More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0535 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0535  quinolinate synthetase  100 
 
 
318 aa  654    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.159363  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0821  quinolinate synthetase  74.43 
 
 
323 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0646463  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0868  quinolinate synthetase  68.04 
 
 
324 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  65.92 
 
 
311 aa  449  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0575  quinolinate synthetase  68.33 
 
 
321 aa  441  1e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.426924 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1168  quinolinate synthetase  65.13 
 
 
319 aa  442  1e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.975309  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  66 
 
 
322 aa  432  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1991  quinolinate synthetase  61.41 
 
 
324 aa  395  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2907  quinolinate synthetase complex subunit A  59.62 
 
 
320 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2446  quinolinate synthetase  58.17 
 
 
323 aa  379  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1795  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.2 
 
 
330 aa  374  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0314  quinolinate synthetase  58.88 
 
 
323 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104012 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0815  quinolinate synthetase  56.91 
 
 
325 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659444  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0787  quinolinate synthetase  56.91 
 
 
325 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1448  quinolinate synthetase  58.94 
 
 
320 aa  363  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  58.82 
 
 
317 aa  362  3e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0742  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.63 
 
 
334 aa  361  8e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0225103 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4975  quinolinate synthetase complex, A subunit  57.38 
 
 
322 aa  360  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  56.49 
 
 
322 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0013  quinolinate synthetase complex, A subunit  53.62 
 
 
332 aa  353  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4055  quinolinate synthetase complex, A subunit  55.52 
 
 
310 aa  349  3e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  53.67 
 
 
329 aa  333  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4715  quinolinate synthetase  52.08 
 
 
348 aa  332  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0705171  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  52.84 
 
 
310 aa  329  3e-89  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  51.46 
 
 
310 aa  329  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5129  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.88 
 
 
329 aa  330  3e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0089  quinolinate synthetase  52 
 
 
332 aa  327  2.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4733  quinolinate synthetase complex, A subunit  50.98 
 
 
331 aa  326  3e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.975521  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15631  quinolinate synthetase  49.68 
 
 
333 aa  325  5e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.798596 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07931  quinolinate synthetase  52.29 
 
 
312 aa  322  7e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00907888 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  50.84 
 
 
304 aa  318  9e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07331  quinolinate synthetase  50.5 
 
 
304 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.269483  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0112  quinolinate synthetase  49.5 
 
 
328 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0390837  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07381  quinolinate synthetase  49.16 
 
 
328 aa  316  3e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0067481 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  50.5 
 
 
304 aa  316  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07511  quinolinate synthetase  50.17 
 
 
304 aa  315  6e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0036  quinolinate synthetase  52.32 
 
 
314 aa  315  7e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.529941  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  52.06 
 
 
338 aa  315  9e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0015  quinolinate synthetase  50.5 
 
 
313 aa  314  9.999999999999999e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  46.62 
 
 
307 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1578  quinolinate synthetase  44.05 
 
 
308 aa  282  6.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  43.65 
 
 
304 aa  281  9e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.15 
 
 
298 aa  278  7e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  44.12 
 
 
308 aa  276  4e-73  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.18 
 
 
303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2150  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.83 
 
 
311 aa  271  2e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.484842  normal  0.0905755 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3480  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.02 
 
 
304 aa  270  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  46.94 
 
 
303 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0969  quinolinate synthetase  45.03 
 
 
315 aa  269  4e-71  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.814185  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.45 
 
 
301 aa  266  4e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3586  quinolinate synthetase  44.7 
 
 
305 aa  266  4e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00023844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.18 
 
 
304 aa  265  5e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  45.1 
 
 
306 aa  264  1e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0015  quinolinate synthetase  44.04 
 
 
323 aa  263  3e-69  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0180835  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0376  quinolinate synthetase  44.37 
 
 
301 aa  263  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  43.61 
 
 
304 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  45.3 
 
 
304 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0382  quinolinate synthetase  44.52 
 
 
301 aa  261  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  45 
 
 
324 aa  261  8e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  43.61 
 
 
304 aa  261  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  42.95 
 
 
304 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0531  quinolinate synthetase  43.32 
 
 
308 aa  260  2e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.119326  normal  0.153731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  44.3 
 
 
304 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.67 
 
 
303 aa  260  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  45.82 
 
 
307 aa  260  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1164  quinolinate synthetase  41.8 
 
 
331 aa  259  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  43.61 
 
 
304 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  42.3 
 
 
302 aa  256  4e-67  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1680  quinolinate synthetase  42.21 
 
 
306 aa  256  4e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100379  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1757  quinolinate synthetase complex, A subunit  43 
 
 
303 aa  255  9e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  42.28 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1159  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.49 
 
 
341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0614  quinolinate synthetase  41.83 
 
 
306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.853545  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  42.3 
 
 
302 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  38.16 
 
 
308 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1772  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.69 
 
 
323 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000830693  normal  0.199956 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1964  quinolinate synthetase  42.49 
 
 
395 aa  250  3e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.28 
 
 
306 aa  249  5e-65  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1239  quinolinate synthetase complex subunit A  41.48 
 
 
318 aa  248  8e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.61 
 
 
302 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0891  quinolinate synthetase  39.68 
 
 
358 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000130385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3413  quinolinate synthetase  42.68 
 
 
334 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.235688  normal  0.127536 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1145  quinolinate synthetase  42.58 
 
 
326 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0492282 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1865  quinolinate synthetase  41.64 
 
 
304 aa  243  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.210788 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  41.18 
 
 
302 aa  243  3e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11610  quinolinate synthetase  39.56 
 
 
349 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.681965  normal  0.363525 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.14 
 
 
298 aa  243  5e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3427  quinolinate synthetase  42.72 
 
 
334 aa  241  9e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2476  quinolinate synthetase complex, A subunit  48.39 
 
 
320 aa  241  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0575  quinolinate synthetase  39.06 
 
 
332 aa  241  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.120653  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1696  quinolinate synthetase  41.74 
 
 
353 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10830  quinolinate synthetase  41.12 
 
 
335 aa  240  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.324254  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2010  quinolinate synthetase complex, A subunit  39.88 
 
 
349 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.701511  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3619  quinolinate synthetase  40.19 
 
 
347 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.170829  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3085  quinolinate synthetase  40.38 
 
 
337 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3068  quinolinate synthetase  40.38 
 
 
337 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.736779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3128  quinolinate synthetase  40.38 
 
 
337 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.860453 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4593  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.77 
 
 
346 aa  239  5.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0283  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2798  quinolinate synthetase  38.94 
 
 
347 aa  238  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.658342  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3346  quinolinate synthetase  43 
 
 
334 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.816323  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>