More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0379 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0379  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
254 aa  530  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.198087  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0498  phosphate ABC transporter permease  92.52 
 
 
254 aa  498  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0469  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  70.87 
 
 
254 aa  396  1e-109  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  70.08 
 
 
255 aa  371  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1910  phosphate transporter ATP-binding protein  68.13 
 
 
256 aa  362  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.57723  normal  0.261135 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2386  phosphate transporter ATP-binding protein  68.67 
 
 
253 aa  361  8e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00455032  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  65.75 
 
 
251 aa  357  9.999999999999999e-98  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1231  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.1 
 
 
281 aa  354  7.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.758755 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  65.75 
 
 
253 aa  353  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0489  phosphate transporter ATP-binding protein  64.43 
 
 
271 aa  350  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.357305  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  67.47 
 
 
251 aa  350  2e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  65.34 
 
 
252 aa  348  4e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2056  phosphate transporter ATP-binding protein  64.66 
 
 
257 aa  347  8e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0122  phosphate transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 
271 aa  347  1e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.341225 
 
 
-
 
NC_004310  BR2141  phosphate transporter ATP-binding protein  64.66 
 
 
257 aa  347  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0486  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.1 
 
 
251 aa  346  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0350  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.1 
 
 
251 aa  345  4e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000161831 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 
251 aa  345  4e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0397  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.86 
 
 
284 aa  345  5e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0423  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  63.45 
 
 
251 aa  344  8e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  62.2 
 
 
275 aa  344  8.999999999999999e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2983  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  64.63 
 
 
253 aa  343  2e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1856  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.05 
 
 
273 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0622  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.26 
 
 
269 aa  342  2.9999999999999997e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.970932  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0171  phosphate transporter ATP-binding protein  61.26 
 
 
271 aa  341  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2660  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.26 
 
 
253 aa  341  5.999999999999999e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0181  phosphate transporter ATP-binding protein  61.26 
 
 
271 aa  341  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.353351 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1416  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.1 
 
 
251 aa  341  8e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00175163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3118  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.45 
 
 
291 aa  340  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0430987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.63 
 
 
258 aa  340  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1479  phosphate ABC transporter permease  61.39 
 
 
260 aa  340  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1541  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  64.26 
 
 
265 aa  339  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000871214  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0768  phosphate transporter ATP-binding protein  63.05 
 
 
273 aa  338  4e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0255819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0114  phosphate ABC transporter permease  63.86 
 
 
252 aa  338  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0823  phosphate transporter ATP-binding protein  61.45 
 
 
260 aa  338  7e-92  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511308 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1225  phosphate transporter ATP-binding protein  61.11 
 
 
252 aa  338  7e-92  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.315326  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3540  response regulator receiver protein  60.31 
 
 
273 aa  337  9e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0601  phosphate transporter ATP-binding protein  64.11 
 
 
248 aa  337  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.889031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3626  phosphate transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 
295 aa  337  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.926867  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.9 
 
 
276 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3752  phosphate transporter ATP-binding protein  64.61 
 
 
293 aa  336  1.9999999999999998e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.600965 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  64.66 
 
 
262 aa  336  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  64.66 
 
 
262 aa  335  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  64.66 
 
 
262 aa  334  9e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1922  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
265 aa  333  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.2 
 
 
272 aa  333  1e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2278  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  62.7 
 
 
253 aa  333  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.8 
 
 
267 aa  333  2e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000180282  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.39 
 
 
267 aa  332  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4548  phosphate transporter ATP-binding protein  61.45 
 
 
302 aa  332  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.662956  normal  0.262151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2396  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  63.16 
 
 
283 aa  332  5e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.874884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1013  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.85 
 
 
251 aa  331  6e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4327  phosphate transporter ATP-binding protein  60.24 
 
 
265 aa  331  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.172468  normal  0.997199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1487  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.35 
 
 
293 aa  331  7.000000000000001e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0256969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 
265 aa  331  9e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2601  phosphate transporter ATP-binding protein  61.04 
 
 
265 aa  331  9e-90  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1239  phosphate transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
271 aa  330  9e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0141  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 
251 aa  330  1e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2104  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.64 
 
 
252 aa  330  1e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0749  ABC phosphate transporter, ATPase subunit  60.87 
 
 
255 aa  330  1e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000330265  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  59.36 
 
 
265 aa  330  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2406  ABC phosphate transporter ATP-binding protein  61.85 
 
 
275 aa  330  1e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.36 
 
 
255 aa  330  2e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1096  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  61.75 
 
 
259 aa  329  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.53322  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.25 
 
 
251 aa  329  3e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3315  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.35 
 
 
290 aa  329  3e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0283925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1536  phosphate transporter ATP-binding protein  59.76 
 
 
264 aa  329  3e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.424595  normal  0.394597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2650  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  63.27 
 
 
285 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.567129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.56 
 
 
252 aa  328  5.0000000000000004e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0093  phosphate transporter ATP-binding protein  62.96 
 
 
284 aa  327  1.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0658  phosphate transporter ATP-binding protein  61.63 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  62.25 
 
 
260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0481  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.87 
 
 
263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.180726  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1919  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 
253 aa  327  1.0000000000000001e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.603751  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0229  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.06 
 
 
251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1074  phosphate transporter ATP-binding protein  63.37 
 
 
247 aa  326  2.0000000000000001e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.566041  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_149  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  59.84 
 
 
251 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4000  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.89 
 
 
265 aa  326  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0048  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 
275 aa  325  4.0000000000000003e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240899  normal  0.357685 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4154  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.82 
 
 
272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.914841  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0482  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  61.38 
 
 
253 aa  325  5e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.85 
 
 
252 aa  325  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.376922  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3160  phosphate transporter ATP-binding protein  63.79 
 
 
258 aa  325  6e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.01 
 
 
249 aa  324  7e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1137  phosphate transporter ATP-binding protein  60.91 
 
 
285 aa  324  9e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.326059  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2203  phosphate transporter ATP-binding protein  60.96 
 
 
260 aa  324  9e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.574176  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  63.67 
 
 
261 aa  323  1e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0539  phosphate ABC transporter permease  59.76 
 
 
272 aa  324  1e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2292  phosphate transporter ATP-binding protein  60.16 
 
 
283 aa  323  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1336  phosphate transporter ATP-binding protein  60.47 
 
 
271 aa  323  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1826  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.7 
 
 
275 aa  324  1e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2942  phosphate transporter ATP-binding protein  60.08 
 
 
271 aa  323  2e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4414  phosphate transporter ATP-binding protein  61.73 
 
 
276 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148952  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0569  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.51 
 
 
251 aa  323  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2997  phosphate transporter ATP-binding protein  60.57 
 
 
271 aa  322  3e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2441  phosphate transporter ATP-binding protein  60.39 
 
 
264 aa  322  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.593551  normal  0.0208072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1989  phosphate transporter ATP-binding protein  60.64 
 
 
266 aa  322  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4122  phosphate transporter ATP-binding protein  60.57 
 
 
271 aa  322  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004378  phosphate transport ATP-binding protein PstB  57.71 
 
 
272 aa  322  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.706998  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0701  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.45 
 
 
250 aa  322  3e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>