More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0359 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1989  glutamyl-tRNA synthetase  74.04 
 
 		 503 aa  784    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.16917  normal  0.165816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  74.19 
 
 		 503 aa  797    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  82 
 
 		 504 aa  867    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  79.4 
 
 		 502 aa  845    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  81.44 
 
 		 502 aa  868    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 502 aa  1035    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  82.93 
 
 		 502 aa  875    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  49 
 
 		 500 aa  486  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03370  putative glutamyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 511 aa  415  9.999999999999999e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.394106  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0504  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0243  glutamyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4262  glutamyl-tRNA synthetase  41.3 
 
 		 516 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.145165 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4251  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 		 502 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2027  glutamyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 		 500 aa  408  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1006  glutamyl-tRNA synthetase  41.28 
 
 		 501 aa  399  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221279  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1566  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 505 aa  396  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  42.97 
 
 		 486 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3373  glutamyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 		 517 aa  389  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0803791 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 480 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  41.16 
 
 		 494 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1516  glutamyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 501 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  41.11 
 
 		 491 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 		 477 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4891  glutamyl-tRNA synthetase  39.31 
 
 		 509 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2579  glutamyl-tRNA synthetase  41.01 
 
 		 479 aa  378  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.224415 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 487 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 479 aa  373  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  39.44 
 
 		 491 aa  373  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2139  glutamyl-tRNA synthetase  39.64 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  38.16 
 
 		 495 aa  368  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  38.18 
 
 		 495 aa  362  7.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  39.59 
 
 		 485 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  37.98 
 
 		 482 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  37.86 
 
 		 504 aa  359  8e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0730  glutamyl-tRNA synthetase  44.36 
 
 		 506 aa  358  9e-98  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00473213  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 492 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0204  glutamyl-tRNA synthetase  37.23 
 
 		 506 aa  356  5.999999999999999e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000464542  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0211  glutamyl-tRNA synthetase  38.26 
 
 		 492 aa  355  7.999999999999999e-97  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 		 490 aa  353  2.9999999999999997e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0221  glutamyl-tRNA synthetase  38.12 
 
 		 490 aa  350  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0268033  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 484 aa  350  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  39 
 
 		 484 aa  350  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  37.6 
 
 		 466 aa  349  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  38.74 
 
 		 496 aa  348  9e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 465 aa  348  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1539  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 		 480 aa  348  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0669588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  38.97 
 
 		 488 aa  347  3e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  38.78 
 
 		 467 aa  347  4e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 485 aa  346  6e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0131  glutamyl-tRNA synthetase  38.22 
 
 		 505 aa  344  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0539841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  37.8 
 
 		 485 aa  343  5e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2880  glutamyl-tRNA synthetase  37 
 
 		 493 aa  343  5e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.180535  normal  0.882448 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2381  glutamyl-tRNA synthetase  36.11 
 
 		 509 aa  342  5.999999999999999e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 504 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  37.58 
 
 		 469 aa  342  1e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2320  glutamyl-tRNA synthetase  40.59 
 
 		 507 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.687985  normal  0.453675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1878  glutamyl-tRNA synthetase  37.85 
 
 		 514 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 467 aa  340  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 464 aa  340  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 		 491 aa  340  4e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  35.76 
 
 		 467 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 469 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  37.73 
 
 		 481 aa  337  3.9999999999999995e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4662  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 489 aa  336  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274625  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  39.07 
 
 		 488 aa  336  5e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  39.27 
 
 		 469 aa  335  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  40.08 
 
 		 485 aa  335  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  37.83 
 
 		 484 aa  335  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0374  glutamyl-tRNA synthetase  34.8 
 
 		 490 aa  334  2e-90  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  37.72 
 
 		 498 aa  334  2e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1891  glutamyl-tRNA synthetase  47.75 
 
 		 493 aa  334  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000572131  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  35.88 
 
 		 463 aa  333  6e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2057  glutamyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 		 509 aa  332  7.000000000000001e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  37.4 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1540  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 493 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  38.88 
 
 		 491 aa  332  1e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  34.69 
 
 		 468 aa  331  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1496  glutamyl-tRNA synthetase  37.47 
 
 		 503 aa  330  3e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0223173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2799  glutamyl-tRNA synthetase  36.49 
 
 		 485 aa  330  3e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.285218 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1211  glutamyl-tRNA synthetase  36.45 
 
 		 494 aa  330  4e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1695  glutamyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 506 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1977  glutamyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 		 493 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182954  normal  0.011128 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2166  glutamyl-tRNA synthetase  36.73 
 
 		 493 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.120776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  39.08 
 
 		 485 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49888  predicted protein  37.3 
 
 		 546 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.757825  normal  0.413505 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 		 499 aa  328  1.0000000000000001e-88  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  39.48 
 
 		 485 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1977  glutamyl-tRNA synthetase  36.53 
 
 		 493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3783  glutamyl-tRNA synthetase  36.69 
 
 		 493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.585828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>