More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0146 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0146  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 258 aa  531  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00325986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2513  exodeoxyribonuclease III Xth  66.4 
 
 		 256 aa  363  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120216  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0157  exodeoxyribonuclease III Xth  63.78 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00989742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0113  AP endonuclease  59.52 
 
 		 267 aa  340  1e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0161  exodeoxyribonuclease III Xth  61.9 
 
 		 256 aa  326  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.011362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4139  exodeoxyribonuclease III Xth  41.67 
 
 		 248 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000428819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0459  exodeoxyribonuclease III Xth  40.16 
 
 		 265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0460  exodeoxyribonuclease III Xth  40.16 
 
 		 264 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0431  exodeoxyribonuclease III  40.87 
 
 		 262 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  37.6 
 
 		 336 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  36.61 
 
 		 255 aa  165  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  36.61 
 
 		 253 aa  165  8e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  36.72 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  35.8 
 
 		 257 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  36.82 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  35.32 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  35.94 
 
 		 252 aa  159  5e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  34.32 
 
 		 268 aa  156  3e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  35.94 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  34.88 
 
 		 252 aa  155  8e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  35.52 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  36.43 
 
 		 255 aa  153  2e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  34.75 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  34.75 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  34.36 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  35.25 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  36.05 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  34.88 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  36.78 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  34.98 
 
 		 259 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.55 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  33.98 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  35.19 
 
 		 269 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  36.78 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  33.08 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  33.08 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  33.08 
 
 		 252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  33.08 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  35.66 
 
 		 256 aa  145  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  34.11 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  32.69 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  33.07 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  33.2 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.76 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1647  exodeoxyribonuclease III Xth  34.51 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  32.17 
 
 		 253 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  34.12 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  35.69 
 
 		 249 aa  143  3e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  33.73 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  31.1 
 
 		 250 aa  142  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 252 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  35.32 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  34.5 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0441  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.46 
 
 		 264 aa  142  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  32.82 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3929  exodeoxyribonuclease III  34.75 
 
 		 263 aa  141  9e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0194  AP endonuclease  32.42 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  32.81 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  34.24 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0107  exodeoxyribonuclease III Xth  36.96 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.976505  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  34.34 
 
 		 265 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0227  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0233  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  32.46 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  32.46 
 
 		 262 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  33.85 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1311  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  33.2 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  33.98 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5537  exodeoxyribonuclease III Xth  35.23 
 
 		 308 aa  136  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2558  exodeoxyribonuclease III  30.23 
 
 		 262 aa  136  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0149  exodeoxyribonuclease III (xth)  32.3 
 
 		 258 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0120  exodeoxyribonuclease III Xth  30.93 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  35.27 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  33.85 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.33 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0224  exodeoxyribonuclease III  32.28 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.465844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3424  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.903718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0685  exodeoxyribonuclease III Xth  33.46 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  34.87 
 
 		 265 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  32.95 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  33.07 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1993  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.59 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0563751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  33.59 
 
 		 267 aa  133  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.16 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  34.11 
 
 		 271 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  34.5 
 
 		 258 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1434  exodeoxyribonuclease III Xth  33.98 
 
 		 248 aa  131  9e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0110  exodeoxyribonuclease III Xth  33.09 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0939885 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  34.08 
 
 		 265 aa  130  1.0000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2085  exonuclease III  32.61 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  34.11 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>