137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_a018 on replicon NC_012040
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012040  Cla_a018  conjugal transfer protein TrbI/VirB10  100 
 
 
391 aa  796  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0038  cmgB10  58.75 
 
 
391 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0174  cmgb10  50.45 
 
 
403 aa  314  2e-84  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.224464  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0045  bacterial conjugation TrbI-like protein  44.1 
 
 
369 aa  184  2e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6332  conjugation TrbI family protein  40.84 
 
 
380 aa  183  4e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0055  type IV secretion system protein VirB10  38.7 
 
 
380 aa  182  8e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0060  type IV secretion system protein VirB10  42.93 
 
 
391 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1480  conjugation TrbI family protein  44.16 
 
 
400 aa  176  4e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.360825  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0249  Type IV secretory pathway AvhB10 protein  43.16 
 
 
381 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.77314 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3528  conjugation TrbI family protein  36.6 
 
 
378 aa  164  4e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1679  type IV secretory pathway, VirB10 component  40 
 
 
484 aa  164  4e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0864  conjugation TrbI family protein  40.38 
 
 
492 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5079  conjugation TrbI family protein  39.71 
 
 
386 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.454831  normal  0.261339 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0115  TriI protein  39.09 
 
 
398 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0684  conjugation TrbI family protein  34.45 
 
 
391 aa  159  7e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5821  conjugation TrbI family protein  37.75 
 
 
445 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4339  conjugation TrbI-like protein  39.68 
 
 
390 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0095  pilx10 protein  41.41 
 
 
401 aa  154  3e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.264804  normal  0.564962 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1144  conjugation TrbI family protein  35.42 
 
 
396 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08206  conjugal transfer protein  41.27 
 
 
397 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  0.0354612  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5002  conjugation TrbI family protein  41.8 
 
 
405 aa  151  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.480101  normal  0.925872 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5021  conjugation TrbI family protein  40.62 
 
 
450 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553821  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8219  type IV secretion system protein VirB10  37.37 
 
 
373 aa  147  4e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6153  type IV secretion system protein VirB10  36.65 
 
 
372 aa  146  8e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4370  conjugation TrbI family protein  38.42 
 
 
381 aa  143  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0025  conjugal transfer protein  38.73 
 
 
408 aa  142  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0015  conjugal transfer protein TraI  37.5 
 
 
380 aa  138  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0169  conjugation TrbI family protein  38.54 
 
 
400 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.340419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1761  putative type IV secretion system protein VirB10  39.58 
 
 
409 aa  136  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.359566  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6498  conjugation TrbI family protein  37.81 
 
 
414 aa  132  1e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0455  putative type IV secretion system protein VirB10  36.46 
 
 
402 aa  129  8e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2650  putative type IV secretion system protein VirB10  36.98 
 
 
410 aa  129  8e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.373277  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7352  conjugation TrbI family protein  35.12 
 
 
432 aa  125  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.312586 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2446  conjugation TrbI family protein  34.67 
 
 
417 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7528  conjugation TrbI family protein  34.92 
 
 
453 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0606227 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4195  conjugation TrbI family protein  34.38 
 
 
407 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.583756  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3320  conjugation TrbI family protein  33.81 
 
 
407 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4846  conjugation TrbI-like protein  33.81 
 
 
407 aa  119  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4171  conjugation TrbI-like protein  32.31 
 
 
406 aa  113  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4438  conjugation TrbI-like protein  30.56 
 
 
445 aa  113  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6398  conjugation TrbI family protein  28.8 
 
 
403 aa  111  2e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4556  conjugation TrbI family protein  31.79 
 
 
410 aa  111  2e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.451217  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0160  hypothetical protein  28.57 
 
 
363 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9812  type IV secretion protein AvhB10  31.79 
 
 
402 aa  104  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0178  hypothetical protein  28.1 
 
 
363 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3647  conjugation TrbI family protein  28.92 
 
 
459 aa  101  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0441061 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3982  conjugation TrbI family protein  29.41 
 
 
459 aa  100  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3813  conjugation TrbI-like protein  29.41 
 
 
459 aa  98.6  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.387098 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4559  conjugal transfer protein TrbI  29.1 
 
 
433 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6213  conjugation TrbI family protein  28.44 
 
 
444 aa  96.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.190231 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1667  conjugation TrbI family protein  32.38 
 
 
439 aa  90.9  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8323  conjugal transfer protein TrbI  30.69 
 
 
437 aa  90.1  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.294198  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9257  conjugal transfer protein TrbI  31.22 
 
 
437 aa  89.4  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0531878  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5386  conjugal transfer protein TrbI  31.98 
 
 
430 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0860  conjugation TrbI-like protein  31.49 
 
 
402 aa  82  1e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5492  conjugal transfer protein TrbI  27.96 
 
