130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0710 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0710  pentatricopeptide repeat containing protein  100 
 
 		 932 aa  1907    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0248  TPR repeat-containing protein  58.47 
 
 		 793 aa  767    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.57059  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1875  TPR repeat-containing protein  36.99 
 
 		 813 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0657  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 811 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0297  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 922 aa  164  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.276018  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 965 aa  163  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1954  ATPase  30.83 
 
 		 673 aa  157  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342143  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1789  hypothetical protein  29.95 
 
 		 581 aa  152  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0254074 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0026  hypothetical protein  28.39 
 
 		 692 aa  130  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.252057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2442  ATPase  27.35 
 
 		 756 aa  124  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  31.23 
 
 		 1694 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6891  hypothetical protein  26.38 
 
 		 972 aa  112  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.715977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 		 1276 aa  99  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.81 
 
 		 632 aa  97.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.31 
 
 		 927 aa  96.7  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 543 aa  96.3  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  27.3 
 
 		 1007 aa  95.5  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  25.32 
 
 		 573 aa  86.7  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4861  hypothetical protein  28.16 
 
 		 920 aa  86.3  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 878 aa  86.3  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1120  putative transcriptional regulator  24.74 
 
 		 523 aa  80.9  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.64 
 
 		 810 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  26.23 
 
 		 1192 aa  79.7  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4868  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 363 aa  78.2  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.440159  normal  0.306915 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.01 
 
 		 1022 aa  75.9  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 4489 aa  75.5  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 602 aa  74.7  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 4079 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  26.12 
 
 		 462 aa  72.4  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1867  MarR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 369 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 955 aa  68.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2212  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 1276 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.524691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1019  TPR repeat-containing protein  23.55 
 
 		 273 aa  66.6  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 363 aa  65.1  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  28.48 
 
 		 724 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  25.7 
 
 		 761 aa  63.9  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.26 
 
 		 329 aa  62.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.39 
 
 		 707 aa  62.4  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  27.63 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0675  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  28.57 
 
 		 417 aa  62  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  24.6 
 
 		 523 aa  62  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  26.15 
 
 		 784 aa  62  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  25.09 
 
 		 1138 aa  60.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  23.24 
 
 		 711 aa  60.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 3560 aa  60.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 608 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  29.22 
 
 		 576 aa  58.2  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  23.83 
 
 		 1119 aa  57.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.51 
 
 		 730 aa  58.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.8 
 
 		 818 aa  57.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  32.49 
 
 		 994 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 1094 aa  57  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1065  TPR repeat-containing protein  23.28 
 
 		 740 aa  56.2  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 250 aa  55.8  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.29 
 
 		 1056 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 3035 aa  55.5  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  24.21 
 
 		 623 aa  55.8  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.19 
 
 		 1056 aa  55.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28711  hypothetical protein  27.59 
 
 		 334 aa  55.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  26.27 
 
 		 1979 aa  55.1  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1426  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 574 aa  54.7  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2322  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 935 aa  54.7  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0205826 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3016  TPR/sulfotransferase domain-containing protein  25.25 
 
 		 577 aa  54.7  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.86 
 
 		 1737 aa  54.3  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 562 aa  54.3  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.35 
 
 		 988 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.8 
 
 		 706 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  25.53 
 
 		 745 aa  54.3  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  21.77 
 
 		 1060 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 465 aa  53.1  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1311  hypothetical protein  26.07 
 
 		 331 aa  53.5  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1238  TPR repeat-containing protein  26.48 
 
 		 377 aa  53.5  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  24.35 
 
 		 512 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2843  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 907 aa  52.4  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 1054 aa  52.4  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.39 
 
 		 764 aa  52.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  24.82 
 
 		 685 aa  52  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 202 aa  52  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1793  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 213 aa  51.2  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.06 
 
 		 340 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 699 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 		 836 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  26.98 
 
 		 750 aa  50.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  22.34 
 
 		 1013 aa  50.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 634 aa  50.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.52 
 
 		 985 aa  50.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  23.12 
 
 		 452 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1474  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 162 aa  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0444734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  26.12 
 
 		 620 aa  50.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.95 
 
 		 292 aa  49.3  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 649 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  28.24 
 
 		 599 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 662 aa  49.7  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  26.06 
 
 		 795 aa  49.3  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 		 639 aa  49.3  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  27.23 
 
 		 564 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  23.2 
 
 		 1056 aa  48.9  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 654 aa  48.9  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>