More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0673 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 270 aa  542  1e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  81.72 
 
 		 269 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  77.99 
 
 		 269 aa  401  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  78.15 
 
 		 270 aa  393  1e-108  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  69.7 
 
 		 263 aa  353  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  68.94 
 
 		 263 aa  351  5.9999999999999994e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  65.02 
 
 		 269 aa  348  6e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  63.43 
 
 		 269 aa  343  1e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  65.4 
 
 		 268 aa  342  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  65.78 
 
 		 281 aa  328  4e-89  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 269 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  50 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 270 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  50.75 
 
 		 278 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  49.44 
 
 		 278 aa  210  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 290 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  44.98 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  44.15 
 
 		 268 aa  198  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  42.7 
 
 		 269 aa  193  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  42.6 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 278 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0436  TOBE domain-containing protein  66.67 
 
 		 141 aa  188  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 276 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 281 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  38.85 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  41.04 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  41.04 
 
 		 270 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  42.42 
 
 		 263 aa  185  6e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0511  molybdenum-pterin binding protein  65.25 
 
 		 141 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4402  ModE family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 276 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.915653  normal  0.0639822 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  43.27 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  37.84 
 
 		 262 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  40 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 274 aa  177  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  44.07 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  44.07 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  44.07 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  43.61 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  44.07 
 
 		 282 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  44.07 
 
 		 282 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  44.07 
 
 		 282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3324  TOBE domain-containing protein  64.54 
 
 		 141 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  44.44 
 
 		 262 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  39.69 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0810  regulatory protein LysR  42.02 
 
 		 260 aa  166  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3358  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  38.46 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4312  hypothetical protein  38.46 
 
 		 265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 263 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  38.1 
 
 		 260 aa  156  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33430  Molybdenum-binding ModE protein  35.92 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  33.84 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  32.7 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  52.86 
 
 		 142 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 263 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2476  molybdate transport repressor  35.74 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240008  normal  0.243533 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0585  ModE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  32.82 
 
 		 266 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0318  ModE family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.647823  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2034  ModE family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 267 aa  135  7.000000000000001e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.64775  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0363  ModE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0256  transcriptional regulator, ModE family  34.2 
 
 		 264 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00749956 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 263 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6152  TOBE domain-containing protein  46.43 
 
 		 141 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.153781 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6661  TOBE domain-containing protein  46.43 
 
 		 141 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.166904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5767  TOBE domain-containing protein  45.71 
 
 		 141 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.309688  normal  0.727293 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6011  molybdenum-pterin binding  46.43 
 
 		 141 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7726  molybdenum-pterin binding protein  46.43 
 
 		 141 aa  119  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0492  molybdate transport regulator ModE, putative  35.63 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  47.86 
 
 		 140 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5816  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 141 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0469657  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06340  putative molybdenum transport regulator  36.33 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0099259  normal  0.759448 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6181  molybdenum-pterin binding  45.71 
 
 		 141 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2884  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.17 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1252  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.06 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2640  ModE family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 263 aa  117  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0622782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  46.1 
 
 		 141 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1381  molybdenum transport protein ModG, putative  46.43 
 
 		 142 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.656175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4091  ModE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.376442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5721  TOBE domain protein  43.97 
 
 		 177 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.249885  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4689  helix-turn-helix, Fis-type:molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  35.25 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1296  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.2 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3067  DNA-binding transcriptional regulator ModE  32.42 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5121  molybdenum-pterin binding domain (dual function transport/regulation)  42.55 
 
 		 142 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5363  TOBE domain-containing protein  47.52 
 
 		 142 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.288358  normal  0.835722 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2939  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.18 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4842  ModE family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00572189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1416  DNA-binding transcriptional regulator ModE  35.18 
 
 		 298 aa  108  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1267  DNA-binding transcriptional regulator ModE  33.07 
 
 		 263 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0590  molybdenum transport regulator  35.66 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0376287  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2852  DNA-binding transcriptional regulator ModE  34.78 
 
 		 263 aa  106  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  42.86 
 
 		 142 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>