253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0238 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  100 
 
 		 922 aa  1905    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  71.35 
 
 		 932 aa  1377    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  85.46 
 
 		 916 aa  1619    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2281  putative DNA helicase  38.36 
 
 		 928 aa  554  1e-156  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  32.37 
 
 		 925 aa  476  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1133  superfamily I DNA/RNA helicase  35.33 
 
 		 914 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1455  hypothetical protein  35.35 
 
 		 758 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0774  ATP-binding protein  33.93 
 
 		 904 aa  363  9e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00601607  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2871  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.64 
 
 		 1203 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.11 
 
 		 1196 aa  118  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3383  superfamily I DNA/RNA helicase  25.37 
 
 		 903 aa  115  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352999 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  29.17 
 
 		 629 aa  104  9e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  27.89 
 
 		 1002 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3247  superfamily I DNA/RNA helicase  31.4 
 
 		 1132 aa  101  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000352182  normal  0.59992 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  26.73 
 
 		 466 aa  96.3  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0622  hypothetical protein  23.86 
 
 		 905 aa  95.1  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3416  hypothetical protein  22.87 
 
 		 905 aa  95.1  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.484184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0536  hypothetical protein  22.87 
 
 		 905 aa  95.1  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  25.77 
 
 		 633 aa  95.1  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0649  hypothetical protein  23.61 
 
 		 905 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  29.03 
 
 		 902 aa  93.2  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3742  hypothetical protein  22.8 
 
 		 905 aa  93.2  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  27.68 
 
 		 622 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  28.36 
 
 		 619 aa  92.4  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  27.37 
 
 		 606 aa  92.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1672  superfamily I DNA/RNA helicase  26.92 
 
 		 946 aa  91.3  7e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  27.43 
 
 		 622 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  27.34 
 
 		 633 aa  90.5  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  28.67 
 
 		 934 aa  89.4  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  26.18 
 
 		 1999 aa  89.4  3e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5347  DNA topoisomerase  28.27 
 
 		 1335 aa  89  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  24.14 
 
 		 754 aa  88.2  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  25 
 
 		 633 aa  87.8  8e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  26.22 
 
 		 650 aa  86.3  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  27.22 
 
 		 716 aa  86.7  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4019  hypothetical protein  25.61 
 
 		 907 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3259  hypothetical protein  25.38 
 
 		 900 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  29.26 
 
 		 651 aa  84.3  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  29.08 
 
 		 901 aa  84.3  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  26.22 
 
 		 650 aa  84  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  25.78 
 
 		 633 aa  84.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  26.39 
 
 		 609 aa  84.3  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22960  hypothetical protein  29.69 
 
 		 1062 aa  82.8  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.238472  normal  0.0614628 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1250  hypothetical protein  26.82 
 
 		 906 aa  82.4  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  27.15 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2845  DNA helicase, putative  27.37 
 
 		 1523 aa  80.9  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.914274 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5558  superfamily I DNA/RNA helicase  31.7 
 
 		 958 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1356  RAP domain-containing protein  28.04 
 
 		 1121 aa  80.5  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3060  hypothetical protein  25.82 
 
 		 908 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  27.91 
 
 		 1077 aa  79.7  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  24.33 
 
 		 643 aa  80.1  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  28.09 
 
 		 902 aa  79  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  26.37 
 
 		 986 aa  79.3  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  27.2 
 
 		 1196 aa  78.6  0.0000000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3080  putative DNA helicase  23.77 
 
 		 1983 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0715277 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44767  predicted protein  29.33 
 
 		 1557 aa  78.2  0.0000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3203  superfamily I DNA/RNA helicase  25.2 
 
 		 2123 aa  77.4  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1306  DNA helicase  27.3 
 
 		 1410 aa  76.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0834  hypothetical protein  26.98 
 
 		 1474 aa  77  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.551019  hitchhiker  0.0000399315 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  26.85 
 
 		 611 aa  76.3  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5224  DNA helicase related protein  26.14 
 
 		 1056 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0661737  normal  0.788019 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1991  superfamily I DNA/RNA helicase  30.35 
 
 		 1387 aa  76.3  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.05 
 
 		 752 aa  75.9  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  28.05 
 
 		 1157 aa  75.5  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  26.34 
 
 		 1247 aa  75.1  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  27.19 
 
 		 797 aa  74.7  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4746  superfamily I DNA helicase  27.59 
 
 		 1171 aa  74.7  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.140962 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  27.18 
 
 		 1620 aa  73.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  23.62 
 
 		 585 aa  73.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0250  hypothetical protein  25.69 
 
 		 1350 aa  74.3  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1349  hypothetical protein  34.52 
 
 		 1822 aa  73.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4517  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  23.66 
 
 		 1986 aa  73.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0117  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  27.34 
 
 		 1324 aa  73.2  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0229984  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  26.99 
 
 		 795 aa  72.8  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  24.17 
 
 		 1585 aa  72.4  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  24.17 
 
 		 1585 aa  72  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  24.27 
 
 		 659 aa  72  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1254  DNA helicase related protein  26.18 
 
 		 1094 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  25.87 
 
 		 1099 aa  72.4  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  26.09 
 
 		 655 aa  71.6  0.00000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0277  superfamily I DNA helicase  27.46 
 
 		 1296 aa  71.2  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24040  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1823 aa  71.6  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.80248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1107  hypothetical protein  25.74 
 
 		 1121 aa  71.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11277  hypothetical protein  26.64 
 
 		 1139 aa  71.2  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.72071 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  25.26 
 
 		 1151 aa  70.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2725  protein of unknown function DUF559  25.27 
 
 		 1489 aa  70.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.602171 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  24.66 
 
 		 464 aa  70.1  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4673  putative DNA helicase  23.79 
 
 		 1980 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.736151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1535  ATPase  26.74 
 
 		 1280 aa  70.1  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4423  hypothetical protein  23.14 
 
 		 2016 aa  70.1  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0893  phospholipase D/transphosphatidylase  26.6 
 
 		 975 aa  69.3  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00370965 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1770  WGR  35.03 
 
 		 1838 aa  68.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  27.94 
 
 		 1653 aa  68.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  28.15 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  28.15 
 
 		 553 aa  68.9  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1440  RAP domain protein  26.09 
 
 		 1081 aa  68.6  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.112962  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1889  hypothetical protein  24.42 
 
 		 1092 aa  68.6  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  27.56 
 
 		 1090 aa  68.2  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5757  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  30.53 
 
 		 1363 aa  67.8  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  26.76 
 
 		 1189 aa  68.2  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>