  39.35 
 
 		 404 aa  256  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2997  PUA domain-containing protein  35.34 
 
 		 404 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0717099 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3451  SAM-dependent methyltransferase  37.44 
 
 		 396 aa  256  6e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0073  PUA domain-containing protein  36.96 
 
 		 400 aa  256  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1491  putative RNA methylase  36.41 
 
 		 408 aa  255  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003408  hypothetical protein  35.81 
 
 		 397 aa  255  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000270562  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1479  SAM-dependent methyltransferase  36.18 
 
 		 396 aa  254  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.41969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0973  SAM-dependent methyltransferase  38.08 
 
 		 396 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.510915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3134  PUA domain-containing protein  35.98 
 
 		 404 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.312464  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1082  hypothetical protein  36.43 
 
 		 396 aa  252  6e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000305834  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2531  PUA domain-containing protein  35.66 
 
 		 396 aa  252  6e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.149563  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4376  SAM-dependent methyltransferase  35.95 
 
 		 400 aa  252  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1132  hypothetical protein  36.43 
 
 		 396 aa  252  6e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.250632 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2620  PUA domain-containing protein  35.66 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.925241  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3209  PUA domain-containing protein  35.66 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0310372  hitchhiker  0.00624197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0977  SAM-dependent methyltransferase  38.34 
 
 		 396 aa  252  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4199  SAM-dependent methyltransferase  36.92 
 
 		 399 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0338  hypothetical protein  36.41 
 
 		 398 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1121  SAM-dependent methyltransferase  36.18 
 
 		 403 aa  252  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  7.50041e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1143  protein YccW  36.18 
 
 		 403 aa  252  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1011  SAM-dependent methyltransferase  37.82 
 
 		 396 aa  252  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.719099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2745  putative RNA methylase  38.36 
 
 		 426 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1038  protein YccW  36.18 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.677771  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1155  hypothetical protein  36.18 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.282182  normal  0.900174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2151  hypothetical protein  36.43 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.111749  normal  0.201335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2348  hypothetical protein  36.43 
 
 		 396 aa  251  1e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6438  SAM-dependent methyltransferase  34.84 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.812224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5177  hypothetical protein  36.67 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3083  PUA domain-containing protein  35.73 
 
 		 404 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0506746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2474  PUA domain-containing protein  34.84 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.78499  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3088  PUA domain-containing protein  34.84 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1189  hypothetical protein  36.18 
 
 		 403 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.887543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3105  PUA domain-containing protein  34.84 
 
 		 404 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.281212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  35.7 
 
 		 400 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5001  hypothetical protein  36.41 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.397476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02370  methyltransferase  35.55 
 
 		 397 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4764  hypothetical protein  36.15 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.095661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0447  hypothetical protein  36.92 
 
 		 398 aa  250  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2676  Protein of unknown function methylase putative  36.18 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00640456  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1076  hypothetical protein  36.18 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2629  hypothetical protein  36.18 
 
 		 396 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5127  hypothetical protein  36.15 
 
 		 398 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0412  hypothetical protein  36.15 
 
 		 398 aa  249  8e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03350  SAM-dependent methyltransferase  36.15 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524886  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1764  PUA domain-containing protein  35.71 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0181071  hitchhiker  0.000729336 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0194  hypothetical protein  34.29 
 
 		 422 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2446  hypothetical protein  39.19 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.920431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>