83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0036 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0036  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
318 aa  600  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000168122  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0121  hypothetical protein  66.04 
 
 
318 aa  361  1e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0057  protein of unknown function DUF81  62.01 
 
 
318 aa  357  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1963  hypothetical protein  62.5 
 
 
305 aa  335  5e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0378634  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2328  protein of unknown function DUF81  58.49 
 
 
318 aa  331  9e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0903899  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1842  protein of unknown function DUF81  63.67 
 
 
324 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.130141 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0412  hypothetical protein  55.21 
 
 
332 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.646305 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2118  protein of unknown function DUF81  55.36 
 
 
324 aa  276  4e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00152804  normal  0.375775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0175  protein of unknown function DUF81  57.35 
 
 
311 aa  271  7e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.537788  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1764  protein of unknown function DUF81  52.12 
 
 
325 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2264  protein of unknown function DUF81  51.86 
 
 
329 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0708049  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0811  protein of unknown function DUF81  53.62 
 
 
379 aa  257  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0941  hypothetical protein  36.27 
 
 
310 aa  166  5.9999999999999996e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.892204  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1421  hypothetical protein  36.79 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0228567 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1672  protein of unknown function DUF81  35.12 
 
 
281 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.12606  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0600  protein of unknown function DUF81  27.17 
 
 
278 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3139  protein of unknown function DUF81  30.77 
 
 
280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  24.91 
 
 
276 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0999  protein of unknown function DUF81  24.91 
 
 
286 aa  112  6e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1197  hypothetical protein  27.35 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0268  hypothetical protein  28.84 
 
 
277 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  24.8 
 
 
277 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2525  permease  25.3 
 
 
283 aa  106  6e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1910  hypothetical protein  26.84 
 
 
283 aa  105  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.199806  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0371  hypothetical protein  30.2 
 
 
271 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000183295  normal  0.680088 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0549  hypothetical protein  25.5 
 
 
284 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.50892  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3869  protein of unknown function DUF81  24.09 
 
 
277 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0185467  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1182  hypothetical protein  26.1 
 
 
283 aa  101  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.801171  normal  0.428536 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1843  permease  25 
 
 
283 aa  100  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0943  hypothetical protein  25.1 
 
 
332 aa  99.4  8e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.829697  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0349  hypothetical protein  41.07 
 
 
176 aa  99  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3912  hypothetical protein  25.81 
 
 
278 aa  98.2  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0103404  normal  0.04978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3310  protein of unknown function DUF81  26.27 
 
 
278 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251637  hitchhiker  0.000195256 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3785  hypothetical protein  28.68 
 
 
278 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.29044  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1253  hypothetical protein  23.81 
 
 
307 aa  90.5  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0309797  normal  0.675201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2210  protein of unknown function DUF81  24.7 
 
 
276 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000833902  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0940  hypothetical protein  23.72 
 
 
469 aa  85.5  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3317  hypothetical protein  25.32 
 
 
278 aa  83.2  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1081  hypothetical protein  24.43 
 
 
286 aa  81.6  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.217468  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1178  hypothetical protein  24.43 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271646  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4144  hypothetical protein  21.91 
 
 
283 aa  77  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  26.1 
 
 
275 aa  76.6  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  25 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1420  hypothetical protein  25.48 
 
 
283 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.521552  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  26.32 
 
 
266 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  26.32 
 
 
266 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  26.2 
 
 
266 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  26.32 
 
 
266 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  26.32 
 
 
262 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  26.32 
 
 
266 aa  62  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  25.88 
 
 
266 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  25.88 
 
 
262 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  25.33 
 
 
266 aa  58.9  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  28.84 
 
 
255 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  32.28 
 
 
139 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 
255 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0615  hypothetical protein  23.92 
 
 
250 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.117096  normal  0.438819 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  25.87 
 
 
253 aa  51.2  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  27.24 
 
 
253 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  22.01 
 
 
2798 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0852  protein of unknown function DUF81  26.17 
 
 
317 aa  50.1  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.799612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  28.46 
 
 
255 aa  50.1  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  27.55 
 
 
266 aa  49.7  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  21.93 
 
 
255 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1711  protein of unknown function DUF81  23.96 
 
 
354 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1487  hypothetical protein  22.96 
 
 
243 aa  47.8  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5314  hypothetical protein  34.31 
 
 
291 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5403  hypothetical protein  34.31 
 
 
291 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173807 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5693  hypothetical protein  34.31 
 
 
291 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  26.32 
 
 
257 aa  46.6  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  24.73 
 
 
267 aa  46.2  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  30.39 
 
 
260 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  26.83 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  23.36 
 
 
270 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  34.34 
 
 
346 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0509  hypothetical protein  22.75 
 
 
275 aa  45.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.986413  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  35.29 
 
 
269 aa  43.9  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  27.17 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4025  hypothetical protein  34.31 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.393892  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  24.73 
 
 
266 aa  42.7  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  22.8 
 
 
275 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  22.8 
 
 
275 aa  43.1  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>