71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0074 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0074  amino acid-binding ACT domain protein  100 
 
 		 142 aa  286  8e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0069  amino acid-binding ACT domain protein  85.21 
 
 		 142 aa  259  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1971  amino acid-binding ACT domain-containing protein  81.69 
 
 		 142 aa  244  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0065  hypothetical protein  68.31 
 
 		 142 aa  204  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0860  amino acid-binding ACT domain-containing protein  53.57 
 
 		 141 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0495792  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1743  amino acid-binding ACT domain-containing protein  53.57 
 
 		 141 aa  157  3e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.237603 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0168  amino acid-binding ACT domain-containing protein  52.86 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.25479  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1591  amino acid-binding ACT domain-containing protein  52.86 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1503  amino acid-binding ACT domain protein  52.08 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0616  ACT domain-containing protein  47.55 
 
 		 143 aa  143  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.896722  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0670  amino acid-binding ACT domain protein  47.89 
 
 		 143 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0514  ACT domain-containing protein  49.65 
 
 		 143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3510  amino acid-binding ACT domain protein  46.85 
 
 		 143 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0260882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0796  amino acid-binding ACT domain protein  46.15 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0167  amino acid-binding ACT domain protein  43.36 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1138  amino acid-binding ACT domain protein  44.76 
 
 		 143 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000787959  normal  0.731263 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1682  amino acid-binding ACT domain-containing protein  44.76 
 
 		 143 aa  128  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1522  amino acid-binding ACT domain-containing protein  46.1 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0251264 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2883  amino acid-binding ACT domain-containing protein  43.36 
 
 		 143 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1120  amino acid-binding ACT domain protein  47.83 
 
 		 143 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.298875  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3082  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.25 
 
 		 143 aa  123  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2322  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.96 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0447  amino acid-binding ACT domain protein  45.07 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.266025 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2088  ACT domain-containing protein  43.66 
 
 		 143 aa  120  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.835718  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1670  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.36 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1859  amino acid-binding ACT domain protein  41.67 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00254903  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2132  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.67 
 
 		 143 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0184772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1575  amino acid-binding ACT domain-containing protein  41.96 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.114486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1736  ACT domain-containing protein  40.97 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567956  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1824  ACT domain-containing protein  39.58 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0816  amino acid-binding ACT  40.71 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.842739  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2191  amino acid-binding ACT domain protein  39.58 
 
 		 143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2036  amino acid-binding ACT domain protein  39.58 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000214069 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1570  ACT domain-containing protein  40.56 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3086  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.52 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1579  amino acid-binding ACT domain protein  35.46 
 
 		 142 aa  106  9.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.210637 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0261  amino acid-binding ACT domain-containing protein  35.46 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0159897  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13420  ACT domain-containing protein  41.84 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0053  amino acid-binding ACT domain protein  41.26 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0041  amino acid-binding ACT domain protein  41.26 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0210  acetolactate synthase small subunit  38.81 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.846842 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1623  amino acid-binding ACT  36.96 
 
 		 144 aa  104  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.856261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0748  amino acid-binding ACT domain-containing protein  40.74 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00491505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0708  amino acid-binding ACT domain-containing protein  42.06 
 
 		 144 aa  101  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.464159  normal  0.126423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0040  amino acid-binding ACT domain-containing protein  38.03 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0832  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.13 
 
 		 147 aa  99.4  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0037  ACT domain-containing protein  40.56 
 
 		 147 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2122  amino acid-binding ACT domain protein  40 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0208  amino acid-binding (ACT) protein  36.88 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1455  hypothetical protein  36.5 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.323054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4321  ACT domain-containing protein  47.22 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0071  amino acid-binding ACT domain-containing protein  39.26 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1014  ACT domain-containing protein  43.27 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2859  amino acid-binding ACT domain protein  37.14 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0901  ACT domain-containing protein  38.69 
 
 		 129 aa  88.2  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_885  ACT domain protein  42.31 
 
 		 129 aa  87.4  7e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1421  hypothetical protein  35 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06230  ACT domain-containing protein  34.04 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.58032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1319  ACT domain-containing protein  30.56 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1584  amino acid-binding ACT domain protein  32.37 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0505283 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0909  amino acid-binding ACT domain-containing protein  28.06 
 
 		 153 aa  65.5  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.394001  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2396  amino acid-binding ACT domain-containing protein  34.91 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2514  amino acid-binding ACT domain protein  30.84 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.583261  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0720  putative acetolactate synthase small regulatory subunit  27.54 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726001 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1433  ACT domain-containing protein  29.91 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.50436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2427  amino acid-binding ACT domain protein  29.91 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.662665  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2879  amino acid-binding ACT domain-containing protein  29.03 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.555565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3113  amino acid-binding ACT domain protein  32.67 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0873  amino acid-binding ACT  29.7 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1570  ACT domain protein  28.28 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.409737  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1107  acetolactate synthase small subunit  21.88 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>