More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_a031 on replicon NC_012040
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012040  Cla_a031  site-specific recombinase/resolvase  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0141681  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0864  multiple promoter invertase  51.79 
 
 		 206 aa  192  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3410  Resolvase domain protein  47.5 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.260918 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1950  multiple promoter invertase  53.57 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.202011  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2327  Resolvase domain  43.43 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3142  resolvase-like protein  38.5 
 
 		 203 aa  137  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0172  resolvase family site-specific recombinase  37.31 
 
 		 208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2368  Resolvase domain protein  33.16 
 
 		 223 aa  122  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  decreased coverage  0.00000000117936 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0024  cpp27  40.88 
 
 		 204 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586795  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4198  resolvase domain-containing protein  29.38 
 
 		 205 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163134 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  33.67 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  32.16 
 
 		 185 aa  96.7  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  34.9 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  34.9 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a003  site-specific recombinase/resolvase  32.69 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000421132  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  34.38 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004307  resolvase N-terminal domain protein  31.96 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.179008  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  32.64 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  29.47 
 
 		 191 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  31.09 
 
 		 217 aa  86.7  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  31.82 
 
 		 184 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  30.61 
 
 		 196 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  30.61 
 
 		 196 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  30.61 
 
 		 196 aa  85.1  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.63 
 
 		 196 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  33.11 
 
 		 194 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  31.09 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  31.63 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  31.63 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  31.63 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  31.63 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  31.97 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  31.63 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  31.63 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  31.63 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  31.63 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  31.31 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08249  site-specific recombinase  37.61 
 
 		 135 aa  82  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  31.25 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  31.25 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  31.94 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  33.78 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  31.28 
 
 		 183 aa  78.6  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  29.76 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  30.96 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  28.12 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  32.65 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  28.21 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  29.95 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  31.94 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  31.29 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0523  resolvase-like protein  30.96 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  29.17 
 
 		 193 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  29.32 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  31.44 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  31.09 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2949  Resolvase domain  28 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.587528  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  30.73 
 
 		 196 aa  72  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5450  resolvase domain-containing protein  34.67 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  29 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  30.2 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  31.66 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  29 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  30.54 
 
 		 181 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  29.32 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  31.34 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  31 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  30.41 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  32.14 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  28.43 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4357  resolvase-like protein  31.68 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  34.03 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  28.57 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2245  resolvase domain-containing protein  31.79 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0071186  normal  0.011182 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001518  resolvase  30.19 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000153211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  30.29 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  30.29 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  30.29 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  29.33 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  27.32 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  30.15 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  30.15 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  30.38 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  30.15 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  25.91 
 
 		 196 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  28.06 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  31.06 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  28.5 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  27.32 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  28.5 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  27.32 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  30.15 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  30.46 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3847  resolvase-like protein  28.21 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.388128  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  30.46 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  32.62 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  26.8 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2656  resolvase domain-containing protein  30.77 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.14772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>