More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0561 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0561  Inositol-phosphate phosphatase  100 
 
 
268 aa  551  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0543  inositol-phosphate phosphatase  77.39 
 
 
263 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0661  Inositol-phosphate phosphatase  77.1 
 
 
265 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.432346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0546  Inositol-phosphate phosphatase  71.86 
 
 
266 aa  390  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0500  Inositol-phosphate phosphatase  68.2 
 
 
261 aa  374  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0161  extragenic suppressor protein SuhB  70.99 
 
 
267 aa  366  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1639  inositol-1(or 4)-monophosphatase  70.73 
 
 
293 aa  357  9e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0826  inositol monophosphatase  45.35 
 
 
272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.229284 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0719  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.87 
 
 
265 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000761228  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0813  inositol monophosphatase  44.32 
 
 
268 aa  233  3e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000261138  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1231  myo-inositol-1(or 4)-monophosphatase  46.27 
 
 
263 aa  226  4e-58  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0360912  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2063  Inositol-phosphate phosphatase  44.92 
 
 
259 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.948209  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0818  Inositol-phosphate phosphatase  42.42 
 
 
267 aa  225  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0219186  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0669  inositol monophosphate family protein  42.42 
 
 
267 aa  225  7e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1711  inositol monophosphatase family protein  43.65 
 
 
263 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1280  inositol-1-monophosphatase  45.88 
 
 
266 aa  224  1e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1653  inositol monophosphatase family protein  43.65 
 
 
263 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2875  inositol-phosphate phosphatase  45.91 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000220191 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0614  inositol monophosphatase  46.25 
 
 
266 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000550019  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1772  inositol-phosphate phosphatase  47.08 
 
 
283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.32038  hitchhiker  0.00184964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2153  inositol-phosphate phosphatase  48.58 
 
 
267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.38913  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1205  inositol-phosphate phosphatase  42.06 
 
 
263 aa  218  6e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.7767  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1295  extragenic suppressor protein SuhB  43.23 
 
 
271 aa  218  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0672  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.82 
 
 
273 aa  217  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000135062  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2186  inositol monophosphatase  46.27 
 
 
259 aa  217  2e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1244  inositol-phosphate phosphatase  41.29 
 
 
266 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2321  inositol monophosphatase  49.17 
 
 
267 aa  216  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000655872  normal  0.931835 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1160  inositol monophosphatase  41.35 
 
 
268 aa  215  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00412225  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1815  inositol-phosphate phosphatase  46.21 
 
 
267 aa  215  5e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00063204  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2282  inositol monophosphatase  45.28 
 
 
266 aa  215  5.9999999999999996e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.476526  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3515  inositol-phosphate phosphatase  43.07 
 
 
271 aa  215  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.588619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1735  inositol-phosphate phosphatase  46.21 
 
 
267 aa  215  7e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2284  inositol monophosphatase  46.21 
 
 
267 aa  215  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00357051  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14680  extragenic suppressor protein SuhB  42.48 
 
 
271 aa  215  8e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2609  inositol monophosphatase family protein  43.82 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1957  Inositol-phosphate phosphatase  47.37 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000619286  normal  0.0182477 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2390  inositol-phosphate phosphatase  47.37 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000252035  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2506  inositol-phosphate phosphatase  47.37 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.024533  normal  0.0296693 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2401  inositol-phosphate phosphatase  47.37 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0002318  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3185  inositol monophosphatase  43.75 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.777404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40440  Inositol-1-monophosphatase  42.37 
 
 
268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.443027  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0838  inositol-phosphate phosphatase  42.75 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976712  normal  0.859665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0868  inositol-phosphate phosphatase  42.75 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.409513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4340  inositol-phosphate phosphatase  42.96 
 
 
272 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.957686  hitchhiker  0.00000000805299 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2260  extragenic suppressor protein SuhB  45.83 
 
 
267 aa  211  1e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0881  inositol-phosphate phosphatase  42.75 
 
 
272 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0394211 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1289  extragenic suppressor protein SuhB  44.32 
 
 
267 aa  211  1e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.077456  normal  0.0155379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1321  inositol-phosphate phosphatase  42.86 
 
 
262 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0218475  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1419  inositol-1-monophosphatase  41.73 
 
