More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_a005 on replicon NC_012040
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012040  Cla_a005  plasmid partitioning protein  100 
 
 
222 aa  443  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00164324  n/a   
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0025  para protein  57.01 
 
 
222 aa  222  4e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00204905  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0610  hypothetical protein  50 
 
 
228 aa  206  3e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3684  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  33.79 
 
 
216 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.444567  normal 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4960  hypothetical protein  32.27 
 
 
213 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4173  cobyrinic acid ac-diamide synthase  36.41 
 
 
215 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0226442  normal  0.408806 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5389  hypothetical protein  32.27 
 
 
213 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.65 
 
 
213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000187977 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4314  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.43 
 
 
210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895864  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2401  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.57 
 
 
213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.266448  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4322  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  34.84 
 
 
213 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.243197  normal  0.444003 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6252  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  30.09 
 
 
223 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0236598  normal 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3600  ATPase involved in chromosome partitioning-like protein  31.36 
 
 
219 aa  104  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1377  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.82 
 
 
211 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1360  ParA family protein, putative  32.49 
 
 
217 aa  102  7e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0573305  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3861  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.64 
 
 
214 aa  101  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1203  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 
217 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.65 
 
 
217 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0758055  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0001  putative partition protein  30.04 
 
 
216 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6875  ATPases involved in chromosome partitioning-like protein  30.53 
 
 
223 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0021  hypothetical protein  29.22 
 
 
227 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0145504  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.22 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.73 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.839742 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0709  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.51 
 
 
217 aa  96.3  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4776  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.31 
 
 
209 aa  96.3  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.74468  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2868  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 
212 aa  95.1  8e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0223269 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0719  hypothetical protein  31.63 
 
 
213 aa  94.7  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000042547  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.18 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.746062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0522  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.15 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3077  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.77 
 
 
217 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3818  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.772437  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2336  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.85 
 
 
217 aa  92  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.759981  n/a   
 
 
-
 
NC_013733  Slin_7009  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.68 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.295052  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0759  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.7 
 
 
212 aa  91.3  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3185  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.41 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.352981  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0582  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.87 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11868  normal 
 
 
-
 
NC_010507  Mrad2831_6541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.94 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975947  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4980  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.68 
 
 
209 aa  89  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.618219  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4285  chromosome partitioning ATPase protein-like  28.9 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4014  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.92 
 
 
217 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132805 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2325  hypothetical protein  26.15 
 
 
222 aa  87  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.338387  normal  0.476496 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2799  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.84 
 
 
212 aa  87  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.392004  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1018  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.26 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.026532  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7732  putative plasmid partition protein  27.4 
 
 
220 aa  85.5  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1986  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.27 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399731  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4167  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  33.33 
 
 
212 aa  85.5  6e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2879  hypothetical protein  25.23 
 
 
222 aa  84.7  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.187633  hitchhiker  0.00000000100318 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0457  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 
212 aa  85.1  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5043  hypothetical protein  27.98 
 
 
229 aa  83.6  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000269108  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7043  hypothetical protein  27.45 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.284311  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1769  hypothetical protein  25.69 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.466472  hitchhiker  0.00507269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1526  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.55 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3524  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.4 
 
 
212 aa  82  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2341  ParA family protein  27.98 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0687  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.31 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7739  hypothetical protein  27.94 
 
 
220 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2932  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 
212 aa  81.6  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178089  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2720  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.4 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.757961  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3023  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.110709 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3433  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2605  putative partition protein  27.85 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.331091  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4248  chromosome partitioning ATPase  29.52 
 
 
222 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.173583  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3730  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.85 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2621  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.4 
 
 
212 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00296988  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1879  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.4 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1255  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 
212 aa  79  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.139665 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1289  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.94 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.09 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144706  hitchhiker  0.0000785935 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3192  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  31.29 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.164704  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0869  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.79 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5173  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0876458  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2655  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.85 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.673188  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31100  putative plasmid partitioning protein  26.94 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000139072  unclonable  1.33471e-22 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1508  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.52 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.11595  normal  0.281598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1264  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  32.88 
 
 
212 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0047  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.4 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1276  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 
220 aa  75.9  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1305  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  35.21 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.153977  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35970  ATPase, ParA type  27.85 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2330  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.88 
 
 
212 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1306  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.56 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1590  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.56 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.950784  decreased coverage  0.00512965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0005  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.45 
 
 
220 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22447  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6491  ParA protein, putative  27.4 
 
 
219 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0572  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1033  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 
276 aa  74.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0985734  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2114  ParA family protein  25.89 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0579771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3289  ParA family protein  25.89 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000336314  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1503  ParA family protein  25.89 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000197714  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2409  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  25.89 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3176  CobQ/CobB/MinD/ParA nucleotide-binding domain-containing protein  25.89 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00741579  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1422  ParA family protein  25.89 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000341933  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1143  ParA family protein  25.89 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000661225  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7011  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.77 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.179321  hitchhiker  0.00594496 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.41 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3106  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.45 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0528663  normal  0.2717 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.45 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00136484  normal  0.0483269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4543  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.45 
 
 
220 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000340311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>