More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0814 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0814  thioredoxin reductase  100 
 
 		 311 aa  636    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1260  thioredoxin reductase  83.28 
 
 		 311 aa  546  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1197  thioredoxin reductase  82.32 
 
 		 311 aa  538  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.711369  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1544  thioredoxin reductase  79.1 
 
 		 311 aa  525  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1151  thioredoxin reductase  76.53 
 
 		 311 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000793818  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0923  thioredoxin reductase  75.56 
 
 		 311 aa  495  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1207  thioredoxin reductase  73.63 
 
 		 311 aa  488  1e-137  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.12437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4094  thioredoxin reductase  61.89 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00339774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4061  thioredoxin reductase  61.89 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0887  thioredoxin reductase  62.95 
 
 		 319 aa  394  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0473  thioredoxin reductase  63.67 
 
 		 314 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.499551 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3951  thioredoxin reductase  62.54 
 
 		 314 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  60.2 
 
 		 334 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1226  thioredoxin reductase  60.84 
 
 		 325 aa  359  3e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  57.62 
 
 		 321 aa  358  4e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4304  thioredoxin reductase  58.9 
 
 		 335 aa  357  9.999999999999999e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  57.62 
 
 		 321 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  55.19 
 
 		 314 aa  355  6.999999999999999e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3350  thioredoxin reductase  54.43 
 
 		 318 aa  350  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000709992  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  56.31 
 
 		 348 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  56.62 
 
 		 321 aa  349  3e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  57.95 
 
 		 321 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  54.95 
 
 		 361 aa  345  4e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  56.62 
 
 		 345 aa  345  5e-94  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1613  thioredoxin reductase  54.87 
 
 		 322 aa  345  8e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0030  thioredoxin reductase  57.42 
 
 		 320 aa  345  8e-94  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3108  thioredoxin reductase  55.41 
 
 		 310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.264051  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0229  thioredoxin reductase  56.07 
 
 		 332 aa  342  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4960  thioredoxin reductase  56.72 
 
 		 319 aa  342  5e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4609  thioredoxin reductase  58.28 
 
 		 321 aa  342  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0752942  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4536  thioredoxin reductase  57.65 
 
 		 348 aa  340  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  53.21 
 
 		 323 aa  340  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1337  thioredoxin reductase  55.16 
 
 		 311 aa  341  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  53.21 
 
 		 323 aa  340  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7086  thioredoxin reductase  53.11 
 
 		 331 aa  340  2e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2898  thioredoxin reductase  55.02 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  55.34 
 
 		 324 aa  340  2e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2006  thioredoxin reductase  53.7 
 
 		 317 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1694  thioredoxin-disulfide reductase  53.48 
 
 		 317 aa  339  2.9999999999999998e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01037  thioredoxin-disulfide reductase  55.63 
 
 		 322 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.088167  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06129  thioredoxin-disulfide reductase  55.63 
 
 		 322 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.345376  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2721  thioredoxin reductase  54.9 
 
 		 324 aa  338  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.137171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  57.62 
 
 		 321 aa  338  8e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 316 aa  338  9e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  51.94 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  56.95 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2982  thioredoxin reductase  55.23 
 
 		 324 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0371232 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  54.72 
 
 		 310 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1360  thioredoxin reductase  54.46 
 
 		 332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7121  thioredoxin reductase  52.94 
 
 		 327 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5364  thioredoxin reductase  54.98 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  53.77 
 
 		 324 aa  335  5e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23380  thioredoxin-disulfide reductase  53.23 
 
 		 333 aa  335  5e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0839  thioredoxin reductase  56.44 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.242227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5401  thioredoxin reductase  53.99 
 
 		 361 aa  335  7.999999999999999e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2721  thioredoxin reductase  54.34 
 
 		 317 aa  335  7.999999999999999e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.49521  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1092  thioredoxin reductase  53.77 
 
 		 324 aa  334  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3383  thioredoxin reductase  54.34 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.281365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  55.88 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2753  thioredoxin reductase  55.16 
 
 		 320 aa  334  1e-90  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  55.88 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  55.88 
 
 		 333 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4637  thioredoxin reductase  54.34 
 
 		 456 aa  333  2e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000231293  normal  0.140967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4859  thioredoxin reductase  52.61 
 
 		 310 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3686  thioredoxin reductase  51.57 
 
 		 316 aa  332  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000489943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  56.11 
 
 		 331 aa  333  3e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6236  thioredoxin reductase  50.97 
 
 		 314 aa  332  5e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.215918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4853  thioredoxin reductase  53.5 
 
 		 330 aa  332  6e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.838149  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  50.64 
 
 		 320 aa  332  6e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  52.63 
 
 		 335 aa  332  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  50.64 
 
 		 320 aa  332  6e-90  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  53.44 
 
 		 324 aa  332  6e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0935  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1016  thioredoxin reductase  54.84 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1932  thioredoxin reductase  53.85 
 
 		 323 aa  331  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3781  thioredoxin reductase  51.26 
 
 		 316 aa  331  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02606  thioredoxin reductase  51.94 
 
 		 319 aa  331  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0495  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.287434  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1982  thioredoxin reductase  52.87 
 
 		 328 aa  331  1e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.343784  normal  0.438815 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0974  thioredoxin reductase  53.38 
 
 		 320 aa  331  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9376  thioredoxin reductase  54.25 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1611  thioredoxin reductase  50.97 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000152855  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1178  thioredoxin reductase  54.84 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  53.64 
 
 		 317 aa  330  2e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26940  thioredoxin-disulfide reductase  53.55 
 
 		 359 aa  330  2e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1560  thioredoxin-disulfide reductase  53.7 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212237  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003744  thioredoxin reductase  52.26 
 
 		 319 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.891826  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2687  thioredoxin reductase  50.97 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.643501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2598  thioredoxin-disulfide reductase  50.97 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000212052  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  53.64 
 
 		 312 aa  329  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1762  thioredoxin reductase  53.04 
 
 		 317 aa  329  3e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.422622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  51.12 
 
 		 325 aa  329  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1118  thioredoxin reductase  53.85 
 
 		 316 aa  329  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.203245 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  51.74 
 
 		 316 aa  328  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4579  thioredoxin reductase  54.86 
 
 		 317 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.777909  hitchhiker  0.00491977 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3654  thioredoxin reductase  54.05 
 
 		 458 aa  328  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.24215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3427  thioredoxin reductase  53.25 
 
 		 319 aa  328  6e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.116946  normal  0.610265 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5097  thioredoxin reductase  54.86 
 
 		 362 aa  328  7e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.121367  hitchhiker  0.000000380245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2370  thioredoxin reductase  50.97 
 
 		 316 aa  328  7e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3045  thioredoxin-disulfide reductase  53.38 
 
 		 320 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>