More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0286 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 384 aa  794    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  52.6 
 
 		 389 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0358  glycosyl transferase, group 1  30.55 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.348726  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  31.05 
 
 		 378 aa  206  4e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 		 387 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  34.44 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  34.44 
 
 		 375 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  32.11 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 370 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  32.99 
 
 		 381 aa  162  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  34.62 
 
 		 375 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 371 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2957  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 395 aa  159  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  33.89 
 
 		 435 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  32.12 
 
 		 434 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  35.04 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  35.04 
 
 		 346 aa  158  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  35.07 
 
 		 382 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0744  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 384 aa  156  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.348162  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 		 377 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  28.18 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3275  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 		 380 aa  152  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  36.04 
 
 		 394 aa  150  3e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0239  mannosyltransferase  33.09 
 
 		 351 aa  150  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.205695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6238  glycosyltransferase WbpY  33.67 
 
 		 375 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 		 408 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3357  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0347  glycosyl transferase, group 1  35 
 
 		 340 aa  149  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.302336 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  35.23 
 
 		 380 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  32.79 
 
 		 395 aa  146  5e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  33.11 
 
 		 430 aa  147  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  30.91 
 
 		 400 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  32.74 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71920  glycosyltransferase WbpY  33.9 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1410  glycosyl transferase group 1  33.1 
 
 		 381 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.27124 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  34.66 
 
 		 373 aa  144  2e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  33.22 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  27.71 
 
 		 360 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 366 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  31.07 
 
 		 383 aa  143  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 393 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 385 aa  142  9e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  33.09 
 
 		 374 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  31.48 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  32.38 
 
 		 381 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1579  glycosyl transferase group 1  34.94 
 
 		 394 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  36.98 
 
 		 366 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  29.88 
 
 		 374 aa  139  1e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 384 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4232  glycosyl transferase, group 1  31.02 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000972759 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 		 370 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1962  mannosyltransferase  28.61 
 
 		 859 aa  136  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000841107  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1896  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 860 aa  136  8e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00121907  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  32.96 
 
 		 1028 aa  135  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  32.1 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.38 
 
 		 381 aa  133  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  32.44 
 
 		 397 aa  133  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  31.21 
 
 		 357 aa  133  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 371 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  31.62 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5687  glycosyl transferase, group 1  30.74 
 
 		 376 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.519018  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0758  glycosyl transferase, group 1  33.06 
 
 		 1241 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  31.13 
 
 		 381 aa  130  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  29.83 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.91 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1229  putative glycosyltransferase  31.73 
 
 		 1219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.197488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  32.49 
 
 		 535 aa  126  5e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 361 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 374 aa  126  6e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  30.18 
 
 		 420 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  29.67 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  30.07 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0461  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 		 390 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.208871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 372 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5863  glycosyl transferase group 1  29.64 
 
 		 444 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2579  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 609 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  32.71 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2967  glycosyl transferase, group 1  30.17 
 
 		 1915 aa  124  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1496  glycosyl transferase, group 1  32.59 
 
 		 364 aa  124  4e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.476221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2862  glycosyl transferase group 1  32.25 
 
 		 343 aa  123  5e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0448  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 		 364 aa  123  7e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.717217 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  31.2 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0235  glycosyl transferase group 1  32.06 
 
 		 373 aa  122  9e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.118803 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0769  glycosyl transferase group 1  30.88 
 
 		 1241 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 376 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2582  glycosyl transferase group 1  29.76 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.411312 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  31.21 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  26.93 
 
 		 393 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0738  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 1261 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0799  glycosyl transferase group 1  28.02 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  29.96 
 
 		 364 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>