222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0609 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0609  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 235 aa  481  1e-135  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0562  methyltransferase type 12  69.96 
 
 		 239 aa  328  3e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0686  Methyltransferase type 12  70.4 
 
 		 236 aa  327  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0580  Methyltransferase type 12  66.2 
 
 		 233 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.260933 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1626  hypothetical protein  64.98 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.220792 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1760  hypothetical protein  61.3 
 
 		 229 aa  292  4e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0515  Methyltransferase type 12  58.22 
 
 		 235 aa  275  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0824  methyltransferase type 12  38.12 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2955  hypothetical protein  30.37 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0919903  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0475  hypothetical protein  28.78 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0149122 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1319  Lipocalin  37.42 
 
 		 260 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00248779 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1383  Methyltransferase type 12  39.51 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.413132  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0452  methyltransferase type 12  29.47 
 
 		 244 aa  101  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.652795 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1764  hypothetical protein  33.77 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3232  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.74588  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0005  methyltransferase small  29.13 
 
 		 264 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1098  methyltransferase small  35.46 
 
 		 210 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.391663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1002  methyltransferase small  28.5 
 
 		 240 aa  89  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1737  Methyltransferase-16, putative  27.44 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.762946 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1029  methyltransferase small  30.39 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0211  Methyltransferase type 12  29.27 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.873381  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0687  hypothetical protein  39.19 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4465  hypothetical protein  38.51 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2589  hypothetical protein  30 
 
 		 240 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.240157 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01421  hypothetical protein  38.53 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232872  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3309  histidine kinase  27.27 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1100  histidine kinase  27.27 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000104684 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3445  histidine kinase  27.27 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00303754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3267  histidine kinase  27.27 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1914  histidine kinase  29.23 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.116894  normal  0.357859 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2848  histidine kinase  27.89 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.531025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2861  histidine kinase  28 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5022  hypothetical protein  33.97 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3014  hypothetical protein  26.92 
 
 		 230 aa  63.5  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4036  histidine kinase  26.28 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06680  hypothetical protein  34.41 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1042  hypothetical protein  35.56 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0546  methyltransferase type 12  35.07 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0557  methyltransferase type 12  37.33 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11350  hypothetical protein  35 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0604927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0573  hypothetical protein  33.59 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92679  predicted protein  34 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36186  predicted protein  26.2 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0513  hypothetical protein  33.59 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0640  hypothetical protein  32.31 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3860  methyltransferase type 12  35.61 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.79296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1892  hypothetical protein  30.77 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.5 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.5 
 
 		 246 aa  54.7  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0564  methyltransferase type 12  36.76 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.85 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 		 234 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92077  predicted protein  30.14 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00026919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.8 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.91 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4015  putative methyltransferase protein  30.77 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.91 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1825  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.21 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1501  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.21 
 
 		 235 aa  52  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3694  putative methyltransferase protein  30.3 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.93 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1820  hypothetical protein  30 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.385222  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.98 
 
 		 232 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2435  hypothetical protein  29.58 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.77423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0437  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.71 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.198029  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3003  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.71 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1630  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 		 232 aa  49.7  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1113  bifunctional 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase and 2-octaprenyl-6-hydroxy phenol methylase  28.33 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2582  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.92 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0956  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.92 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2892  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.92 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2954  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.92 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0191  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.92 
 
 		 247 aa  49.7  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2266  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.35 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.549196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2961  hypothetical protein  30.53 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.210334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0363  hypothetical protein  32.09 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1372  ribosomal protein L11 methyltransferase  33.7 
 
 		 303 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.71577  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0970  hypothetical protein  30 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 266 aa  48.5  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92228  predicted protein  28.12 
 
 		 214 aa  48.5  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2580  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.41 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.7 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46702  predicted protein  34.82 
 
 		 337 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.761256  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  31.46 
 
 		 294 aa  48.1  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44793  predicted protein  28.47 
 
 		 373 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.78 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1730  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.57 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00224217 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0898  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 260 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000544337  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.22 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.4 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.33 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4151  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.35 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.09 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.6 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0914  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.35 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.497259  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  24.46 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26025  predicted protein  29.49 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.904011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0918  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.35 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0317965 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>