More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0402 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1840  Patatin  50.44 
 
 		 900 aa  887    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2385  Patatin  60.51 
 
 		 894 aa  1115    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0362  hypothetical protein  61.19 
 
 		 875 aa  1083    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  48.53 
 
 		 981 aa  903    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2040  surface antigen (D15)  50.55 
 
 		 909 aa  918    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.813925 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0402  surface antigen (D15)  100 
 
 		 950 aa  1931    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.858509  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  62.15 
 
 		 923 aa  1180    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20870  hypothetical protein  41.5 
 
 		 728 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.817283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4020  patatin  40.27 
 
 		 728 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160946 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4514  patatin  40.27 
 
 		 751 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1791  hypothetical protein  40.59 
 
 		 728 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1397  patatin  39.93 
 
 		 728 aa  193  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3803  patatin  39.73 
 
 		 727 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.799265  hitchhiker  0.00000293733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1816  patatin  38.51 
 
 		 728 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0435  patatin  36.53 
 
 		 751 aa  182  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00139608  decreased coverage  0.00000000672418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0323  patatin  38.75 
 
 		 735 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000755516  normal  0.0106628 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1471  patatin  39.1 
 
 		 733 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.553855  normal  0.134739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0430  patatin  38.01 
 
 		 739 aa  172  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.2569  normal  0.405948 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3685  Patatin  33.01 
 
 		 720 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000342926  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3929  patatin  34.12 
 
 		 737 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000709115  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3909  patatin  34.12 
 
 		 738 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000966561  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3852  Patatin  34.12 
 
 		 738 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00970151  unclonable  0.00000000000304178 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0423  patatin  38.18 
 
 		 738 aa  168  4e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3628  patatin-like phospholipase family protein  35.71 
 
 		 735 aa  168  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0428  hypothetical protein  37.46 
 
 		 736 aa  168  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3427  patatin  37.59 
 
 		 737 aa  168  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000209875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0432  patatin  36.99 
 
 		 738 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00104069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3595  patatin  36.99 
 
 		 738 aa  168  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0117026  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4050  patatin  33.83 
 
 		 738 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.129924  normal  0.182704 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0605  patatin  36.9 
 
 		 767 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37871  normal  0.778619 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2052  Patatin  33.94 
 
 		 740 aa  166  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.185363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3773  patatin  32.14 
 
 		 754 aa  165  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0887  patatin  34.27 
 
 		 741 aa  162  2e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0379  hypothetical protein  37.36 
 
 		 734 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.101428  normal  0.24493 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3413  patatin  35.62 
 
 		 738 aa  162  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.016604  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0727  patatin  32.02 
 
 		 760 aa  162  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3379  patatin  36.9 
 
 		 737 aa  162  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01780  putative patatin-like phospholipase  31.25 
 
 		 740 aa  161  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0846  Outer membrane protein  38.18 
 
 		 930 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.558607  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0430  patatin-like phospholipase  39.18 
 
 		 753 aa  159  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.622197  normal  0.410505 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2193  patatin-like phospholipase  38.18 
 
 		 920 aa  159  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.193867  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0818  OMP85 family outer membrane protein  38.55 
 
 		 933 aa  159  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.840835  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5258  patatin  36.88 
 
 		 777 aa  159  3e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1589  OMP85 family outer membrane protein  38.46 
 
 		 728 aa  159  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0034  OMP85 family outer membrane protein  38.55 
 
 		 945 aa  159  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.987848  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0755  patatin  37.77 
 
 		 804 aa  158  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.183935  hitchhiker  0.00235893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1781  OMP85 family outer membrane protein  38.69 
 
 		 852 aa  158  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0391  patatin  36.51 
 
 		 790 aa  157  6e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0374937 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1271  Patatin  32.56 
 
 		 775 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3684  patatin  38.38 
 
 		 813 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0989446  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5919  hypothetical protein  36.62 
 
 		 750 aa  155  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.502789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0503  patatin  33.95 
 
 		 748 aa  155  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5351  patatin  37.64 
 
 		 803 aa  155  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.346462  normal  0.119871 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4937  patatin  37.64 
 
 		 803 aa  155  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000295709 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0838  Patatin  38.97 
 
 		 667 aa  155  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.507854 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3431  patatin  37.27 
 
 		 803 aa  153  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.805545  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1334  patatin-like protein of phospholipase family protein  34.81 
 
 		 745 aa  153  1e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.425162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4884  patatin  38.01 
 
 		 798 aa  153  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000395852 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4367  patatin  38.01 
 
 		 796 aa  153  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.753572  normal  0.0149161 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0939  patatin family phospholipase  38.64 
 
 		 714 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4068  patatin  30.94 
 
 		 733 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.288798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2996  Patatin  31.97 
 
 		 746 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000124103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0461  Patatin  36.11 
 
 		 707 aa  137  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1473  Patatin  33.33 
 
 		 745 aa  137  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03442  hypothetical protein  33.66 
 
 		 771 aa  132  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002569  hypothetical protein  31.64 
 
 		 776 aa  131  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.765659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1351  Patatin  32.53 
 
 		 256 aa  125  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019632  normal  0.0919184 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1467  patatin  30.56 
 
 		 311 aa  124  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0325  patatin-like phospholipase family protein  30 
 
 		 275 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_266  patatin-like phospholipase  29.35 
 
 		 275 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2396  patatin  30.34 
 
 		 333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0132  hypothetical protein  31.83 
 
 		 764 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.948806  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1467  Patatin  30.34 
 
 		 320 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.664226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1562  Patatin  30.34 
 
 		 320 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0111383  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0765  phospholipase, putative  31.29 
 
 		 272 aa  118  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.557245  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0304  patatin  28.57 
 
 		 275 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2124  patatin  30.03 
 
 		 311 aa  115  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0232025  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1378  patatin  32.11 
 
 		 358 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000417303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  30.72 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2630  patatin  27.76 
 
 		 263 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000390545  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1864  patatin  31.91 
 
 		 293 aa  111  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00450091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0302  patatin  30.9 
 
 		 302 aa  112  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1002  Patatin  29.31 
 
 		 273 aa  111  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5366  patatin  31.25 
 
 		 308 aa  111  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00588033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03596  lipoprotein  28.75 
 
 		 345 aa  110  9.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10170  Patatin  28.77 
 
 		 260 aa  110  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1959  patatin  31.83 
 
 		 302 aa  110  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00223857  normal  0.276293 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2496  Patatin  32.65 
 
 		 317 aa  110  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000766649  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0909  Patatin  27.8 
 
 		 310 aa  110  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0042  patatin  29.45 
 
 		 346 aa  109  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4900  phospholipase, putative  30.32 
 
 		 259 aa  108  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0051  lipoprotein  29.45 
 
 		 346 aa  109  3e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.678832  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0066  alpha-beta hydrolase family esterase  31.43 
 
 		 310 aa  108  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2076  patatin  31.01 
 
 		 306 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000287945  normal  0.783577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1874  Lysophospholipase  28.52 
 
 		 262 aa  108  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6020  patatin  31.01 
 
 		 305 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0050744  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2057  patatin  31.01 
 
 		 305 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000544738  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3686  patatin-like phospholipase  27.08 
 
 		 263 aa  108  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.239904  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1211  phospholipase, patatin family  27.94 
 
 		 263 aa  108  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000104019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0963  hypothetical protein  32.43 
 
 		 335 aa  108  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>