15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0082 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0082  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0981186  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0074  hypothetical protein  74.88 
 
 
203 aa  332  2e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2683  hypothetical protein  76.85 
 
 
203 aa  330  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0077  hypothetical protein  68.97 
 
 
203 aa  315  2e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0118  hypothetical protein  67 
 
 
203 aa  299  2e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0011  hypothetical protein  61.03 
 
 
212 aa  258  4e-68  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.986898  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0095  hypothetical protein  51.52 
 
 
200 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000118998  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2352  hypothetical protein  36.04 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0239  hypothetical protein  32.84 
 
 
207 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0273  hypothetical protein  30.77 
 
 
207 aa  105  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2726  hypothetical protein  32.5 
 
 
207 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2003  hypothetical protein  32.49 
 
 
200 aa  99.4  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0120  hypothetical protein  29.95 
 
 
210 aa  97.8  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0187  hypothetical protein  31.44 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2738  hypothetical protein  31.44 
 
 
207 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>