 
271 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57884  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1233  inositol monophosphatase  41.73 
 
 
271 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.901192  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2518  Inositol-phosphate phosphatase  43.07 
 
 
267 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000560671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2841  inositol-1(or 4)-monophosphatase  44.44 
 
 
330 aa  209  5e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202978  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1681  inositol monophosphatase  44.75 
 
 
268 aa  208  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1619  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.32 
 
 
267 aa  207  1e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.28291 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1410  inositol-1(or 4)-monophosphatase  42.8 
 
 
267 aa  207  2e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02425  inositol monophosphatase  43.45 
 
 
267 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.648235  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1135  Inositol-phosphate phosphatase  43.45 
 
 
267 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915199  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2818  inositol monophosphatase  43.45 
 
 
267 aa  206  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000612182  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3765  inositol monophosphatase  43.45 
 
 
267 aa  206  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0228752  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2685  inositol monophosphatase  43.45 
 
 
267 aa  206  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000252767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1144  inositol monophosphatase  43.45 
 
 
267 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.221581  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2908  inositol monophosphatase  43.45 
 
 
267 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000930444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2686  inositol monophosphatase  43.45 
 
 
267 aa  206  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.10987  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02389  hypothetical protein  43.45 
 
 
267 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.516636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1076  inositol monophosphatase  45.3 
 
 
263 aa  206  4e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0543949  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2746  inositol monophosphatase  43.45 
 
 
267 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139672  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1218  inositol-phosphate phosphatase  43.87 
 
 
431 aa  205  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2787  inositol monophosphatase  43.45 
 
 
267 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0013173  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2701  inositol monophosphatase  43.07 
 
 
267 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1484  inositol-phosphate phosphatase  47.79 
 
 
266 aa  203  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.145709  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4616  inositol monophosphatase  40.45 
 
 
272 aa  203  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00318187  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1510  inositol monophosphatase  45.17 
 
 
266 aa  203  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2921  inositol monophosphatase  43.07 
 
 
267 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0208321  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01351  inositol-1-monophosphatase  45.49 
 
 
255 aa  203  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0018  inositol monophosphatase  45.24 
 
 
266 aa  203  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000389361  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2808  inositol monophosphatase  43.07 
 
 
267 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0630411  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1095  Inositol-phosphate phosphatase  42.22 
 
 
270 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.47624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2273  inositol monophosphatase  44.11 
 
 
266 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0668825  normal  0.139934 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1001  Inositol-phosphate phosphatase  42.22 
 
 
270 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.165549  normal  0.0783515 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1796  inositol-phosphate phosphatase  39.85 
 
 
269 aa  202  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3672  extragenic suppressor protein SuhB  42.86 
 
 
266 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1160  inositol monophosphatase  44 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728684  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2101  inositol-phosphate phosphatase  44 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0413503  hitchhiker  0.00162908 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1454  inositol monophosphatase  46.98 
 
 
267 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00259546  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0854  inositol monophosphatase  41.18 
 
 
262 aa  201  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0898  Inositol-phosphate phosphatase  42.59 
 
 
265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000281614  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2892  inositol-1(or 4)-monophosphatase  43.65 
 
 
300 aa  199  3e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2428  inositol monophosphatase  44.81 
 
 
267 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.857801  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1397  inositol-phosphate phosphatase  42.91 
 
 
267 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.500053  hitchhiker  0.000599171 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0984  Inositol-phosphate phosphatase  43.09 
 
 
284 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.594779  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1232  inositol-1(or 4)-monophosphatase  45.31 
 
 
259 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.223718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0078  inositol-phosphate phosphatase  42.23 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.105293 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1712  hypothetical protein  41.18 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1712  hypothetical protein  41.18 
 
 
261 aa  196  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3030  inositol monophosphatase  42.59 
 
 
268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0983926  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3630  inositol monophosphatase  42.32 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0471893  normal  0.858784 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2706  inositol monophosphatase  46.4 
 
 
266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000310915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2309  inositol-phosphate phosphatase  45.26 
 
 
304 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.315096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1078  inositol monophosphatase  45.2 
 
 
273 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.701332  normal  0.180258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4248  inositol-phosphate phosphatase  45.69 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0646891  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>