More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0837 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  100 
 
 
462 aa  925    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  71.08 
 
 
463 aa  652    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  68.11 
 
 
483 aa  598  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  62.86 
 
 
463 aa  570  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  60.48 
 
 
467 aa  536  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  59.04 
 
 
470 aa  511  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  56.17 
 
 
496 aa  498  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  28.54 
 
 
535 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  33.33 
 
 
451 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  28.08 
 
 
456 aa  156  6e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  25.4 
 
 
449 aa  156  9e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  30.09 
 
 
1496 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 
451 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  26.06 
 
 
442 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  26.93 
 
 
448 aa  148  2.0000000000000003e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  24.79 
 
 
463 aa  144  4e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  25.05 
 
 
462 aa  142  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  28.64 
 
 
460 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  28.35 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  27.4 
 
 
455 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  25.44 
 
 
443 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  27.7 
 
 
419 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  23.9 
 
 
453 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  22.45 
 
 
443 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  25.3 
 
 
455 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  26.34 
 
 
433 aa  126  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  27.19 
 
 
419 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 
419 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  27 
 
 
419 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  26.94 
 
 
448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.73 
 
 
491 aa  120  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  24.19 
 
 
471 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  27.08 
 
 
1470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  23.58 
 
 
446 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  20.42 
 
 
441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  24.25 
 
 
447 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 
454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  24.66 
 
 
455 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  25.47 
 
 
441 aa  108  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  22.91 
 
 
427 aa  108  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  25.59 
 
 
453 aa  107  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  27.65 
 
 
459 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  25.65 
 
 
439 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  25.52 
 
 
423 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  21.33 
 
 
444 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 
408 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  23.67 
 
 
488 aa  100  5e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  23.88 
 
 
446 aa  100  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2298  outer membrane efflux protein  23.6 
 
 
525 aa  100  6e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  21.13 
 
 
445 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  24.36 
 
 
444 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  22 
 
 
471 aa  98.2  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2926  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.17 
 
 
472 aa  97.1  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  23.49 
 
 
421 aa  96.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.56 
 
 
421 aa  96.3  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3717  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.71 
 
 
477 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1482  outer membrane efflux protein  24.95 
 
 
471 aa  95.5  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.387043 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  23.78 
 
 
426 aa  93.6  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  23.32 
 
 
443 aa  92.8  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3165  outer membrane efflux protein  26.35 
 
 
445 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3626  outer membrane efflux protein  25.29 
 
 
627 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0887926  normal  0.306741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2606  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26 
 
 
478 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0037798  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1024  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.36 
 
 
484 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.484622  normal  0.130102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1384  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.98 
 
 
484 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.71 
 
 
485 aa  91.7  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  24.24 
 
 
435 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 
482 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.54 
 
 
436 aa  91.3  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1951  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.59 
 
 
480 aa  90.9  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  24.31 
 
 
464 aa  90.9  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.1 
 
 
475 aa  90.9  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4339  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.76 
 
 
484 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.254961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0121  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  26.85 
 
 
469 aa  90.5  6e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4429  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.1 
 
 
484 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  0.0579633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0950  outer membrane efflux protein  27.18 
 
 
424 aa  90.1  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3057  outer membrane efflux protein  26.12 
 
 
440 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.969203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0567  RND efflux system outer membrane lipoprotein  26.37 
 
 
483 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1278  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  23.57 
 
 
486 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00202436  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  24.58 
 
 
470 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4009  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.4 
 
 
486 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0874069  normal  0.0174443 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  22.99 
 
 
485 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2027  outer membrane efflux protein  25.43 
 
 
495 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000179084 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.52 
 
 
441 aa  88.2  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  21.15 
 
 
445 aa  87.8  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  24.35 
 
 
497 aa  87.8  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  24.34 
 
 
445 aa  87.4  5e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3925  multidrug efflux system protein  23.64 
 
 
499 aa  87.4  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000707781  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 
447 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3894  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.83 
 
 
476 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3633  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.83 
 
 
476 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4472  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.83 
 
 
476 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.621832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  24.09 
 
 
461 aa  86.7  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  25.31 
 
 
441 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.41 
 
 
501 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.6 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  24.71 
 
 
500 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2367  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  24.06 
 
 
474 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.86 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  22.75 
 
 
485 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4305  outer membrane efflux protein  24.28 
 
 
486 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>