More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0614 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0567  extracellular solute-binding protein  75.68 
 
 		 608 aa  935    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0614  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 593 aa  1225    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0520  extracellular solute-binding protein family 5  68.45 
 
 		 545 aa  801    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1621  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  72.55 
 
 		 594 aa  876    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1765  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  70.58 
 
 		 596 aa  852    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.220703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0691  extracellular solute-binding protein family 5  74.96 
 
 		 600 aa  916    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0585  extracellular solute-binding protein family 5  70.93 
 
 		 628 aa  858    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.952367  normal  0.0792841 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1420  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  39.27 
 
 		 560 aa  422  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0900  extracellular solute-binding protein family 5  40 
 
 		 561 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0404  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  38.29 
 
 		 562 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.195292  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0982  extracellular solute-binding protein family 5  38.18 
 
 		 567 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0940  extracellular solute-binding protein family 5  38.86 
 
 		 559 aa  414  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1789  extracellular solute-binding protein  38.99 
 
 		 572 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1532  extracellular solute-binding protein family 5  36.11 
 
 		 559 aa  401  9.999999999999999e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0243395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2097  4-phytase  30.48 
 
 		 546 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000775897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.84 
 
 		 538 aa  233  6e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  28.65 
 
 		 538 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0788  extracellular solute-binding protein family 5  29.58 
 
 		 576 aa  229  8e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.301156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2644  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 		 533 aa  228  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0361873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1590  extracellular solute-binding protein family 5  29.8 
 
 		 534 aa  227  4e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1870  dipeptide transport protein  27.78 
 
 		 540 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2655  extracellular solute-binding protein  27.95 
 
 		 539 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000125789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1145  extracellular solute-binding protein  31.08 
 
 		 565 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00838015  normal  0.546746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  30.35 
 
 		 551 aa  213  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1411  extracellular solute-binding protein  29.74 
 
 		 559 aa  211  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2049  extracellular solute-binding protein  28.55 
 
 		 540 aa  210  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2798  extracellular solute-binding protein family 5  28.96 
 
 		 557 aa  202  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1538  extracellular solute-binding protein family 5  28.4 
 
 		 563 aa  193  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000498479  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3501  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 639 aa  161  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1652  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.93 
 
 		 511 aa  160  4e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.2387  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2657  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 617 aa  159  9e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000297428  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0310  extracellular solute-binding protein family 5  26.05 
 
 		 509 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3039  4-phytase  24.31 
 
 		 518 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1450  peptide ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.04 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000430411  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1902  extracellular solute-binding protein family 5  26.09 
 
 		 501 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000145643  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0094  extracellular solute-binding protein  24.86 
 
 		 498 aa  146  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2770  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 618 aa  144  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000172881  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0947  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 622 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0477  extracellular solute-binding protein family 5  24.13 
 
 		 573 aa  140  6e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1979  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.97 
 
 		 516 aa  140  7e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4859  putative ABC transporter, substrate-binding protein  27.49 
 
 		 532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176928  normal  0.590645 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.05 
 
 		 511 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.05 
 
 		 505 aa  137  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2555  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, oligopeptide/dipeptide-binding protein  23.59 
 
 		 580 aa  136  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  23.92 
 
 		 521 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0320  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 556 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.144423 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2258  solute-binding family 5 protein  23.59 
 
 		 579 aa  136  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  23.92 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  23.92 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  23.92 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  23.92 
 
 		 521 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7181  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  24.7 
 
 		 542 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.219647  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 508 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2116  hypothetical protein  24.19 
 
 		 510 aa  134  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  26.17 
 
 		 566 aa  134  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.7 
 
 		 567 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 567 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0599  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 		 619 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.300607 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 575 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0725  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 556 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1649  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 		 584 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.72 
 
 		 511 aa  130  6e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4611  extracellular solute-binding protein family 5  23.49 
 
 		 553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.596915 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1565  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.94 
 
 		 534 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1563  extracellular solute-binding protein  24.15 
 
 		 588 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.176735  normal  0.279007 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3167  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  22.99 
 
 		 542 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3133  twin-arginine translocation pathway signal  23.12 
 
 		 529 aa  127  9e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.362143 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  23.97 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2857  extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 593 aa  126  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.358002 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1651  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 516 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  25.87 
 
 		 575 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0140  peptide/opine/nickel ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.75 
 
 		 534 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259377  normal  0.633025 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0205  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  24.45 
 
 		 575 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0219  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 575 aa  125  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  25.3 
 
 		 575 aa  125  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1860  extracellular solute-binding protein family 5  25.91 
 
 		 544 aa  125  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.44883  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2585  putative ABC transporter, substrate binding subunit  25.93 
 
 		 520 aa  125  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598963 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0366  extracellular solute-binding protein family 5  24.92 
 
 		 607 aa  124  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2571  extracellular solute-binding protein family 5  24.02 
 
 		 529 aa  124  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13754  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1403  extracellular solute-binding protein family 5  25.77 
 
 		 866 aa  123  9e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.254941  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2906  extracellular solute-binding protein family 5  23.61 
 
 		 574 aa  123  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5138  putative periplasmic peptide-binding protein ABC transporter  26.12 
 
 		 495 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0462348 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2761  extracellular solute-binding protein  25.92 
 
 		 544 aa  123  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1273  extracellular solute-binding protein family 5  24.14 
 
 		 593 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3058  extracellular solute-binding protein family 5  26.63 
 
 		 554 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1596  extracellular solute-binding protein family 5  22.92 
 
 		 572 aa  123  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0368881  unclonable  7.93881e-23 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4831  putative ABC transporter (substrate-binding protein)  25.1 
 
 		 527 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153883  normal  0.947205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0359  extracellular solute-binding protein family 5  24.75 
 
 		 607 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7212  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  27.95 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7558  putative dipeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  24.19 
 
 		 515 aa  120  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.864379 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5299  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  25.26 
 
 		 556 aa  120  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2760  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 		 544 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1982  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.35 
 
 		 524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0990283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19910  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  24.51 
 
 		 589 aa  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.000984023  hitchhiker  0.000242655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2592  extracellular solute-binding protein family 5  28.25 
 
 		 573 aa  118  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0266  extracellular solute-binding protein family 5  24.32 
 
 		 575 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7448  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  24.95 
 
 		 626 aa  117  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  25.9 
 
 		 526 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4764  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 539 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0570  extracellular solute-binding protein  23.54 
 
 		 591 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>