More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0158 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0158  glycoside hydrolase family 3 domain protein  100 
 
 		 582 aa  1194    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  64.45 
 
 		 591 aa  765    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.351864  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2499  glycoside hydrolase family 3 protein  69.72 
 
 		 589 aa  781    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.964917  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.86 
 
 		 583 aa  620  1e-176  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.655452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0169  glycoside hydrolase family 3 domain protein  53.6 
 
 		 573 aa  613  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1657  beta-N-acetylglucosaminidase  53.55 
 
 		 592 aa  610  1e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0125  beta-N-acetylglucosaminidase  49.64 
 
 		 585 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.740879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0925  beta-lactamase  41.42 
 
 		 966 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4564  glycoside hydrolase family protein  34.51 
 
 		 624 aa  325  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0741611  normal  0.0567328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0629  glycosyl hydrolase  36.01 
 
 		 604 aa  310  4e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0445  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.83 
 
 		 596 aa  302  1e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4206  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.31 
 
 		 1018 aa  296  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5392  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.08 
 
 		 953 aa  286  8e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1365  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.88 
 
 		 698 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0013  b-glucosidase  32.19 
 
 		 990 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1483  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.36 
 
 		 976 aa  275  2.0000000000000002e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.430226  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4025  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.66 
 
 		 543 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00621584  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3174  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.24 
 
 		 528 aa  272  1e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.108856  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0182  glycoside hydrolase family 3 protein  33.27 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3729  glycoside hydrolase family 3 domain protein  33.02 
 
 		 558 aa  268  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4183  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.89 
 
 		 568 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.101852 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2708  beta-lactamase  31.56 
 
 		 992 aa  264  3e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11048  putative hydrolase/beta lactamase fusion protein  32.62 
 
 		 971 aa  262  1e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.199531  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4819  glycoside hydrolase family 3 protein  31.82 
 
 		 997 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0839  beta-lactamase  31.62 
 
 		 1012 aa  259  8e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35950  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  30.96 
 
 		 618 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564939  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1439  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1007 aa  258  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00938781 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1364  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.94 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.553842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2486  glycosyl hydrolase  30.5 
 
 		 552 aa  250  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1868  glycoside hydrolase family 3 domain protein  41.74 
 
 		 537 aa  249  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0011  glycosy hydrolase family protein  31.8 
 
 		 1003 aa  243  7e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.417282 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2605  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.09 
 
 		 543 aa  243  7e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.953053  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1248  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.72 
 
 		 534 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0180507 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1218  glycoside hydrolase family 3 domain protein  40.72 
 
 		 534 aa  242  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5276  glycoside hydrolase family 3 protein  38.19 
 
 		 656 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337424  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0354  Beta-glucosidase-related glycosidase-like  36.96 
 
 		 542 aa  233  9e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.862907  normal  0.927618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0273  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.49 
 
 		 580 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0839  Beta-N-acetylhexosaminidase  46.01 
 
 		 552 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.134113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1431  beta-hexosamidase A precursor  35.75 
 
 		 427 aa  221  1.9999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.982661  normal  0.138036 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  31.15 
 
 		 631 aa  220  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4196  glycoside hydrolase family 3 domain protein  36.12 
 
 		 1002 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.690171 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0085  glycoside hydrolase family 3 protein  30.45 
 
 		 541 aa  208  3e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.841393  normal  0.0151072 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0322  glycoside hydrolase family protein  36.39 
 
 		 444 aa  207  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00637507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0783  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  36.28 
 
 		 420 aa  204  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01281  Beta-glucosidase-related glycosidase  36.95 
 
 		 543 aa  198  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.742847 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1102  family 3 glycoside hydrolase domain-containing protein  37.7 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234672  normal  0.127922 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1089  glycoside hydrolase family 3 domain protein  31.22 
 
 		 426 aa  197  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000284177  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0259  putative beta-N-acetylhexosaminidase  28.26 
 
 		 845 aa  195  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0024  glycosy hydrolase family protein  29.39 
 
 		 557 aa  194  5e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1125  glycoside hydrolase family 3 protein  26.88 
 
 		 517 aa  194  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2351  putative beta-glucosidase  38.13 
 
 		 538 aa  193  8e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.805266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5683  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  37.62 
 
 		 520 aa  189  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0956393  normal  0.544245 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0340  putative beta-glucosidase  36.69 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0282  Beta-N-acetylhexosaminidase  31.69 
 
