More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0020 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0020  carboxyl-terminal protease  100 
 
 		 565 aa  1140    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0027  carboxyl-terminal protease  49.91 
 
 		 585 aa  522  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0975231  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0042  C-terminal processing peptidase-3  49.03 
 
 		 572 aa  521  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0021  carboxyl-terminal protease  49.05 
 
 		 563 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000380746  normal  0.822612 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0021  carboxyl-terminal protease  47.82 
 
 		 556 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000229164  hitchhiker  0.00113331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0014  peptidase S41A, C-terminal protease  45.27 
 
 		 564 aa  460  9.999999999999999e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.366239  normal  0.216554 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1991  peptidase S41A, C-terminal protease  41.61 
 
 		 582 aa  419  1e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0124  carboxyl-terminal protease  37.94 
 
 		 553 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0098  C-terminal processing peptidase-3  36.53 
 
 		 550 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00892877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1058  carboxyl-terminal protease  37.15 
 
 		 555 aa  312  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  35.66 
 
 		 550 aa  310  5e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3923  carboxyl-terminal protease  34.33 
 
 		 557 aa  296  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0829863  normal  0.226226 
 
 
-
 
NC_002950  PG1060  carboxyl-terminal protease  33.8 
 
 		 569 aa  286  5.999999999999999e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0865615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4121  carboxyl-terminal protease  35.23 
 
 		 566 aa  282  9e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.132003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0972  carboxyl-terminal protease  33.15 
 
 		 545 aa  276  5e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03110  carboxy-terminal processing protease precursor  32.02 
 
 		 540 aa  265  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0288986  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2676  carboxyl-terminal protease  36.4 
 
 		 538 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0914328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0055  C-terminal processing peptidase-3  39.89 
 
 		 463 aa  243  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  35.38 
 
 		 471 aa  234  3e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  40.26 
 
 		 439 aa  233  6e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  43.22 
 
 		 462 aa  230  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  38.99 
 
 		 444 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0381  carboxyl-terminal protease  37.74 
 
 		 441 aa  229  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  38.66 
 
 		 446 aa  228  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 		 441 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  37.54 
 
 		 522 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  37.54 
 
 		 526 aa  226  7e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  38.61 
 
 		 440 aa  226  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0091  carboxyl-terminal protease  38.12 
 
 		 445 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0132582  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  36.46 
 
 		 515 aa  225  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  35.77 
 
 		 480 aa  225  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2547  carboxyl-terminal protease  35.51 
 
 		 449 aa  225  2e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  38.44 
 
 		 513 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  38.74 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  38.74 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  38.74 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  38.74 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  38.74 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  38.74 
 
 		 524 aa  224  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  38.14 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  38.74 
 
 		 530 aa  224  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  37.98 
 
 		 428 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  35.69 
 
 		 452 aa  224  3e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1823  carboxyl-terminal protease  34.31 
 
 		 556 aa  224  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0958668  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  36.04 
 
 		 530 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  40.32 
 
 		 439 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  37.65 
 
 		 521 aa  223  6e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2514  carboxyl-terminal protease  35.48 
 
 		 506 aa  223  7e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  39.68 
 
 		 445 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  34.82 
 
 		 444 aa  223  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  39.68 
 
 		 445 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0932  S41 family peptidase  36.16 
 
 		 448 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0235658  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2591  carboxyl-terminal protease  36.16 
 
 		 448 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.837496  normal  0.635906 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  37.72 
 
 		 515 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2931  carboxyl-terminal protease  36.81 
 
 		 445 aa  221  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  37.72 
 
 		 515 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  37.72 
 
 		 515 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  37.24 
 
 		 478 aa  221  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0926  carboxyl-terminal protease  35.31 
 
 		 479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.388847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  36.47 
 
 		 472 aa  220  7e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4724  carboxyl-terminal protease  36.86 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.458117  normal  0.0374379 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  38.05 
 
 		 443 aa  219  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  34.94 
 
 		 442 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  35.58 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  37.24 
 
 		 515 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  39.3 
 
 		 432 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1837  carboxyl-terminal protease  36.22 
 
 		 424 aa  217  5e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  38.73 
 
 		 439 aa  217  5e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  38.05 
 
 		 455 aa  217  5e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2755  carboxyl-terminal protease  33.98 
 
 		 445 aa  217  5e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0444358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  36.22 
 
 		 424 aa  217  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  36.74 
 
 		 438 aa  217  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  37.43 
 
 		 440 aa  217  5.9999999999999996e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0035  carboxyl-terminal protease  37.31 
 
 		 478 aa  216  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.118794  normal  0.879403 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  38.41 
 
 		 438 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0903  carboxyl-terminal protease  36.22 
 
 		 457 aa  216  8e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0885  carboxyl-terminal protease  36.97 
 
 		 479 aa  216  8e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  34.07 
 
 		 444 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  40 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  40.32 
 
 		 439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  35.6 
 
 		 440 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3451  carboxyl-terminal protease  37.34 
 
 		 444 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.000000117328  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  36.93 
 
 		 415 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2983  carboxyl-terminal protease  35.85 
 
 		 449 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.44239  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4104  carboxyl-terminal protease  36.34 
 
 		 481 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228139  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3859  C-terminal processing peptidase-3  36.72 
 
 		 479 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  35.38 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  35.38 
 
 		 440 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  36.34 
 
 		 443 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  36.89 
 
 		 481 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  35.28 
 
 		 440 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0098  carboxyl-terminal protease  34.97 
 
 		 446 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.289255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  36.39 
 
 		 423 aa  213  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  37.03 
 
 		 462 aa  213  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  39.05 
 
 		 436 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  37.07 
 
 		 456 aa  213  9e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  39.05 
 
 		 436 aa  213  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  36.79 
 
 		 444 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  37.78 
 
 		 438 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  38.1 
 
 		 437 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>