More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0622 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0622  dihydrodipicolinate synthase  100 
 
 
296 aa  598  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.260695  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0575  dihydrodipicolinate synthase  81.08 
 
 
296 aa  479  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0699  dihydrodipicolinate synthase  78.38 
 
 
296 aa  473  1e-132  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0536  dihydrodipicolinate synthase  75 
 
 
297 aa  460  9.999999999999999e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.651244  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  74.66 
 
 
297 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1734  dihydrodipicolinate synthase  73.99 
 
 
296 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  73.31 
 
 
296 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2493  dihydrodipicolinate synthase  48.94 
 
 
300 aa  279  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.667256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2421  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 
293 aa  275  6e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000015991  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0032  dihydrodipicolinate synthase  45.39 
 
 
293 aa  272  6e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
290 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  45.55 
 
 
294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  46.58 
 
 
290 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00780  dihydrodipicolinate synthase  48.21 
 
 
308 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.868751  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  47.6 
 
 
292 aa  267  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0358  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 
290 aa  264  1e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.672086  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  48.56 
 
 
290 aa  264  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
294 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  48.2 
 
 
290 aa  263  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  46.9 
 
 
297 aa  262  4.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
319 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
290 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
294 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
294 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
292 aa  259  4e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0583  dihydrodipicolinate synthase  45.24 
 
 
298 aa  259  4e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
292 aa  258  6e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  45.83 
 
 
290 aa  258  8e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
294 aa  258  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  46.02 
 
 
296 aa  257  2e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 
292 aa  256  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
292 aa  256  3e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
301 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  40.89 
 
 
292 aa  255  5e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1200  dihydrodipicolinate synthase  44.11 
 
 
296 aa  255  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
292 aa  255  6e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  44.71 
 
 
291 aa  255  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  45.7 
 
 
301 aa  255  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2816  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 
294 aa  254  9e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.303791  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  46.74 
 
 
293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
293 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
290 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  46.23 
 
 
291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1196  dihydrodipicolinate synthase  45.89 
 
 
321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3007  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
292 aa  252  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0527103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  43.24 
 
 
292 aa  252  6e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  43.94 
 
 
298 aa  251  9.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
300 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
300 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  45.36 
 
 
300 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
301 aa  249  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  48.19 
 
 
292 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2622  dihydrodipicolinate synthase  45.62 
 
 
291 aa  249  3e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  45.02 
 
 
293 aa  250  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
294 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1875  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 
288 aa  249  4e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  42.96 
 
 
289 aa  249  5e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
300 aa  248  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3170  dihydrodipicolinate synthase  45.21 
 
 
323 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0819147  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0697  dihydrodipicolinate synthase  45.08 
 
 
300 aa  248  8e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.111382 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
300 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
300 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
300 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
300 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
300 aa  248  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
300 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  44.33 
 
 
300 aa  248  9e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
320 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  45.61 
 
 
300 aa  247  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  43.69 
 
 
297 aa  246  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 
292 aa  247  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 
291 aa  246  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
296 aa  246  2e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1337  dihydrodipicolinate synthase  43.92 
 
 
298 aa  247  2e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.642823 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  42.27 
 
 
289 aa  246  3e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 
295 aa  246  4e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2097  dihydrodipicolinate synthase  44.07 
 
 
297 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.143233  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  43.99 
 
 
301 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2524  dihydrodipicolinate synthase subfamily protein  45.49 
 
 
292 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5089  dihydrodipicolinate synthase  43.92 
 
 
298 aa  245  6.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00525746 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  41.92 
 
 
289 aa  245  8e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3432  dihydrodipicolinate synthase  44.86 
 
 
296 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4069  dihydrodipicolinate synthase  46.08 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0924  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1010  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  42.47 
 
 
297 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1371  dihydrodipicolinate synthase  43.84 
 
 
292 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.418519  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 
293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3658  dihydrodipicolinate synthase  42.91 
 
 
291 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000862036  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  43.15 
 
 
292 aa  242  6e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1237  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 
295 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.885534 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4192  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 
295 aa  241  7e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1267  dihydrodipicolinate synthase  44.41 
 
 
295 aa  242  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.425377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1427  dihydrodipicolinate synthase  44.67 
 
 
302 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.544407 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4217  dihydrodipicolinate synthase  45.73 
 
 
295 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00266238  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  43.49 
 
 
292 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  44.56 
 
 
292 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 
290 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  44.95 
 
 
290 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2548  dihydrodipicolinate synthase  43.3 
 
 
308 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00128586  normal  0.0288047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>