38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0908 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0908  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  340  5e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  5.42792e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1359  hypothetical protein  71.97 
 
 
182 aa  204  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0526065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0766  hypothetical protein  58.06 
 
 
255 aa  192  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00180926  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0232  hypothetical protein  49.15 
 
 
189 aa  169  2e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.12225  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1431  hypothetical protein  58.5 
 
 
145 aa  162  2e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  6.37648e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1035  hypothetical protein  49.33 
 
 
177 aa  148  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.214662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1497  hypothetical protein  51.19 
 
 
170 aa  139  2e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.844823  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1040  hypothetical protein  55 
 
 
174 aa  138  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.194155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1496  hypothetical protein  47.41 
 
 
353 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1260  hypothetical protein  44.38 
 
 
267 aa  129  1e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.541563  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1038  hypothetical protein  50.37 
 
 
135 aa  128  4e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1095  hypothetical protein  52.94 
 
 
171 aa  114  9e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  1.52193e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1442  hypothetical protein  38.42 
 
 
265 aa  99.8  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.658193  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1042  hypothetical protein  36.69 
 
 
288 aa  97.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0835293  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2496  hypothetical protein  32.61 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  3.77569e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1247  hypothetical protein  32.74 
 
 
188 aa  83.6  1e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0384  hypothetical protein  33.33 
 
 
202 aa  82.4  3e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1763  hypothetical protein  45.98 
 
 
183 aa  81.6  5e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.47838e-18  normal  0.040844 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0953  hypothetical protein  36.76 
 
 
195 aa  78.6  4e-14  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.585982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3620  hypothetical protein  31.82 
 
 
184 aa  78.2  5e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.794068  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3095  hypothetical protein  31.33 
 
 
214 aa  77  1e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1180  hypothetical protein  45.45 
 
 
232 aa  75.1  5e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1752  hypothetical protein  31.25 
 
 
173 aa  74.3  7e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  9.63449e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3294  hypothetical protein  33.1 
 
 
203 aa  74.7  7e-13  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0157417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2263  hypothetical protein  34.91 
 
 
213 aa  71.6  6e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  4.59083e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0782  hypothetical protein  42.99 
 
 
177 aa  69.7  2e-11  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.674637  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0131  hypothetical protein  41.54 
 
 
213 aa  68.9  4e-11  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3170  hypothetical protein  39.47 
 
 
187 aa  68.6  5e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1092  hypothetical protein  38.16 
 
 
180 aa  65.9  3e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2170  hypothetical protein  49.15 
 
 
59 aa  57.8  7e-08  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2248  hypothetical protein  23.53 
 
 
165 aa  50.4  1e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  9.24261e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3436  hypothetical protein  31.33 
 
 
283 aa  47.8  7e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2054  hypothetical protein  26.88 
 
 
329 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1978  hypothetical protein  23.29 
 
 
165 aa  44.7  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0935  hypothetical protein  34.35 
 
 
192 aa  44.3  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.879201  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1053  hypothetical protein  34.35 
 
 
192 aa  44.3  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.308187 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4028  hypothetical protein  26.67 
 
 
316 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145897  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0109  hypothetical protein  30.49 
 
 
321 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.419389  normal  0.546641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>