More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0663 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265316  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  66.67 
 
 
249 aa  344  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1270  thiamine biosynthesis protein ThiF  65.48 
 
 
248 aa  333  1e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  61.6 
 
 
247 aa  322  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1567  thiamine biosynthesis protein ThiF  57.6 
 
 
247 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0683473 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.99 
 
 
266 aa  266  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0654  thiF family protein  50.6 
 
 
248 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.59 
 
 
270 aa  260  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.79 
 
 
270 aa  258  6e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3943  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50 
 
 
270 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000910136  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  50 
 
 
248 aa  255  6e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  49.4 
 
 
264 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  50.97 
 
 
269 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  49 
 
 
269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.82 
 
 
270 aa  240  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.8 
 
 
269 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.9 
 
 
258 aa  226  4e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.48 
 
 
270 aa  224  1e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4109  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.29 
 
 
269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1092  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.86 
 
 
284 aa  221  6e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000853267  normal  0.0112488 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.57 
 
 
278 aa  222  6e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.62 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.78 
 
 
364 aa  218  7e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2539  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  45.85 
 
 
270 aa  218  7.999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.214496  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.29 
 
 
287 aa  216  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.4 
 
 
273 aa  216  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.62 
 
 
268 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.56 
 
 
388 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.44 
 
 
272 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.78 
 
 
377 aa  212  4.9999999999999996e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0130  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.8 
 
 
257 aa  211  7e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3793  molybdopterin biosynthesis protein  45.06 
 
 
271 aa  210  1e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.63 
 
 
254 aa  211  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.46 
 
 
244 aa  211  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  44 
 
 
257 aa  210  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  43.6 
 
 
377 aa  209  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1820  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.58 
 
 
262 aa  210  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.107141 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.5 
 
 
348 aa  209  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.23 
 
 
254 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.22 
 
 
395 aa  209  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  40.4 
 
 
245 aa  207  1e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  43.62 
 
 
349 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  44.4 
 
 
377 aa  207  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.83 
 
 
390 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  42.74 
 
 
390 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.43 
 
 
390 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.4 
 
 
386 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1380  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.29 
 
 
271 aa  205  5e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.8 
 
 
380 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.57 
 
 
241 aa  204  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.61 
 
 
379 aa  202  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0364  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41 
 
 
266 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  46.61 
 
 
379 aa  202  3e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.21 
 
 
348 aa  203  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0645  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.38 
 
 
268 aa  201  8e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.63 
 
 
389 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  42.91 
 
 
480 aa  201  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.48 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.64 
 
 
387 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0046  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.08 
 
 
266 aa  199  3e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.34 
 
 
396 aa  199  3e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44 
 
 
260 aa  199  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.97 
 
 
244 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.23 
 
 
392 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.04 
 
 
251 aa  198  6e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  41.37 
 
 
393 aa  197  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0038  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.7 
 
 
278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  0.260889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42 
 
 
393 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.15 
 
 
243 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.87 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.19 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.6 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42 
 
 
383 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1710  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  44.44 
 
 
379 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0074  putative molybdopterin biosynthesis protein moeB  41.7 
 
 
267 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.27 
 
 
383 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.8 
 
 
393 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.13 
 
 
255 aa  195  5.000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.6 
 
 
383 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1774  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  43.92 
 
 
386 aa  195  7e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40 
 
 
393 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.62 
 
 
263 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0617  molybdenum cofactor biosynthesis protein  41.31 
 
 
265 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0522  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.75 
 
 
259 aa  194  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.76 
 
 
264 aa  193  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.157622 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  39.6 
 
 
390 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.57 
 
 
254 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2974  molydopterin biosynthesis protein  41.77 
 
 
346 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  41.96 
 
 
252 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4128  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41 
 
 
270 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117776  normal  0.228572 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.32 
 
 
252 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.6 
 
 
245 aa  192  4e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.4 
 
 
392 aa  192  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.2 
 
 
258 aa  192  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  38.65 
 
 
250 aa  192  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.67 
 
 
274 aa  192  6e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.92 
 
 
250 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  40 
 
 
389 aa  191  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  40.64 
 
 
252 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1602  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.91 
 
 
277 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0340127 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>