 
426 aa  81.6  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2091  conjugation TrbI-like protein  30.94 
 
 
402 aa  78.6  2e-13  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.561013  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4267  conjugal transfer protein TrbI  32.99 
 
 
472 aa  78.6  2e-13  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.119587  hitchhiker  0.00641799 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6509  conjugal transfer protein TrbI  32.99 
 
 
473 aa  78.2  3e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010000  Sbal195_4698  conjugation TrbI family protein  30.05 
 
 
431 aa  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS195  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6628  conjugal transfer protein TrbI  32.99 
 
 
473 aa  78.2  3e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9647  conjugal transfer protein TrbI  28.65 
 
 
445 aa  77  5e-13  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.000862164  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0006  type IV secretion system protein VirB10  29.12 
 
 
486 aa  74.7  2e-12  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.44093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2575  conjugal transfer TrbI transmembrane protein  27.6 
 
 
425 aa  74.7  3e-12  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30850  TrbI-like protein  28.65 
 
 
423 aa  74.3  4e-12  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  1.67509e-10  unclonable  5.51965e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2653  conjugation TrbI family protein  29.53 
 
 
423 aa  73.9  4e-12  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.382892  normal  0.720932 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1291  conjugation TrbI family protein  28.65 
 
 
426 aa  73.9  5e-12  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2902  conjugation TrbI family protein  28.12 
 
 
420 aa  73.6  6e-12  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.629829  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2690  conjugation TrbI family protein  28.26 
 
 
422 aa  73.6  6e-12  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00708765  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0741  type IV secretion system protein VirB10  26.17 
 
 
457 aa  73.2  7e-12  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.177823  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2359  conjugation TrbI family protein  27.6 
 
 
427 aa  72.4  1e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.412444 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2013  conjugation TrbI family protein  28.12 
 
 
427 aa  72.4  1e-11  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1325  conjugation TrbI family protein  29.02 
 
 
427 aa  71.6  2e-11  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00353837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3697  conjugation TrbI family protein  28.42 
 
 
425 aa  72  2e-11  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.299925  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7449  putative conjugal transfer protein trbI  31.89 
 
 
335 aa  71.2  3e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.838533  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0042  type IV secretion system protein VirB10  28.77 
 
 
447 aa  71.2  3e-11  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4203  conjugation TrbI family protein  29.9 
 
 
439 aa  71.2  3e-11  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.139872  normal  0.82202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1559  conjugation TrbI-like protein  27.6 
 
 
422 aa  70.5  5e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.22325  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1350  conjugation TrbI-like protein  28.12 
 
 
423 aa  70.5  5e-11  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  2.74304e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5237  conjugation TrbI-like protein  27.75 
 
 
483 aa  70.1  6e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0429  conjugation TrbI family protein  27.6 
 
 
424 aa  69.7  7e-11  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.082954  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1904  conjugation TrbI family protein  27.08 
 
 
424 aa  69.7  9e-11  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1694  n/a   
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2232  conjugal transfer protein TrbI  28.89 
 
 
466 aa  69.3  1e-10  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2833  conjugation TrbI family protein  29.23 
 
 
400 aa  69.3  1e-10  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3497  conjugation TrbI family protein  28.5 
 
 
423 aa  68.9  1e-10  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1395  conjugation TrbI family protein  32.63 
 
 
486 aa  68.9  1e-10  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1485  conjugation TrbI family protein  29.19 
 
 
402 aa  68.2  2e-10  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0003  VirB10  27.37 
 
 
378 aa  68.6  2e-10  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2343  conjugation TrbI family protein  27.46 
 
 
410 aa  68.6  2e-10  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5193  conjugation TrbI family protein  28.88 
 
 
403 aa  68.2  3e-10  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3095  conjugation TrbI family protein  28.29 
 
 
421 aa  67.8  3e-10  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6299  conjugation TrbI-like protein  27.72 
 
 
414 aa  68.2  3e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.627257  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1528  conjugation TrbI family protein  28.88 
 
 
403 aa  68.2  3e-10  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0958  conjugation TrbI family protein  27.87 
 
 
397 aa  67.4  4e-10  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3532  conjugation TrbI-like protein  27.89 
 
 
411 aa  67  5e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.404539 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3892  conjugation TrbI-like protein  25.63 
 
 
400 aa  67  6e-10  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562266  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2995  conjugation TrbI family protein  27.09 
 
 
418 aa  66.6  8e-10  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.674957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0604  conjugation TrbI family protein  27.32 
 
 
415 aa  65.9  1e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3991  conjugation TrbI family protein  26.52 
 
 
414 aa  65.9  1e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0367583  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1186  conjugation TrbI family protein  26.46 
 
 
465 aa  65.1  2e-09  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>