More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0176 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0176  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1429  response regulator receiver protein  58.68 
 
 		 122 aa  150  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.275463 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  105  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0589  response regulator receiver modulated serine phosphatase  41.46 
 
 		 371 aa  101  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.420228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3274  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.2 
 
 		 383 aa  100  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 239 aa  100  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  41.94 
 
 		 239 aa  100  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0975  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 383 aa  100  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  43.9 
 
 		 457 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.97 
 
 		 231 aa  99.8  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.06 
 
 		 237 aa  99.8  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 240 aa  99.8  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1504  two component transcriptional regulator  45.9 
 
 		 231 aa  99.4  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263867  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0695  response regulator receiver  41.94 
 
 		 170 aa  99.4  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.412637  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3737  two component transcriptional regulator  45.08 
 
 		 231 aa  98.2  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0567  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.63 
 
 		 225 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.463355  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  42.24 
 
 		 1334 aa  98.6  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1955  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 236 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.295041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  38.71 
 
 		 272 aa  97.8  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1701  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 236 aa  97.4  6e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.38 
 
 		 242 aa  97.1  7e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  41.53 
 
 		 1366 aa  97.1  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.17 
 
 		 238 aa  96.7  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 236 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  44.92 
 
 		 457 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 243 aa  95.5  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  39.52 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2219  response regulator  41.8 
 
 		 123 aa  95.1  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.33 
 
 		 224 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 229 aa  94.7  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.97 
 
 		 236 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 229 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 239 aa  95.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1997  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 		 234 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000742772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 236 aa  94.7  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  40.34 
 
 		 663 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  40.34 
 
 		 1311 aa  94.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 231 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2124  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 122 aa  94.4  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.453448  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.46 
 
 		 231 aa  94.4  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  38.39 
 
 		 1299 aa  94  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  42.5 
 
 		 245 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  44.07 
 
 		 457 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  41.18 
 
 		 229 aa  93.6  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.17 
 
 		 236 aa  93.6  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0044  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 224 aa  94  7e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0766  two component transcriptional regulator  48.74 
 
 		 233 aa  93.6  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.528482  normal  0.302775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1679  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  93.6  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.54 
 
 		 239 aa  93.6  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 230 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 234 aa  92.8  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.178035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.5 
 
 		 245 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  43.7 
 
 		 234 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  41.67 
 
 		 243 aa  93.2  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2792  CheA signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 1012 aa  92.8  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 236 aa  93.2  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  42.86 
 
 		 239 aa  93.2  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 236 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  40.83 
 
 		 326 aa  92.8  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 235 aa  92.8  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 2099 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0846  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 225 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 241 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0799  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 225 aa  92  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3566  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.02 
 
 		 228 aa  92  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.720677 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3970  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 121 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0244969 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  40.83 
 
 		 246 aa  92.4  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 225 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  37.1 
 
 		 236 aa  92  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  40.52 
 
 		 1388 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1924  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.32 
 
 		 225 aa  92  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 226 aa  91.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 236 aa  91.7  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46550  response regulator  42.86 
 
 		 267 aa  91.7  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203573  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  46.67 
 
 		 457 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1110  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.5 
 
 		 234 aa  91.7  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  39.83 
 
 		 2099 aa  91.3  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  39.64 
 
 		 128 aa  90.9  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0356  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  41.9 
 
 		 360 aa  90.9  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1005  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.8 
 
 		 227 aa  91.3  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000255449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2662  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 231 aa  90.9  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3136  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 125 aa  90.9  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  39.83 
 
 		 2301 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  44.54 
 
 		 244 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_143  DNA-binding response regulator, two-component system, OmpR family  38.71 
 
 		 256 aa  90.9  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2424  two component transcriptional regulator  36.29 
 
 		 221 aa  90.9  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245011  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  41.53 
 
 		 457 aa  90.9  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  38.71 
 
 		 231 aa  90.5  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2881  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 212 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0981  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 221 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 239 aa  90.5  7e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2749  transcription response regulator-like protein  37.1 
 
 		 221 aa  90.5  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00061025  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0161  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 129 aa  90.1  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 		 944 aa  90.5  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 232 aa  90.1  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0605  adenylate/guanylate cyclase  40.34 
 
 		 355 aa  90.1  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.657653  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2302  response regulator receiver domain-containing protein  42.34 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3165  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  38.84 
 
 		 367 aa  90.1  9e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0569095  normal  0.0154692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  39.84 
 
 		 241 aa  90.1  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>