196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0059 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 314 aa  652    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  94.19 
 
 		 241 aa  474  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  41.33 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  39.26 
 
 		 237 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  39.31 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  37.21 
 
 		 239 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.82 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.82 
 
 		 233 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1119  phosphopantetheinyl transferase-like protein  39.51 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.36 
 
 		 270 aa  93.2  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.52 
 
 		 241 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  30.86 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0168  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.64 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3130  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.39 
 
 		 237 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  39.19 
 
 		 269 aa  90.5  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.74 
 
 		 238 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1671  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.19 
 
 		 236 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0558296 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0491  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.74 
 
 		 238 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.522546  normal  0.376593 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.08 
 
 		 226 aa  89.4  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2677  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.52 
 
 		 242 aa  88.6  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.22 
 
 		 236 aa  87  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.73 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.9 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2656  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.77 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.73 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1964  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.55 
 
 		 223 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.866395  normal  0.133218 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  40.32 
 
 		 209 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.69 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2578  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.06 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.88688  normal  0.62651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0013  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.14 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0201298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1144  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.43 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.61 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3119  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.42 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.535252  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  33.55 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  33.55 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.15 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.9 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.05 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  33.33 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3267  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.53 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.97 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.97 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2727  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  31.76 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.110675  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.16 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2296  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.5 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3304  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.27 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.359953  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  29.65 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2368  hypothetical protein  31.76 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.807842  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2917  hypothetical protein  31.76 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2669  hypothetical protein  31.76 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1683  hypothetical protein  31.76 
 
 		 263 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2797  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  31.18 
 
 		 949 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.02 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.8 
 
 		 243 aa  75.1  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3865  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.96 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0576953  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2003  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.9 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1400  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.9 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.45 
 
 		 280 aa  74.7  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.5 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1025  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.9 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.214204  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.55 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1312  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.9 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3182  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.9 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3055  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.9 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2291  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  31.9 
 
 		 271 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6467  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.09 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2340  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.39 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1328  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.54 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2872  4'-phosphopantetheinyl transferase Sfp  34.92 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1761  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.19 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.280617  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.89 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2045  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.33 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.8 
 
 		 266 aa  72.8  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3748  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.9 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.466303  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1805  HetI protein-like  30 
 
 		 259 aa  71.2  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.165373 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2625  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.16 
 
 		 378 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1014  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.35 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.71 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.13 
 
 		 198 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2081  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.39 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1245  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.61 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353963  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1108  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.39 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1387  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.39 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.530337  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3139  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  32.39 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7218  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.11 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  34.92 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.56 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.214486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2905  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.95 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1468  4'-phosphopantetheinyl transferase superfamily protein  32.39 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1832  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.89 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0135302  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0084  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.1 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0921  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.39 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1604  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  30.27 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7008  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.33 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00263906 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1804  hypothetical protein  30.71 
 
 		 832 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.80698  normal  0.0920937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2090  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.5 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2134  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.77 
 
 		 249 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3900  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  36.72 
 
 		 193 aa  67  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2405  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.77 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0434647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>