190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0750 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  100 
 
 		 255 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0862  membrane lipoprotein lipid attachment site  63.95 
 
 		 256 aa  331  7.000000000000001e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.349098  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2158  tol-pal system protein YbgF  55.51 
 
 		 262 aa  290  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.198251  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0617  hypothetical protein  48.12 
 
 		 267 aa  236  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.144875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  44.29 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  38.72 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  38.55 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  32.49 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  32.09 
 
 		 275 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  28.7 
 
 		 283 aa  97.8  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  28.44 
 
 		 283 aa  96.3  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 266 aa  95.5  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  46 
 
 		 264 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 275 aa  94.7  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  25.26 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  27.92 
 
 		 271 aa  82  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  35.9 
 
 		 325 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  24.84 
 
 		 312 aa  79  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  27.23 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  32.77 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  28.69 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  27.76 
 
 		 322 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  30.51 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  25.44 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  25.42 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  24.72 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  31.17 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1278  tol-pal system protein YbgF  22.98 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  31.73 
 
 		 239 aa  67  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  38.2 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2337  tetratricopeptide region  26.47 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123403  normal  0.0632651 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  30.84 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  28.77 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  28.7 
 
 		 333 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2084  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000361839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  31.31 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4088  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 1057 aa  58.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.475202  normal  0.216306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  32.17 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  27.06 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  28.97 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  28.97 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  28.97 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  26.85 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  26.01 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  24.75 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  28.97 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  24.75 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  24.75 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  25.91 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  26.49 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  26.49 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  25.91 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0070  hypothetical protein  27.78 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0071  tol-pal system protein YbgF  27.78 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.840894  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  26.49 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  26.49 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  26.49 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  30.1 
 
 		 273 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1787  tol-pal system protein YbgF  27.2 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000124758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  22.22 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  26.49 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  26.49 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  26.49 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2536  tol-pal system protein YbgF  27.2 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000911459  hitchhiker  0.000142623 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1859  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 242 aa  53.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000136736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  25.83 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  25.83 
 
 		 262 aa  53.1  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1748  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000756054  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  25.82 
 
 		 248 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1744  Tol-Pal system YbgF  27.2 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000201827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  27.1 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2366  hypothetical protein  27.1 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000582291  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2438  hypothetical protein  27.1 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000167584  normal  0.413869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2529  hypothetical protein  27.1 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000104047  normal  0.0224917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0273  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 243 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0105531  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1609  tetratricopeptide domain-containing protein  26.4 
 
 		 249 aa  52.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000616267  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  30.1 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  26.47 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3396  tol-pal system protein YbgF  26.92 
 
 		 260 aa  52  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.14649  normal  0.0107304 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0301  tol-pal system protein YbgF  22.22 
 
 		 243 aa  52.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.658955  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  27.1 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2204  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 265 aa  52  0.000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000773589 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  25.95 
 
 		 261 aa  52  0.000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  29.13 
 
 		 268 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  29.91 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003911  TPR repeat-containing protein  27.04 
 
 		 250 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.100041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  27.88 
 
 		 242 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1733  TPR domain-containing protein  22.44 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  30.1 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  28.16 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  29.47 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 		 261 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  26.12 
 
 		 345 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  30.1 
 
 		 274 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 248 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>