More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0598 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 824 aa  717    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 		 854 aa  644    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  48.46 
 
 		 819 aa  811    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 		 813 aa  696    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  45.28 
 
 		 824 aa  693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 		 856 aa  656    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 		 925 aa  661    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  52.91 
 
 		 858 aa  883    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  54.62 
 
 		 804 aa  931    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 		 823 aa  696    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4861  leucyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 802 aa  925    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 802 aa  922    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 		 857 aa  874    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 835 aa  812    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 		 833 aa  867    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2819  leucyl-tRNA synthetase  43.32 
 
 		 832 aa  662    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  45.08 
 
 		 828 aa  672    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 802 aa  925    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 802 aa  924    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 801 aa  771    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 802 aa  925    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 826 aa  682    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  80.99 
 
 		 807 aa  1389    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 987 aa  673    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 838 aa  662    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  45.24 
 
 		 827 aa  701    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 807 aa  744    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3090  leucyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 		 834 aa  673    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.373943 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4851  leucyl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 802 aa  928    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  42.87 
 
 		 865 aa  669    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 819 aa  696    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 872 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 824 aa  694    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  43.08 
 
 		 819 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 969 aa  671    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 851 aa  679    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  79.38 
 
 		 805 aa  1343    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 816 aa  666    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  77.76 
 
 		 805 aa  1343    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 		 904 aa  678    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 824 aa  702    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 829 aa  670    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 952 aa  695    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  55.02 
 
 		 802 aa  925    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 		 825 aa  717    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 865 aa  668    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 806 aa  864    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  48.97 
 
 		 804 aa  793    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  55.57 
 
 		 802 aa  928    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 829 aa  711    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 858 aa  665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 805 aa  900    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 		 805 aa  900    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 		 819 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  49.25 
 
 		 879 aa  807    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  51.4 
 
 		 857 aa  865    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 954 aa  705    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  54.52 
 
 		 802 aa  916    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 814 aa  699    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 805 aa  1670    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 813 aa  692    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01672  leucyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 867 aa  647    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_56599  predicted protein  49.1 
 
 		 899 aa  799    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  44.4 
 
 		 819 aa  646    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1563  leucyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 810 aa  721    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.954503  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 971 aa  698    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  45.7 
 
 		 817 aa  693    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4328  leucyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 827 aa  690    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000117584  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 816 aa  647    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 816 aa  659    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0386  leucyl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 802 aa  923    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf171  leucyl-tRNA synthetase  47.49 
 
 		 804 aa  746    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  44.46 
 
 		 824 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  75.9 
 
 		 806 aa  1313    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  40.22 
 
 		 1016 aa  676    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  46.82 
 
 		 824 aa  726    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 		 824 aa  708    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  43.98 
 
 		 826 aa  662    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 829 aa  831    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 829 aa  876    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  53.83 
 
 		 804 aa  856    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  54.05 
 
 		 808 aa  903    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  51.89 
 
 		 833 aa  856    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2247  leucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 843 aa  641    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4875  leucyl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 802 aa  922    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0380  leucyl-tRNA synthetase  46.76 
 
 		 806 aa  786    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  45.13 
 
 		 825 aa  712    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  41.83 
 
 		 949 aa  682    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 823 aa  694    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  79.63 
 
 		 816 aa  1348    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  43.43 
 
 		 904 aa  687    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 840 aa  822    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 971 aa  698    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  78.51 
 
 		 806 aa  1313    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 968 aa  686    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  41.53 
 
 		 864 aa  646    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1861  leucyl-tRNA synthetase  44.32 
 
 		 829 aa  694    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911399  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 815 aa  652    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 817 aa  641    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  42.66 
 
 		 971 aa  698    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>