More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0473 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 928 aa  647    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 928 aa  647    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  41.77 
 
 		 928 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  42.98 
 
 		 891 aa  684    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  41.79 
 
 		 926 aa  674    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  39.87 
 
 		 949 aa  684    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  43.23 
 
 		 924 aa  707    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  40.6 
 
 		 906 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  40.77 
 
 		 932 aa  662    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  41.63 
 
 		 928 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  41.02 
 
 		 930 aa  669    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 922 aa  645    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  44.03 
 
 		 893 aa  711    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 935 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 921 aa  652    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  41.51 
 
 		 934 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 926 aa  648    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  42.22 
 
 		 896 aa  662    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  42.55 
 
 		 896 aa  669    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 940 aa  638    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  42.16 
 
 		 931 aa  666    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  41.54 
 
 		 928 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 956 aa  676    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  40.59 
 
 		 939 aa  645    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 941 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  41.56 
 
 		 928 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  39.87 
 
 		 937 aa  637    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  41.01 
 
 		 930 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 923 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  42.35 
 
 		 903 aa  674    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  44.58 
 
 		 893 aa  718    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  65.1 
 
 		 936 aa  1189    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  42.24 
 
 		 891 aa  695    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 903 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  66.67 
 
 		 945 aa  1263    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  41.45 
 
 		 921 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  62.16 
 
 		 924 aa  1158    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  40.35 
 
 		 915 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  42.96 
 
 		 892 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 939 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 921 aa  658    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 928 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  42.2 
 
 		 892 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  42.01 
 
 		 892 aa  675    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 905 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  41.52 
 
 		 928 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 963 aa  661    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  40.22 
 
 		 926 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  63.04 
 
 		 950 aa  1194    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  41.2 
 
 		 933 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  41.63 
 
 		 928 aa  649    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 928 aa  647    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  42.4 
 
 		 928 aa  663    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  100 
 
 		 943 aa  1934    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  41.83 
 
 		 939 aa  706    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 945 aa  650    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 926 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  41.67 
 
 		 928 aa  647    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 934 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  40.77 
 
 		 945 aa  643    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 929 aa  661    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  40.64 
 
 		 922 aa  644    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  41.52 
 
 		 928 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  42.27 
 
 		 888 aa  652    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  40.23 
 
 		 928 aa  640    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 946 aa  702    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 917 aa  635    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  41.95 
 
 		 929 aa  668    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  40.42 
 
 		 951 aa  656    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  42.12 
 
 		 892 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 922 aa  640    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 922 aa  641    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  40.37 
 
 		 912 aa  638    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  40.45 
 
 		 918 aa  635    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 928 aa  647    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  39.92 
 
 		 937 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 939 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.82 
 
 		 892 aa  641    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  39.87 
 
 		 936 aa  672    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 923 aa  647    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 926 aa  648    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 923 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 908 aa  639    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 928 aa  647    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  66.98 
 
 		 944 aa  1266    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 922 aa  650    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  41.86 
 
 		 893 aa  655    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  68.7 
 
 		 946 aa  1328    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  40.93 
 
 		 923 aa  658    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 926 aa  648    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 932 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 924 aa  633  1e-180  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 932 aa  634  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 907 aa  633  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  39.37 
 
 		 938 aa  634  1e-180  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 910 aa  634  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  41.01 
 
 		 918 aa  635  1e-180  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 932 aa  634  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  40.84 
 
 		 926 aa  631  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 942 aa  632  1e-179  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>