More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0333 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0333  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  100 
 
 
299 aa  599  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.637243  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1748  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  91.97 
 
 
299 aa  543  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.291377 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0437  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  88.29 
 
 
315 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.188217 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0400  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  90.97 
 
 
299 aa  535  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0466  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  90.97 
 
 
299 aa  531  1e-150  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0435  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  89.3 
 
 
299 aa  527  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0403  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  86.96 
 
 
300 aa  514  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0844836  hitchhiker  0.0012368 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2498  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  68.46 
 
 
292 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1993  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  63.64 
 
 
300 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1100  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.96 
 
 
300 aa  384  1e-105  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0979666  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0288  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.97 
 
 
290 aa  382  1e-105  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2487  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.63 
 
 
300 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000153221  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0730  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  62.54 
 
 
291 aa  378  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000463051  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1888  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  62.29 
 
 
292 aa  378  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2548  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  63.82 
 
 
290 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.12229 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0814  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.15 
 
 
302 aa  375  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0497664  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3933  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.29 
 
 
300 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3877  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.29 
 
 
300 aa  376  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000526587  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3686  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.29 
 
 
300 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0387134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3576  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.29 
 
 
300 aa  376  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0154825  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3594  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.29 
 
 
300 aa  376  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.372712  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0600  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.21 
 
 
291 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0581  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.21 
 
 
291 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1330  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.82 
 
 
302 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.247026  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2183  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.33 
 
 
339 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1310  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.29 
 
 
300 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000061731  unclonable  1.5256899999999999e-25 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1305  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.82 
 
 
302 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0212377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3973  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.29 
 
 
300 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00161204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1376  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.29 
 
 
299 aa  375  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1465  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.03 
 
 
308 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0598  succinyl-CoA synthetase alpha chain  59.87 
 
 
294 aa  375  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0827  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  62.91 
 
 
293 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.623831 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3847  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.29 
 
 
300 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.48753e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3658  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.95 
 
 
300 aa  375  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000316664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3882  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.29 
 
 
300 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000124479  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2788  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.02 
 
 
308 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1791  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.42 
 
 
290 aa  372  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.66969  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0895  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.8 
 
 
289 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0404555  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1989  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.33 
 
 
295 aa  371  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1239  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.87 
 
 
290 aa  371  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.961959  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1556  succinate-CoA ligase (ADP-forming), alpha subunit  59.53 
 
 
294 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0772  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.8 
 
 
289 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1147  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.54 
 
 
290 aa  371  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0714  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  61.07 
 
 
291 aa  373  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000108729  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0966  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  62.38 
 
 
294 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004109  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] alpha chain  61.41 
 
 
290 aa  371  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2626  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.38 
 
 
294 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.639809  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2180  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.08 
 
 
290 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3739  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.95 
 
 
290 aa  373  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00386146  unclonable  0.000000000321721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1221  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  61.74 
 
 
290 aa  372  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0849  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.08 
 
 
290 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3874  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  64.43 
 
 
293 aa  374  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0862  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.8 
 
 
289 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0472557 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0798  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.8 
 
 
289 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0283915  normal  0.188512 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01878  Succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.07 
 
 
290 aa  371  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1158  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.41 
 
 
290 aa  372  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4185  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.41 
 
 
294 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.2 
 
 
290 aa  368  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.531627  hitchhiker  0.00241286 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2266  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.41 
 
 
290 aa  369  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1933  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  61.41 
 
 
290 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2203  succinyl-CoA synthase, alpha subunit  61.74 
 
 
293 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0078  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.05 
 
 
294 aa  368  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.735177 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2013  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.08 
 
 
293 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.143561  normal  0.801568 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2819  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.29 
 
 
296 aa  369  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0833  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  62.46 
 
 
289 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0260305  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1839  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.12 
 
 
290 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00249209  normal  0.0388751 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1373  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  59.93 
 
 
293 aa  370  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2882  succinyl-CoA ligase [ADP-forming] subunit alpha  61.59 
 
 
293 aa  368  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01358  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.41 
 
 
290 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2911  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  59.87 
 
 
290 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.861372  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1658  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.41 
 
 
290 aa  368  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0294249  normal  0.471073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3250  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.95 
 
 
290 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0118943  unclonable  0.0000183638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3723  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.33 
 
 
329 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.793133  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0619  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  63.21 
 
 
293 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000506874  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1802  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.74 
 
 
290 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.155061  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1670  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.74 
 
 
290 aa  368  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2505  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.12 
 
 
290 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00526313  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2796  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.08 
 
 
290 aa  369  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.623771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1669  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.41 
 
 
294 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.212959  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3756  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.41 
 
 
294 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2512  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.12 
 
 
290 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.498228  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3508  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.41 
 
 
294 aa  367  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.214073  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1430  succinyl-CoA synthetase alpha chain  61.74 
 
 
290 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204322  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3097  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  60.87 
 
 
290 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2625  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.12 
 
 
290 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000598296  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0776  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.28 
 
 
289 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2907  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.28 
 
 
289 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0106  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  61.2 
 
 
291 aa  366  1e-100  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0270  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  61.54 
 
 
291 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2811  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.74 
 
 
290 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2499  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.07 
 
 
295 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.285546  normal  0.123009 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2102  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  61.41 
 
 
290 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.174971  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00677  hypothetical protein  61.28 
 
 
289 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1840  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  62.08 
 
 
290 aa  367  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00135274  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0821  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.28 
 
 
289 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1702  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.54 
 
 
293 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.358906 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1713  succinyl-CoA synthetase (ADP-forming) alpha subunit  61.41 
 
 
290 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0092181  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0648  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.28 
 
 
289 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2249  succinyl-CoA synthetase, alpha subunit  60.4 
 
 
290 aa  366  1e-100  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2927  succinyl-CoA synthetase subunit alpha  61.28 
 
 
289 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>