More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0803 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  100 
 
 		 212 aa  441  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  64.94 
 
 		 155 aa  207  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1270  universal stress protein  64.67 
 
 		 154 aa  205  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  64.24 
 
 		 154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  64.43 
 
 		 154 aa  198  6e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  40.27 
 
 		 150 aa  116  3e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  43.51 
 
 		 152 aa  107  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  38.19 
 
 		 153 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  41.45 
 
 		 145 aa  102  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  38.96 
 
 		 153 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  39.61 
 
 		 153 aa  101  9e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  40.79 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  42.95 
 
 		 145 aa  99.4  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  36.91 
 
 		 152 aa  96.7  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  37.58 
 
 		 152 aa  95.9  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  34.16 
 
 		 150 aa  87  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  36.42 
 
 		 162 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  36.42 
 
 		 162 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  38.41 
 
 		 155 aa  84.7  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  37.01 
 
 		 162 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  34.62 
 
 		 173 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  35.86 
 
 		 144 aa  81.6  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3355  UspA domain-containing protein  38.46 
 
 		 143 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.47946  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.06 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.06 
 
 		 170 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  33.96 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  34.81 
 
 		 169 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  34.19 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2595  UspA domain protein  32.28 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000015359  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  35.42 
 
 		 390 aa  79  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  34.87 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  35.06 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  35.62 
 
 		 158 aa  77.8  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  31.25 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  36.18 
 
 		 153 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  34.27 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  33.54 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.13 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0976  hypothetical protein  35.21 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.21333  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  33.99 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  36.3 
 
 		 151 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3714  universal stress protein  36.17 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.782463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 162 aa  75.1  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  28.4 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  35.66 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  36.77 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  37.32 
 
 		 141 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  37.5 
 
 		 154 aa  73.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3147  UspA domain-containing protein  34.19 
 
 		 149 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3706  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 143 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0037155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  33.33 
 
 		 155 aa  73.9  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  34.01 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.78 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  32.41 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  34.69 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3101  UspA domain-containing protein  37.06 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  34.25 
 
 		 152 aa  72  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  34.69 
 
 		 280 aa  72  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  31.37 
 
 		 159 aa  72  0.000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  37.41 
 
 		 282 aa  71.6  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001681  universal stress protein family 3  34.27 
 
 		 145 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  35.37 
 
 		 148 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 145 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4060  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 143 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  32 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  30.41 
 
 		 157 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  34.01 
 
 		 144 aa  70.9  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.75 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  37.42 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  34.23 
 
 		 142 aa  70.5  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.72 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  35 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1279  hypothetical protein  37.59 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.471919 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  34.01 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  34.19 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  35.21 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  31.54 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3248  UspA domain-containing protein  31.97 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0875  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  31.91 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0938  UspA domain-containing protein  35.92 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1933  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1585  UspA domain protein  36.3 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  31.03 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  33.99 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  36.77 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  31.74 
 
 		 314 aa  68.2  0.00000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  30.46 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  34.03 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5582  UspA domain protein  34.44 
 
 		 158 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  28.38 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.8 
 
 		 300 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4059  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 		 153 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  31.51 
 
 		 145 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>