More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0069 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 331 aa  671    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  83.69 
 
 		 328 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  68.59 
 
 		 346 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  62.75 
 
 		 332 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  59.51 
 
 		 342 aa  352  7e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  43.66 
 
 		 366 aa  262  6e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  42.37 
 
 		 366 aa  246  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  43.52 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  42.37 
 
 		 366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  40.17 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  40.11 
 
 		 375 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  42.9 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  39.01 
 
 		 368 aa  226  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  38.21 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  38.05 
 
 		 334 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  42.3 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  38.27 
 
 		 369 aa  222  9e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  40.43 
 
 		 375 aa  221  9e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  40.12 
 
 		 347 aa  220  3e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2289  secretion protein HlyD family protein  47.6 
 
 		 348 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0702685  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  38.9 
 
 		 370 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  40.81 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2377  secretion protein HlyD family protein  47.26 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1574  secretion protein HlyD  47.28 
 
 		 348 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  39.1 
 
 		 349 aa  206  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  36.99 
 
 		 347 aa  205  7e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  36.59 
 
 		 410 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  36.95 
 
 		 355 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  35.99 
 
 		 401 aa  200  3e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2982  secretion protein HlyD family protein  35.75 
 
 		 400 aa  192  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1467  secretion protein HlyD  42.81 
 
 		 342 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0027674  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6361  secretion protein HlyD family protein  42.81 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3316  secretion protein HlyD family protein  35.34 
 
 		 423 aa  188  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.226121 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  39.12 
 
 		 348 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2433  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 395 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0223582 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  37.95 
 
 		 354 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  35.54 
 
 		 351 aa  186  4e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  35.54 
 
 		 351 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.93 
 
 		 387 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7028  secretion protein HlyD family protein  42.47 
 
 		 342 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.146297  normal  0.512794 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4202  hypothetical protein  35.36 
 
 		 355 aa  186  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  34.34 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.93 
 
 		 387 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  34.34 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  34.34 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  35.54 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  34.34 
 
 		 352 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  37.07 
 
 		 390 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0660  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 402 aa  182  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.33 
 
 		 351 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.69 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.21 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  34.64 
 
 		 351 aa  179  4e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  36.45 
 
 		 404 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  38.85 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  32.65 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  37.77 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  34.64 
 
 		 352 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 470 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.17 
 
 		 380 aa  176  7e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  35.38 
 
 		 475 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  35.38 
 
 		 475 aa  175  9e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3017  secretion protein HlyD family protein  35.2 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.314834 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.53 
 
 		 349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  34.81 
 
 		 368 aa  173  5e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  34.51 
 
 		 383 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  36.19 
 
 		 371 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  33.84 
 
 		 364 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  34.76 
 
 		 380 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 406 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  36.05 
 
 		 390 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2735  secretion protein HlyD family protein  34.71 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.479552 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  37.66 
 
 		 383 aa  170  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  35.42 
 
 		 377 aa  170  4e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  32.64 
 
 		 413 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  34.41 
 
 		 460 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  34.41 
 
 		 460 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  36.08 
 
 		 390 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  34.43 
 
 		 358 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  36.13 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5897  multidrug resistance protein  35.71 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  37.1 
 
 		 397 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2027  secretion protein HlyD  36.54 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.294658  normal  0.169998 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  32.93 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3442  secretion protein HlyD family protein  35.83 
 
 		 421 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  34.37 
 
 		 393 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  38.71 
 
 		 380 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  34.23 
 
 		 394 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  34.94 
 
 		 391 aa  166  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68130  multidrug resistance protein  35.4 
 
 		 394 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00130699  normal  0.0310617 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1150  multidrug resistance protein A  34.9 
 
 		 331 aa  166  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2004  secretion protein HlyD family protein  29.88 
 
 		 380 aa  165  8e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  33.73 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1445  secretion protein HlyD family protein  34.87 
 
 		 444 aa  165  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6188  putative multidrug resistance protein A  33.76 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.650101  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  36.6 
 
 		 344 aa  164  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  39.35 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1725  efflux pump membrane protein  35.67 
 
 		 406 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1874  secretion protein HlyD family protein  35.82 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.982887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 413 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>