111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0579 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0579  esterase, putative  100 
 
 		 324 aa  669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1400  phospholipase/Carboxylesterase  36.28 
 
 		 325 aa  203  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1204  phospholipase/carboxylesterase  33.11 
 
 		 335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.299935  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3217  hypothetical protein  37.55 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2408  carbohydrate esterase family 1 protein  28.99 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.211104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5398  hypothetical protein  31.64 
 
 		 302 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3891  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  31.75 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.947481  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07050  hypothetical protein  33.22 
 
 		 322 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3127  phospholipase/Carboxylesterase  33.82 
 
 		 314 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0646  hypothetical protein  35.97 
 
 		 322 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0297  lpqC, putative  30.77 
 
 		 306 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.433259  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5085  polyhydroxybutyrate depolymerase  31.06 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  normal  0.355318 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13327  esterase lipoprotein lpqC  33.69 
 
 		 304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000167103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0967  putative esterase  36.99 
 
 		 244 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.127871 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1493  phospholipase/Carboxylesterase  31.44 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.030471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3854  putative lipoprotein  33.71 
 
 		 336 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.496382  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1969  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.16 
 
 		 363 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0935555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0373  polyhydroxybutyrate depolymerase  29.96 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0880654  hitchhiker  0.00622899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2752  phospholipase/carboxylesterase  28.03 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3566  phospholipase/carboxylesterase  28.17 
 
 		 331 aa  97.4  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  28.47 
 
 		 795 aa  96.7  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1651  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.14 
 
 		 323 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0627752  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  24.83 
 
 		 464 aa  90.1  5e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1573  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.26 
 
 		 326 aa  89.4  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4460  polyhydroxybutyrate depolymerase  27.59 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.403398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4595  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  27.68 
 
 		 344 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0726  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.86 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401494  normal  0.100919 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1953  putative hydrolase  25.53 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0001445  hitchhiker  0.00199711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1590  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  28.62 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255211  normal  0.12664 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10685  lipoprotein lpqP  30.33 
 
 		 280 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0080  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  26.99 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  25.8 
 
 		 1002 aa  70.1  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1167  hypothetical protein  25.09 
 
 		 471 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.428408  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2301  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  29.67 
 
 		 232 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3485  hypothetical protein  29.01 
 
 		 269 aa  67  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1290  hypothetical protein  28.57 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0072  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  31.72 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3487  hypothetical protein  23.89 
 
 		 332 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3106  putative lipoprotein  24.9 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2261  putative esterase/lipase/thioesterase  23.61 
 
 		 361 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.556081  normal  0.0820217 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4407  PHB depolymerase family esterase  27.9 
 
 		 398 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.32684  normal  0.707171 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7236  putative LpqP (hydrolase/esterase)  34.02 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0397136  normal  0.31443 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3576  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  25.45 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.875939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2906  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  27.46 
 
 		 659 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686004  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00180  conserved hypothetical protein  28.47 
 
 		 340 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2268  esterase, PHB depolymerase family  27.44 
 
 		 344 aa  54.3  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.493113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  24.53 
 
 		 518 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4883  PHB depolymerase family esterase  28.66 
 
 		 369 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.103512  hitchhiker  0.0011428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4958  esterase, PHB depolymerase family  24.06 
 
 		 451 aa  53.1  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.348858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  29.88 
 
 		 287 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1990  esterase, PHB depolymerase family  35 
 
 		 406 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000642829  normal  0.085302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1945  esterase, PHB depolymerase family  28.36 
 
 		 344 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.198099  normal  0.0353299 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2149  hypothetical protein  26.12 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000536767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2059  phospholipase/carboxylesterase  27.61 
 
 		 343 aa  50.4  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.550035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2066  phospholipase/carboxylesterase  23.5 
 
 		 238 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.565731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2991  PHB depolymerase family esterase  32.41 
 
 		 419 aa  50.1  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4502  esterase, PHB depolymerase  29.92 
 
 		 365 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42248  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3862  PHB depolymerase family esterase  29.92 
 
 		 365 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0810078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2770  PHB depolymerase family esterase  27.82 
 
 		 544 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3665  PHB depolymerase family esterase  29.92 
 
 		 365 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.131134  normal  0.75521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3270  esterase, PHB depolymerase  28.79 
 
 		 372 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.67973 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0284  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like  30.07 
 
 		 215 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2846  esterase, PHB depolymerase  25.19 
 
 		 398 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1173  esterase, PHB depolymerase family  24.33 
 
 		 410 aa  48.9  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2056  esterase, PHB depolymerase family  23.86 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2234  esterase, PHB depolymerase  29.13 
 
 		 369 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.111052  normal  0.321017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1447  hypothetical protein  28.28 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.101367  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1285  esterase, PHB depolymerase family  29.46 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.29485  normal  0.060549 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2257  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase-like protein  23.81 
 
 		 270 aa  48.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0535  esterase, PHB depolymerase family  26.28 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.660761  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0493  esterase, PHB depolymerase family  25.53 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0595  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  24.65 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1020  hypothetical protein  29.33 
 
 		 260 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1940  PHB depolymerase family esterase  30.36 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6990  phospholipase/Carboxylesterase  28.25 
 
 		 276 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0030979 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0301  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  25.95 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0865  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  25.95 
 
 		 367 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3990  Poly (3-hydroxybutyrate ) depolymerase  26.9 
 
 		 396 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1480  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  25.95 
 
 		 382 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289263  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1676  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  25.95 
 
 		 382 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.254076  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2562  depolymerase  25.95 
 
 		 382 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2425  PHB depolymerase family esterase  25.95 
 
 		 382 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0332  polyhydroxybutyrate depolymerase domain-containing protein  25.95 
 
 		 364 aa  46.2  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  26.62 
 
 		 447 aa  46.2  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6802  esterase, PHB depolymerase family  24.63 
 
 		 398 aa  45.8  0.0009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0419644  decreased coverage  0.000000125026 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2576  esterase, PHB depolymerase  26.26 
 
 		 396 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.225739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6529  hypothetical protein  22.67 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0555425 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06093  Acetylxylan esterase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFS5]  27.59 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00247339 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05267  feruloyl esterase (Eurofung)  22.64 
 
 		 270 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2713  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.95 
 
 		 492 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381426  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1105  phospholipase/carboxylesterase  25 
 
 		 253 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.320599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  22.61 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4749  esterase, PHB depolymerase family  23.95 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4905  Ricin B lectin  24.82 
 
 		 461 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31730  esterase, PHB depolymerase family  29.75 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4230  phospholipase/Carboxylesterase  22.81 
 
 		 268 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.58568  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3660  PHB depolymerase family esterase  32.35 
 
 		 381 aa  44.3  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.741995  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.92 
 
 		 501 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0824  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.29 
 
 		 492 aa  43.5  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0168099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1547  poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.29 
 
 		 492 aa  43.9  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>