204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_a027 on replicon NC_012040
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012040  Cla_a027  single-stranded DNA binding protein  100 
 
 		 136 aa  279  9e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0014  hypothetical protein  37.78 
 
 		 152 aa  98.2  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0031  single-strand binding protein family  44.14 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0139  single-strand binding protein family  40.17 
 
 		 138 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0258473  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  28.15 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000213626  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3773  single-strand binding protein  37.61 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000302253  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3685  single-stranded DNA binding protein  33.03 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  29.57 
 
 		 129 aa  53.5  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3087  single-strand binding protein  32.43 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619635  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0759  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0815  single-strand binding protein  27.86 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2977  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000497709  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2655  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 150 aa  51.2  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000211835  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2069  single-strand binding protein  33.01 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.551865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  28.18 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0283  single-strand DNA-binding protein  31.13 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0274  single-strand binding protein family  31.13 
 
 		 114 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  31.62 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0266  single-strand binding protein  28.68 
 
 		 157 aa  50.1  0.00001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.266432  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  31.43 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  28.16 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  28.16 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2199  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.987659  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0736  single-stranded DNA-binding protein  26.17 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0217627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  26.43 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1480  single-strand binding protein  32.69 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0539  single-strand binding protein  29.13 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0171971  normal  0.702054 
 
 
-
 
NC_002978  WD0774  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0644  single-strand binding protein  30.25 
 
 		 168 aa  47.4  0.00007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02950  single stranded DNA-binding protein  27.27 
 
 		 165 aa  47.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000248223  hitchhiker  6.12072e-47 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1045  hypothetical protein  25.36 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1010  hypothetical protein  25.36 
 
 		 140 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  27.19 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1236  single-stranded DNA-binding protein  26.21 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  0.132188 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  28.57 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2755  single-stranded DNA-binding protein  28.3 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  27.62 
 
 		 186 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  26.42 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  31.43 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0114  single-stranded DNA-binding protein (SSB)  29.81 
 
 		 149 aa  46.2  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  27.43 
 
 		 167 aa  45.4  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  32.08 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  28.07 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1537  single-strand binding protein  28.16 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  30.19 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2233  single-strand binding protein  30.1 
 
 		 168 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.559126 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1727  single-stranded DNA-binding protein  31.82 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00349794  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1538  single-strand binding protein  29.69 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1566  single-stranded DNA-binding protein  27.18 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.365454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  27.78 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  26.35 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1425  single-strand binding protein  27.18 
 
 		 174 aa  45.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.195653  normal  0.0267012 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  28.07 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  30.08 
 
 		 161 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000179273  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  27.93 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  29.81 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  30.84 
 
 		 182 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  29.81 
 
 		 183 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  26.21 
 
 		 176 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2502  single-stranded DNA-binding protein  30.63 
 
 		 166 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000142179  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  29.81 
 
 		 182 aa  44.3  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0566  prophage LambdaSa1, single-strand binding protein  29.51 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  30.48 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0796  single-strand binding protein  26.21 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000662422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6613  single-stranded DNA-binding protein  30.77 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  28.85 
 
 		 222 aa  43.9  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2713  single-stranded DNA-binding protein  27.36 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.55224  normal  0.595774 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  26.79 
 
 		 183 aa  43.9  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  25 
 
 		 177 aa  43.9  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 199 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1885  single-strand binding protein  26.42 
 
 		 176 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110656  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2923  single-strand binding protein  28.83 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  28.45 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3806  single-strand binding protein  30.48 
 
 		 170 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.555902 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  25 
 
 		 156 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0341  single-stranded DNA-binding protein  31.13 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 238 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0538  single-stranded DNA-binding protein  31.13 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  22.73 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 185 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0500  single-stranded DNA-binding protein  31.13 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  24.79 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4448  single-strand binding protein  25.24 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0398944  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  28.97 
 
 		 234 aa  42.7  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4276  single-strand binding protein  30.84 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  1.7148099999999997e-20  normal  0.751726 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  26.21 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  32.71 
 
 		 184 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 236 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  27.88 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>