 		 511 aa  189  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0420  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  32.55 
 
 		 511 aa  189  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.500128  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0656  glycoside hydrolase family 3 domain protein  37.96 
 
 		 490 aa  187  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.335861  normal  0.754125 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26161  beta-N-acetylglucosaminidase  35.67 
 
 		 549 aa  187  6e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.407902 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1630  glycosy hydrolase family protein  31.39 
 
 		 699 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0664162  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1615  glycoside hydrolase family 3 protein  28.87 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.059462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1651  glycosy hydrolase family protein  31.19 
 
 		 699 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639122  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2668  beta-N-acetylglucosaminidase  31.26 
 
 		 699 aa  183  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0940724  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4142  glycoside hydrolase family 3 domain protein  28.48 
 
 		 598 aa  183  8.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2191  Beta-N-acetylhexosaminidase  36.81 
 
 		 484 aa  183  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4162  glycoside hydrolase family protein  31.73 
 
 		 633 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1807  YbbD  31.19 
 
 		 699 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.834828  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4399  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.45 
 
 		 365 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4420  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.45 
 
 		 365 aa  180  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4264  glycoside hydrolase family protein  34.17 
 
 		 365 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79669  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1600  beta-hexosamidase A  25.52 
 
 		 586 aa  177  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.592664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2061  Beta-glucosidase-related glycosidase-like protein  33.97 
 
 		 503 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1768  glycoside hydrolase family 3 protein  41.06 
 
 		 498 aa  177  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1755  glycoside hydrolase family 3 protein  39.48 
 
 		 499 aa  176  9e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.438991  normal  0.0371464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7718  glycoside hydrolase family 3 domain protein  32.83 
 
 		 594 aa  176  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1931  glycoside hydrolase family 3 domain-containing protein  41.78 
 
 		 490 aa  176  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1993  glycoside hydrolase family protein  33.81 
 
 		 386 aa  175  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.954012  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0484  glycoside hydrolase family 3 protein  29.25 
 
 		 528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.299278  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0949  putative beta-hexosaminidase  30.64 
 
 		 688 aa  173  9e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1531  glycoside hydrolase family 3 protein  28.71 
 
 		 478 aa  172  2e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000631966  unclonable  5.75811e-19 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4419  glycoside hydrolase family 3 protein  33.8 
 
 		 365 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.601049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0791  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase family  25.72 
 
 		 759 aa  171  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1311  Beta-N-acetylhexosaminidase  25.37 
 
 		 573 aa  168  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0705  glycosy hydrolase family protein  25.04 
 
 		 596 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0807  glycoside hydrolase family 3 protein  28.44 
 
 		 554 aa  166  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3384  glycoside hydrolase family 3 protein  30.07 
 
 		 575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2780  glycoside hydrolase family protein  28.81 
 
 		 562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.330179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2118  glycoside hydrolase family 3 protein  29.06 
 
 		 537 aa  164  5.0000000000000005e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.215646  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4609  beta-hexosaminidase  27.69 
 
 		 637 aa  163  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1481  beta-N-acetylhexosaminidase  36.57 
 
 		 544 aa  160  5e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.152176  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0505  gluconate kinase  25.39 
 
 		 779 aa  160  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4486  glycoside hydrolase family 3 protein  39.82 
 
 		 468 aa  159  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102459  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0638  putative beta-glucosidase  33.87 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00229499  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2440  Beta-N-acetylhexosaminidase  32.77 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01861  beta-N-acetylglucosaminidase  35.82 
 
 		 544 aa  157  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2183  Beta-N-acetylhexosaminidase  34.52 
 
 		 504 aa  157  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0769  putative hydrolase glycosidase protein  28.09 
 
 		 734 aa  156  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.527558  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3178  glycoside hydrolase family 3 domain protein  34.87 
 
 		 387 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.752007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2600  Beta-N-acetylhexosaminidase  35.23 
 
 		 575 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000121893 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22490  beta-glucosidase-like glycosyl hydrolase  31.64 
 
 		 412 aa  154  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.796827 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3626  glycoside hydrolase family 3 protein  34.63 
 
 		 575 aa  154  5e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.124243  hitchhiker  0.0000631945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4847  glycoside hydrolase family protein  32.07 
 
 		 361 aa  153  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139059  normal  0.0302245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>