More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0073 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 397 aa  812    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1972  GntR family transcriptional regulator  75.06 
 
 		 397 aa  635    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  71.79 
 
 		 397 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  73.99 
 
 		 397 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  38.78 
 
 		 417 aa  280  5e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  38.46 
 
 		 406 aa  279  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  37.47 
 
 		 439 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 396 aa  276  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  37.95 
 
 		 396 aa  275  8e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2567  putative transcriptional regulator, GntR family  37.28 
 
 		 397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  35.14 
 
 		 446 aa  273  3e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  38.4 
 
 		 438 aa  272  7e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  38.97 
 
 		 404 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  35.43 
 
 		 463 aa  270  2.9999999999999997e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 394 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  36.59 
 
 		 441 aa  269  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  37.69 
 
 		 402 aa  268  1e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  35.19 
 
 		 436 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  36.52 
 
 		 446 aa  265  8e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 403 aa  265  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  35.52 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  34.75 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03480  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  36.2 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.147628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2572  putative transcriptional regulator, GntR family  37.72 
 
 		 395 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 450 aa  263  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  36.04 
 
 		 430 aa  262  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2076  GntR family transcriptional regulator  38.23 
 
 		 395 aa  262  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  36.57 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  34.92 
 
 		 436 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 440 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2829  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.286553  normal  0.182864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  37.18 
 
 		 394 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  36.48 
 
 		 393 aa  259  7e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4240  aminotransferase, class I and II  37.57 
 
 		 406 aa  258  1e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  35.59 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1563  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 398 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.850295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0851  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0242467  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 383 aa  258  2e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0951  aminotransferase family protein  36.32 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  36.48 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 393 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  34.43 
 
 		 396 aa  256  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2606  aminotransferase, class I and II  36.71 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  36.48 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  36.48 
 
 		 393 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 393 aa  256  6e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0229  putative AMINNO transferase protein  37.81 
 
 		 402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 611 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 395 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3003  putative transcriptional regulator, GntR family  35.95 
 
 		 394 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 441 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 416 aa  253  5.000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0401  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 406 aa  253  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0793371 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3169  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 414 aa  253  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2516  putative transcriptional regulator, GntR family  35.61 
 
 		 400 aa  253  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0871  putative GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 405 aa  253  6e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.707228 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 395 aa  252  7e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  35.95 
 
 		 398 aa  252  7e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  34.01 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3539  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 407 aa  252  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00400893 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2746  aminotransferase, class I and II  37.44 
 
 		 397 aa  252  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.563267 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0863  aminotransferase family protein  36.32 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1163  aminotransferase, class I/II  36.32 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.488636  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1952  aminotransferase family protein  36.32 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1001  aminotransferase family protein  36.32 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 397 aa  250  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1314  aminotransferase family protein  36.32 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693851  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0285  aminotransferase family protein  36.32 
 
 		 393 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3845  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3118  putative transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.593788  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 393 aa  249  6e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0708  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 400 aa  249  7e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.471024  normal  0.529403 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4323  GntR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.240929 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  35.01 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 		 394 aa  246  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3729  aminotransferase, class I and II  34.31 
 
 		 420 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  35.62 
 
 		 398 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1762  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 396 aa  246  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 409 aa  244  9.999999999999999e-64  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0103  putative transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 396 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3288  putative transcriptional regulator, GntR family  33.93 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000848876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 432 aa  243  6e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0362  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 426 aa  242  7.999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 401 aa  241  1e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  31.83 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0186  valine-pyruvate aminotransferase  36.13 
 
 		 402 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.39776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 435 aa  241  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  33.42 
 
 		 394 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5490  putative transcriptional regulator, GntR family  34.85 
 
 		 377 aa  240  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.110442  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0902  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 399 aa  240  2.9999999999999997e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.215501  normal  0.458926 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2588  aminotransferase, class I and II  34.99 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000724339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>